Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 SCR1SCR1 522 nt10.57□□□□□ -0.72
TY1A-DR3Q12441 RPP2AYOL039W 321 nt10.56□□□□□ -0.72
TY1A-DR3Q12441 GIS3YLR094C 1509 nt10.56□□□□□ -0.72
TY1A-DR3Q12441 YSC84YHR016C 1407 nt10.55□□□□□ -0.72
TY1A-DR3Q12441 UME6YDR207C 2511 nt10.55□□□□□ -0.72
TY1A-DR3Q12441 YHL050CYHL050C 2094 nt10.53□□□□□ -0.72
TY1A-DR3Q12441 SRN2YLR119W 642 nt10.53□□□□□ -0.72
TY1A-DR3Q12441 YBL100CYBL100C 315 nt10.53□□□□□ -0.72
TY1A-DR3Q12441 RPP2BYDR382W 333 nt10.52□□□□□ -0.73
TY1A-DR3Q12441 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt10.52□□□□□ -0.73
TY1A-DR3Q12441 RTF1YGL244W 1677 nt10.51□□□□□ -0.73
TY1A-DR3Q12441 YDR509WYDR509W 348 nt10.51□□□□□ -0.73
TY1A-DR3Q12441 YLR122CYLR122C 378 nt10.5□□□□□ -0.73
TY1A-DR3Q12441 TIR1YER011W 765 nt10.49□□□□□ -0.73
TY1A-DR3Q12441 PTK1YKL198C 1989 nt10.48□□□□□ -0.73
TY1A-DR3Q12441 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.47□□□□□ -0.73
TY1A-DR3Q12441 SRB2YHR041C 633 nt10.42□□□□□ -0.74
TY1A-DR3Q12441 FUN26YAL022C 1554 nt10.42□□□□□ -0.74
TY1A-DR3Q12441 RRT12YCR045C 1476 nt10.41□□□□□ -0.74
TY1A-DR3Q12441 ABZ2YMR289W 1125 nt10.39□□□□□ -0.75
TY1A-DR3Q12441 BOP3YNL042W 1191 nt10.34□□□□□ -0.75
TY1A-DR3Q12441 TOM20YGR082W 552 nt10.33□□□□□ -0.76
TY1A-DR3Q12441 SIS1YNL007C 1059 nt10.33□□□□□ -0.76
TY1A-DR3Q12441 ALF1YNL148C 765 nt10.32□□□□□ -0.76
TY1A-DR3Q12441 GFD2YCL036W 1701 nt10.31□□□□□ -0.76
TY1A-DR3Q12441 SEM1YDR363W-A 270 nt10.29□□□□□ -0.76
TY1A-DR3Q12441 RTS2YOR077W 699 nt10.29□□□□□ -0.76
TY1A-DR3Q12441 BDH2YAL061W 1254 nt10.28□□□□□ -0.76
TY1A-DR3Q12441 BOR1YNL275W 1731 nt10.27□□□□□ -0.76
TY1A-DR3Q12441 Q0144Q0144 330 nt10.27□□□□□ -0.77
TY1A-DR3Q12441 ART5YGR068C 1761 nt10.26□□□□□ -0.77
TY1A-DR3Q12441 URH1YDR400W 1023 nt10.26□□□□□ -0.77
TY1A-DR3Q12441 NCP1YHR042W 2076 nt10.24□□□□□ -0.77
TY1A-DR3Q12441 LCP5YER127W 1074 nt10.22□□□□□ -0.77
TY1A-DR3Q12441 ARP10YDR106W 855 nt10.2□□□□□ -0.78
TY1A-DR3Q12441 TRM9YML014W 840 nt10.19□□□□□ -0.78
TY1A-DR3Q12441 CCT6YDR188W 1641 nt10.18□□□□□ -0.78
TY1A-DR3Q12441 AI5_BETAQ0075 1065 nt10.17□□□□□ -0.78
TY1A-DR3Q12441 CUE1YMR264W 612 nt10.15□□□□□ -0.78
TY1A-DR3Q12441 RSB1YOR049C 1065 nt10.13□□□□□ -0.79
TY1A-DR3Q12441 YFL054CYFL054C 1941 nt10.13□□□□□ -0.79
TY1A-DR3Q12441 MCH5YOR306C 1566 nt10.13□□□□□ -0.79
TY1A-DR3Q12441 SPT8YLR055C 1809 nt10.12□□□□□ -0.79
TY1A-DR3Q12441 YJL225CYJL225C 5277 nt10.12□□□□□ -0.79
TY1A-DR3Q12441 PET9YBL030C 957 nt10.1□□□□□ -0.79
TY1A-DR3Q12441 VAR1Q0140 1197 nt10.08□□□□□ -0.8
TY1A-DR3Q12441 UTP6YDR449C 1323 nt10.07□□□□□ -0.8
TY1A-DR3Q12441 YNL195CYNL195C 786 nt10.05□□□□□ -0.8
TY1A-DR3Q12441 HMT1YBR034C 1047 nt10.04□□□□□ -0.8
TY1A-DR3Q12441 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.03□□□□□ -0.8
