Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 DRE2YKR071C 1047 nt5.19□□□□□ -1.58
DDI1P40087 COX17YLL009C 210 nt5.19□□□□□ -1.58
DDI1P40087 FOL1YNL256W 2475 nt5.19□□□□□ -1.58
DDI1P40087 RPT4YOR259C 1314 nt5.19□□□□□ -1.58
DDI1P40087 FET3YMR058W 1911 nt5.19□□□□□ -1.58
DDI1P40087 AMD1YML035C 2433 nt5.18□□□□□ -1.58
DDI1P40087 OSW2YLR054C 2175 nt5.18□□□□□ -1.58
DDI1P40087 GRS1YBR121C 2004 nt5.18□□□□□ -1.58
DDI1P40087 STL1YDR536W 1710 nt5.18□□□□□ -1.58
DDI1P40087 APS3YJL024C 585 nt5.18□□□□□ -1.58
DDI1P40087 UBC11YOR339C 471 nt5.18□□□□□ -1.58
DDI1P40087 UBA2YDR390C 1911 nt5.18□□□□□ -1.58
DDI1P40087 SMF3YLR034C 1422 nt5.17□□□□□ -1.58
DDI1P40087 MSS116YDR194C 1995 nt5.17□□□□□ -1.58
DDI1P40087 GLE1YDL207W 1617 nt5.17□□□□□ -1.58
DDI1P40087 TDH2YJR009C 999 nt5.17□□□□□ -1.58
DDI1P40087 RPS5YJR123W 678 nt5.17□□□□□ -1.58
DDI1P40087 PPG1YNR032W 1107 nt5.17□□□□□ -1.58
DDI1P40087 PDB1YBR221C 1101 nt5.17□□□□□ -1.58
DDI1P40087 YHR182WYHR182W 2358 nt5.17□□□□□ -1.58
DDI1P40087 HXT3YDR345C 1704 nt5.17□□□□□ -1.58
DDI1P40087 IMA1YGR287C 1770 nt5.16□□□□□ -1.58
DDI1P40087 JJJ3YJR097W 519 nt5.16□□□□□ -1.58
DDI1P40087 YKR073CYKR073C 321 nt5.16□□□□□ -1.58
DDI1P40087 MRPL15YLR312W-A 762 nt5.16□□□□□ -1.58
DDI1P40087 YML101C-AYML101C-A 318 nt5.16□□□□□ -1.58
DDI1P40087 YBL044WYBL044W 369 nt5.16□□□□□ -1.58
DDI1P40087 YMR252CYMR252C 405 nt5.16□□□□□ -1.58
DDI1P40087 DOM34YNL001W 1161 nt5.16□□□□□ -1.58
DDI1P40087 CKA2YOR061W 1020 nt5.16□□□□□ -1.58
DDI1P40087 CSG2YBR036C 1233 nt5.16□□□□□ -1.58
DDI1P40087 ATE1YGL017W 1512 nt5.16□□□□□ -1.58
DDI1P40087 CDC1YDR182W 1476 nt5.15□□□□□ -1.58
DDI1P40087 YDR396WYDR396W 501 nt5.15□□□□□ -1.59
DDI1P40087 SEC17YBL050W 879 nt5.15□□□□□ -1.59
DDI1P40087 YPL062WYPL062W 405 nt5.15□□□□□ -1.59
DDI1P40087 YNL247WYNL247W 2304 nt5.14□□□□□ -1.59
DDI1P40087 AVO1YOL078W 3531 nt5.14□□□□□ -1.59
DDI1P40087 NOP7YGR103W 1818 nt5.14□□□□□ -1.59
DDI1P40087 PRI2YKL045W 1587 nt5.14□□□□□ -1.59
DDI1P40087 RML2YEL050C 1182 nt5.14□□□□□ -1.59
DDI1P40087 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt5.14□□□□□ -1.59
DDI1P40087 YBL112CYBL112C 318 nt5.14□□□□□ -1.59
DDI1P40087 YBR144CYBR144C 315 nt5.14□□□□□ -1.59
DDI1P40087 PHO90YJL198W 2646 nt5.14□□□□□ -1.59
DDI1P40087 HES1YOR237W 1305 nt5.14□□□□□ -1.59
DDI1P40087 HFI1YPL254W 1467 nt5.13□□□□□ -1.59
DDI1P40087 NGL2YMR285C 1548 nt5.13□□□□□ -1.59
DDI1P40087 MTQ2YDR140W 666 nt5.13□□□□□ -1.59
DDI1P40087 GRX4YER174C 735 nt5.13□□□□□ -1.59
