Protein–RNA interactions for Protein: P40550

PDR11, ATP-dependent permease PDR11, yeastyeast

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR11P40550 ALF1YNL148C 765 nt17.24■□□□□ 0.35
PDR11P40550 SPP1YPL138C 1062 nt17.23■□□□□ 0.35
PDR11P40550 YCH1YGR203W 447 nt17.21■□□□□ 0.35
PDR11P40550 YPS1YLR120C 1710 nt17.19■□□□□ 0.34
PDR11P40550 YDR095CYDR095C 411 nt17.17■□□□□ 0.34
PDR11P40550 SUF2tP(AGG)C 72 nt17.13■□□□□ 0.33
PDR11P40550 SUF10tP(AGG)N 72 nt17.13■□□□□ 0.33
PDR11P40550 TIR4YOR009W 1464 nt17.12■□□□□ 0.33
PDR11P40550 IMP2'YIL154C 1041 nt17.11■□□□□ 0.33
PDR11P40550 MRPL8YJL063C 717 nt17.04■□□□□ 0.32
PDR11P40550 SIS1YNL007C 1059 nt17.02■□□□□ 0.31
PDR11P40550 ERV46YAL042W 1248 nt17.01■□□□□ 0.31
PDR11P40550 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt17■□□□□ 0.31
PDR11P40550 MXR2YCL033C 507 nt17■□□□□ 0.31
PDR11P40550 YDR433WYDR433W 441 nt16.97■□□□□ 0.31
PDR11P40550 IDH1YNL037C 1083 nt16.97■□□□□ 0.31
PDR11P40550 RTG1YOL067C 534 nt16.9■□□□□ 0.3
PDR11P40550 UBX6YJL048C 1191 nt16.87■□□□□ 0.29
PDR11P40550 GBP2YCL011C 1284 nt16.86■□□□□ 0.29
PDR11P40550 ART5YGR068C 1761 nt16.85■□□□□ 0.29
PDR11P40550 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt16.83■□□□□ 0.28
PDR11P40550 YEL076CYEL076C 651 nt16.83■□□□□ 0.28
PDR11P40550 YLR464WYLR464W 651 nt16.83■□□□□ 0.28
PDR11P40550 PTP1YDL230W 1008 nt16.82■□□□□ 0.28
PDR11P40550 YMR057CYMR057C 372 nt16.79■□□□□ 0.28
PDR11P40550 RPP2AYOL039W 321 nt16.79■□□□□ 0.28
PDR11P40550 YKR040CYKR040C 504 nt16.76■□□□□ 0.27
PDR11P40550 GFD2YCL036W 1701 nt16.75■□□□□ 0.27
PDR11P40550 ADO1YJR105W 1023 nt16.75■□□□□ 0.27
PDR11P40550 MEP2YNL142W 1500 nt16.68■□□□□ 0.26
PDR11P40550 CAC2YML102W 1407 nt16.67■□□□□ 0.26
PDR11P40550 RTS2YOR077W 699 nt16.66■□□□□ 0.26
PDR11P40550 DCW1YKL046C 1350 nt16.66■□□□□ 0.26
PDR11P40550 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt16.65■□□□□ 0.26
PDR11P40550 SPT5YML010W 3192 nt16.64■□□□□ 0.25
PDR11P40550 PET9YBL030C 957 nt16.58■□□□□ 0.24
PDR11P40550 DED1YOR204W 1815 nt16.56■□□□□ 0.24
PDR11P40550 TCD2YKL027W 1344 nt16.52■□□□□ 0.24
PDR11P40550 PTH1YHR189W 573 nt16.52■□□□□ 0.23
PDR11P40550 FRD1YEL047C 1413 nt16.51■□□□□ 0.23
PDR11P40550 RRD1YIL153W 1182 nt16.49■□□□□ 0.23
PDR11P40550 FPS1YLL043W 2010 nt16.48■□□□□ 0.23
PDR11P40550 FMT1YBL013W 1206 nt16.39■□□□□ 0.21
PDR11P40550 IRC15YPL017C 1500 nt16.37■□□□□ 0.21
PDR11P40550 HUA1YGR268C 597 nt16.35■□□□□ 0.21
PDR11P40550 EMI2YDR516C 1503 nt16.31■□□□□ 0.2
PDR11P40550 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt16.28■□□□□ 0.2
PDR11P40550 YDR094WYDR094W 336 nt16.28■□□□□ 0.2