TY1A-DR3Q12441 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.03□□□□□ -0.8
TY1A-DR3Q12441 ATS1YAL020C 1002 nt10□□□□□ -0.81
TY1A-DR3Q12441 ALG12YNR030W 1656 nt9.99□□□□□ -0.81
TY1A-DR3Q12441 HSP60YLR259C 1719 nt9.99□□□□□ -0.81
TY1A-DR3Q12441 LSM3YLR438C-A 270 nt9.99□□□□□ -0.81
TY1A-DR3Q12441 YJL118WYJL118W 660 nt9.98□□□□□ -0.81
TY1A-DR3Q12441 YCR099CYCR099C 468 nt9.96□□□□□ -0.82
TY1A-DR3Q12441 WWM1YFL010C 636 nt9.95□□□□□ -0.82
TY1A-DR3Q12441 TIR4YOR009W 1464 nt9.95□□□□□ -0.82
TY1A-DR3Q12441 YIL100WYIL100W 354 nt9.94□□□□□ -0.82
TY1A-DR3Q12441 YMR057CYMR057C 372 nt9.92□□□□□ -0.82
TY1A-DR3Q12441 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt9.92□□□□□ -0.82
TY1A-DR3Q12441 YHM2YMR241W 945 nt9.91□□□□□ -0.82
TY1A-DR3Q12441 YPL071CYPL071C 471 nt9.91□□□□□ -0.82
TY1A-DR3Q12441 PET20YPL159C 762 nt9.91□□□□□ -0.82
TY1A-DR3Q12441 SWE1YJL187C 2460 nt9.91□□□□□ -0.82
TY1A-DR3Q12441 YJR154WYJR154W 1041 nt9.9□□□□□ -0.82
TY1A-DR3Q12441 SKG1YKR100C 1068 nt9.9□□□□□ -0.82
TY1A-DR3Q12441 LCB1YMR296C 1677 nt9.9□□□□□ -0.83
TY1A-DR3Q12441 YCH1YGR203W 447 nt9.88□□□□□ -0.83
TY1A-DR3Q12441 snR78snR78 87 nt9.82□□□□□ -0.84
TY1A-DR3Q12441 AI3Q0060 1248 nt9.81□□□□□ -0.84
TY1A-DR3Q12441 YLR236CYLR236C 324 nt9.79□□□□□ -0.84
TY1A-DR3Q12441 GLK1YCL040W 1503 nt9.77□□□□□ -0.84
TY1A-DR3Q12441 PAB1YER165W 1734 nt9.77□□□□□ -0.85
TY1A-DR3Q12441 LYS4YDR234W 2082 nt9.73□□□□□ -0.85
TY1A-DR3Q12441 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.71□□□□□ -0.85
TY1A-DR3Q12441 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.71□□□□□ -0.85
TY1A-DR3Q12441 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt9.71□□□□□ -0.86
TY1A-DR3Q12441 COG1YGL223C 1254 nt9.7□□□□□ -0.86
TY1A-DR3Q12441 YPL041CYPL041C 624 nt9.69□□□□□ -0.86
TY1A-DR3Q12441 NAR1YNL240C 1476 nt9.68□□□□□ -0.86
TY1A-DR3Q12441 YNR068CYNR068C 819 nt9.67□□□□□ -0.86
TY1A-DR3Q12441 FTH1YBR207W 1398 nt9.65□□□□□ -0.86
TY1A-DR3Q12441 FUR4YBR021W 1902 nt9.65□□□□□ -0.86
TY1A-DR3Q12441 YJL107CYJL107C 1164 nt9.63□□□□□ -0.87
TY1A-DR3Q12441 RSM23YGL129C 1353 nt9.6□□□□□ -0.87
TY1A-DR3Q12441 URE2YNL229C 1065 nt9.59□□□□□ -0.87
TY1A-DR3Q12441 STB1YNL309W 1263 nt9.59□□□□□ -0.87
TY1A-DR3Q12441 YPL168WYPL168W 1293 nt9.57□□□□□ -0.88
TY1A-DR3Q12441 BIO5YNR056C 1686 nt9.56□□□□□ -0.88
TY1A-DR3Q12441 BIO4YNR057C 714 nt9.56□□□□□ -0.88
TY1A-DR3Q12441 HSL7YBR133C 2484 nt9.55□□□□□ -0.88
TY1A-DR3Q12441 NPL3YDR432W 1245 nt9.55□□□□□ -0.88
TY1A-DR3Q12441 HOM6YJR139C 1080 nt9.55□□□□□ -0.88
TY1A-DR3Q12441 PBP1YGR178C 2169 nt9.55□□□□□ -0.88
TY1A-DR3Q12441 PRP4YPR178W 1398 nt9.53□□□□□ -0.88
TY1A-DR3Q12441 AAC1YMR056C 930 nt9.53□□□□□ -0.88
TY1A-DR3Q12441 DSK2YMR276W 1122 nt9.53□□□□□ -0.88
TY1A-DR3Q12441 THP3YPR045C 1413 nt9.51□□□□□ -0.89
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