DDI1P40087 MSP1YGR028W 1089 nt5.13□□□□□ -1.59
DDI1P40087 SSY5YJL156C 2100 nt5.13□□□□□ -1.59
DDI1P40087 IMD1YAR073W 1212 nt5.13□□□□□ -1.59
DDI1P40087 RNH201YNL072W 924 nt5.13□□□□□ -1.59
DDI1P40087 TEF1YPR080W 1377 nt5.13□□□□□ -1.59
DDI1P40087 TEF2YBR118W 1377 nt5.13□□□□□ -1.59
DDI1P40087 FYV1YDR024W 486 nt5.12□□□□□ -1.59
DDI1P40087 YJU2YKL095W 837 nt5.12□□□□□ -1.59
DDI1P40087 MTQ1YNL063W 945 nt5.12□□□□□ -1.59
DDI1P40087 MRPS5YBR251W 924 nt5.12□□□□□ -1.59
DDI1P40087 VHS1YDR247W 1386 nt5.12□□□□□ -1.59
DDI1P40087 AIM17YHL021C 1398 nt5.12□□□□□ -1.59
DDI1P40087 RRP9YPR137W 1722 nt5.11□□□□□ -1.59
DDI1P40087 BRF1YGR246C 1791 nt5.11□□□□□ -1.59
DDI1P40087 YGL185CYGL185C 1140 nt5.11□□□□□ -1.59
DDI1P40087 MPM1YJL066C 759 nt5.11□□□□□ -1.59
DDI1P40087 MTW1YAL034W-A 870 nt5.11□□□□□ -1.59
DDI1P40087 ENV9YOR246C 993 nt5.11□□□□□ -1.59
DDI1P40087 BUL1YMR275C 2931 nt5.11□□□□□ -1.59
DDI1P40087 GCS1YDL226C 1059 nt5.1□□□□□ -1.59
DDI1P40087 VMA16YHR026W 642 nt5.1□□□□□ -1.59
DDI1P40087 SYG1YIL047C 2709 nt5.1□□□□□ -1.59
DDI1P40087 APN1YKL114C 1104 nt5.1□□□□□ -1.59
DDI1P40087 NOC4YPR144C 1659 nt5.1□□□□□ -1.59
DDI1P40087 PAP1YKR002W 1707 nt5.09□□□□□ -1.59
DDI1P40087 ECM7YLR443W 1347 nt5.09□□□□□ -1.59
DDI1P40087 YDL114WYDL114W 927 nt5.09□□□□□ -1.59
DDI1P40087 VAM7YGL212W 951 nt5.09□□□□□ -1.59
DDI1P40087 ARP1YHR129C 1155 nt5.09□□□□□ -1.59
DDI1P40087 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt5.09□□□□□ -1.59
DDI1P40087 YJR085CYJR085C 318 nt5.09□□□□□ -1.59
DDI1P40087 GCV3YAL044C 513 nt5.09□□□□□ -1.59
DDI1P40087 YML131WYML131W 1098 nt5.09□□□□□ -1.59
DDI1P40087 RPS9AYPL081W 594 nt5.09□□□□□ -1.59
DDI1P40087 ADE6YGR061C 4077 nt5.08□□□□□ -1.6
DDI1P40087 PRP46YPL151C 1356 nt5.08□□□□□ -1.6
DDI1P40087 RBA50YDR527W 1320 nt5.08□□□□□ -1.6
DDI1P40087 PIF1YML061C 2580 nt5.08□□□□□ -1.6
DDI1P40087 YER187WYER187W 426 nt5.08□□□□□ -1.6
DDI1P40087 YFR035CYFR035C 345 nt5.08□□□□□ -1.6
DDI1P40087 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt5.08□□□□□ -1.6
DDI1P40087 UTP7YER082C 1665 nt5.08□□□□□ -1.6
DDI1P40087 DSF1YEL070W 1509 nt5.07□□□□□ -1.6
DDI1P40087 YNR073CYNR073C 1509 nt5.07□□□□□ -1.6
DDI1P40087 DAL81YIR023W 2913 nt5.07□□□□□ -1.6
DDI1P40087 MKC7YDR144C 1791 nt5.07□□□□□ -1.6
DDI1P40087 ADE12YNL220W 1302 nt5.07□□□□□ -1.6
DDI1P40087 SIT4YDL047W 936 nt5.07□□□□□ -1.6
DDI1P40087 QRI5YLR204W 336 nt5.07□□□□□ -1.6
DDI1P40087 BUB3YOR026W 1026 nt5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.4 ms