PDR11P40550 SOR2YDL246C 1074 nt16.22■□□□□ 0.19
PDR11P40550 SOR1YJR159W 1074 nt16.22■□□□□ 0.19
PDR11P40550 CUE1YMR264W 612 nt16.22■□□□□ 0.19
PDR11P40550 YCL042WYCL042W 360 nt16.21■□□□□ 0.19
PDR11P40550 YDL221WYDL221W 552 nt16.2■□□□□ 0.18
PDR11P40550 GIS3YLR094C 1509 nt16.19■□□□□ 0.18
PDR11P40550 LCB1YMR296C 1677 nt16.18■□□□□ 0.18
PDR11P40550 YKL030WYKL030W 606 nt16.13■□□□□ 0.17
PDR11P40550 CWP1YKL096W 720 nt16.12■□□□□ 0.17
PDR11P40550 ADH2YMR303C 1047 nt16.1■□□□□ 0.17
PDR11P40550 YLR235CYLR235C 399 nt16.08■□□□□ 0.16
PDR11P40550 PRE6YOL038W 765 nt15.97■□□□□ 0.15
PDR11P40550 YIL100WYIL100W 354 nt15.96■□□□□ 0.15
PDR11P40550 SBA1YKL117W 651 nt15.94■□□□□ 0.14
PDR11P40550 PAU16YKL224C 372 nt15.94■□□□□ 0.14
PDR11P40550 DIC1YLR348C 897 nt15.93■□□□□ 0.14
PDR11P40550 FMP52YER004W 696 nt15.92■□□□□ 0.14
PDR11P40550 SDH1YKL148C 1923 nt15.9■□□□□ 0.14
PDR11P40550 SCC4YER147C 1875 nt15.9■□□□□ 0.14
PDR11P40550 TIM23YNR017W 669 nt15.89■□□□□ 0.13
PDR11P40550 YMR090WYMR090W 684 nt15.86■□□□□ 0.13
PDR11P40550 SSA4YER103W 1929 nt15.82■□□□□ 0.12
PDR11P40550 PCM1YEL058W 1674 nt15.82■□□□□ 0.12
PDR11P40550 YBR220CYBR220C 1683 nt15.81■□□□□ 0.12
PDR11P40550 YLR179CYLR179C 606 nt15.8■□□□□ 0.12
PDR11P40550 SNF6YHL025W 999 nt15.79■□□□□ 0.12
PDR11P40550 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt15.76■□□□□ 0.11
PDR11P40550 YFR018CYFR018C 1092 nt15.72■□□□□ 0.11
PDR11P40550 WSC2YNL283C 1512 nt15.71■□□□□ 0.11
PDR11P40550 RRT12YCR045C 1476 nt15.67■□□□□ 0.1
PDR11P40550 YIH1YCR059C 777 nt15.65■□□□□ 0.1
PDR11P40550 YFL066CYFL066C 1179 nt15.62■□□□□ 0.09
PDR11P40550 RNQ1YCL028W 1218 nt15.62■□□□□ 0.09
PDR11P40550 YPR064WYPR064W 420 nt15.6■□□□□ 0.09
PDR11P40550 RRT5YFR032C 870 nt15.57■□□□□ 0.08
PDR11P40550 YLL053CYLL053C 459 nt15.56■□□□□ 0.08
PDR11P40550 TAD3YLR316C 969 nt15.56■□□□□ 0.08
PDR11P40550 YSC84YHR016C 1407 nt15.55■□□□□ 0.08
PDR11P40550 BIO4YNR057C 714 nt15.55■□□□□ 0.08
PDR11P40550 AHT1YHR093W 549 nt15.52■□□□□ 0.08
PDR11P40550 YNL195CYNL195C 786 nt15.49■□□□□ 0.07
PDR11P40550 YHL050CYHL050C 2094 nt15.48■□□□□ 0.07
PDR11P40550 PEX25YPL112C 1185 nt15.45■□□□□ 0.06
PDR11P40550 SIM1YIL123W 1431 nt15.43■□□□□ 0.06
PDR11P40550 FTR1YER145C 1215 nt15.43■□□□□ 0.06
PDR11P40550 GAL1YBR020W 1587 nt15.42■□□□□ 0.06
PDR11P40550 TRM5YHR070W 1500 nt15.41■□□□□ 0.06
PDR11P40550 BDH1YAL060W 1149 nt15.4■□□□□ 0.06
PDR11P40550 YNL115CYNL115C 1935 nt15.38■□□□□ 0.05
PDR11P40550 YSP3YOR003W 1437 nt15.37■□□□□ 0.05
PDR11P40550 ATF2YGR177C 1608 nt15.31■□□□□ 0.04
PDR11P40550 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt15.26■□□□□ 0.03
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