Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
H7C1W4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
H7C1W4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
H7C1W4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
H7C1W4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
H7C1W4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
H7C1W4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
H7C1W4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
H7C1W4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
H7C1W4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
H7C1W4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
H7C1W4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
H7C1W4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
H7C1W4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
H7C1W4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
H7C1W4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
H7C1W4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
H7C1W4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
H7C1W4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
H7C1W4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
H7C1W4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
H7C1W4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
H7C1W4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
H7C1W4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
H7C1W4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
H7C1W4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
H7C1W4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
H7C1W4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
H7C1W4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
H7C1W4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
H7C1W4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
H7C1W4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
H7C1W4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
H7C1W4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
H7C1W4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
H7C1W4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
H7C1W4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
H7C1W4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
H7C1W4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
H7C1W4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
H7C1W4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
H7C1W4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
H7C1W4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
H7C1W4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
H7C1W4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
H7C1W4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
H7C1W4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
H7C1W4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
H7C1W4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
H7C1W4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
H7C1W4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
H7C1W4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
H7C1W4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
H7C1W4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
H7C1W4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
H7C1W4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
H7C1W4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
H7C1W4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
H7C1W4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
H7C1W4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
H7C1W4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
H7C1W4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
H7C1W4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
H7C1W4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
H7C1W4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
H7C1W4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
H7C1W4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
H7C1W4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
H7C1W4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
H7C1W4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
H7C1W4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
H7C1W4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
H7C1W4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
H7C1W4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
H7C1W4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
H7C1W4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
H7C1W4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
H7C1W4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
H7C1W4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
H7C1W4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
H7C1W4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
H7C1W4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
H7C1W4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
H7C1W4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
H7C1W4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
H7C1W4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
H7C1W4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
H7C1W4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
H7C1W4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
H7C1W4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
H7C1W4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
H7C1W4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
H7C1W4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
H7C1W4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
H7C1W4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
H7C1W4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
H7C1W4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
H7C1W4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
H7C1W4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
H7C1W4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms