Protein–RNA interactions for Protein: P33308

CSE2, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9, yeastyeast

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE2P33308 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.12□□□□□ -0.31
CSE2P33308 ALF1YNL148C 765 nt13.1□□□□□ -0.31
CSE2P33308 YPS1YLR120C 1710 nt13.06□□□□□ -0.32
CSE2P33308 YCH1YGR203W 447 nt13.06□□□□□ -0.32
CSE2P33308 YDR095CYDR095C 411 nt13.03□□□□□ -0.32
CSE2P33308 YJL152WYJL152W 360 nt12.96□□□□□ -0.33
CSE2P33308 SIS1YNL007C 1059 nt12.95□□□□□ -0.34
CSE2P33308 MRPL8YJL063C 717 nt12.94□□□□□ -0.34
CSE2P33308 ERV46YAL042W 1248 nt12.91□□□□□ -0.34
CSE2P33308 LPX1YOR084W 1164 nt12.91□□□□□ -0.34
CSE2P33308 IDH1YNL037C 1083 nt12.87□□□□□ -0.35
CSE2P33308 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.86□□□□□ -0.35
CSE2P33308 TIR4YOR009W 1464 nt12.84□□□□□ -0.35
CSE2P33308 SPP1YPL138C 1062 nt12.8□□□□□ -0.36
CSE2P33308 RPP2AYOL039W 321 nt12.78□□□□□ -0.36
CSE2P33308 YDR433WYDR433W 441 nt12.77□□□□□ -0.37
CSE2P33308 YKR040CYKR040C 504 nt12.75□□□□□ -0.37
CSE2P33308 ADO1YJR105W 1023 nt12.74□□□□□ -0.37
CSE2P33308 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.72□□□□□ -0.37
CSE2P33308 YEL076CYEL076C 651 nt12.72□□□□□ -0.37
CSE2P33308 YLR464WYLR464W 651 nt12.72□□□□□ -0.37
CSE2P33308 GBP2YCL011C 1284 nt12.72□□□□□ -0.37
CSE2P33308 PTP1YDL230W 1008 nt12.71□□□□□ -0.37
CSE2P33308 RTG1YOL067C 534 nt12.71□□□□□ -0.37
CSE2P33308 SPT5YML010W 3192 nt12.7□□□□□ -0.38
CSE2P33308 ART5YGR068C 1761 nt12.7□□□□□ -0.38
CSE2P33308 CAC2YML102W 1407 nt12.68□□□□□ -0.38
CSE2P33308 MEP2YNL142W 1500 nt12.67□□□□□ -0.38
CSE2P33308 PET9YBL030C 957 nt12.66□□□□□ -0.38
CSE2P33308 MXR2YCL033C 507 nt12.66□□□□□ -0.38
CSE2P33308 YMR057CYMR057C 372 nt12.64□□□□□ -0.39
CSE2P33308 GFD2YCL036W 1701 nt12.62□□□□□ -0.39
CSE2P33308 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.59□□□□□ -0.39
CSE2P33308 UBX6YJL048C 1191 nt12.55□□□□□ -0.4
CSE2P33308 TCD2YKL027W 1344 nt12.53□□□□□ -0.4
CSE2P33308 DCW1YKL046C 1350 nt12.48□□□□□ -0.41
CSE2P33308 DED1YOR204W 1815 nt12.47□□□□□ -0.41
CSE2P33308 FPS1YLL043W 2010 nt12.45□□□□□ -0.42
CSE2P33308 HUA1YGR268C 597 nt12.44□□□□□ -0.42
CSE2P33308 FRD1YEL047C 1413 nt12.44□□□□□ -0.42
CSE2P33308 RRD1YIL153W 1182 nt12.43□□□□□ -0.42
CSE2P33308 RTS2YOR077W 699 nt12.38□□□□□ -0.43
CSE2P33308 EMI2YDR516C 1503 nt12.35□□□□□ -0.43
CSE2P33308 IRC15YPL017C 1500 nt12.35□□□□□ -0.43
CSE2P33308 YDR094WYDR094W 336 nt12.33□□□□□ -0.44
CSE2P33308 FMT1YBL013W 1206 nt12.32□□□□□ -0.44
CSE2P33308 SOR2YDL246C 1074 nt12.31□□□□□ -0.44
CSE2P33308 SOR1YJR159W 1074 nt12.31□□□□□ -0.44
CSE2P33308 YDL221WYDL221W 552 nt12.3□□□□□ -0.44
CSE2P33308 CUE1YMR264W 612 nt12.3□□□□□ -0.44
CSE2P33308 YCL042WYCL042W 360 nt12.29□□□□□ -0.44
CSE2P33308 PTH1YHR189W 573 nt12.28□□□□□ -0.44
CSE2P33308 YKL030WYKL030W 606 nt12.25□□□□□ -0.45
CSE2P33308 YLR235CYLR235C 399 nt12.25□□□□□ -0.45
CSE2P33308 GIS3YLR094C 1509 nt12.23□□□□□ -0.45
CSE2P33308 FMP52YER004W 696 nt12.2□□□□□ -0.46
CSE2P33308 YMR090WYMR090W 684 nt12.2□□□□□ -0.46
CSE2P33308 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.18□□□□□ -0.46
CSE2P33308 LCB1YMR296C 1677 nt12.16□□□□□ -0.46
CSE2P33308 CWP1YKL096W 720 nt12.12□□□□□ -0.47
CSE2P33308 YIL100WYIL100W 354 nt12.11□□□□□ -0.47
CSE2P33308 ADH2YMR303C 1047 nt12.1□□□□□ -0.47
CSE2P33308 SDH1YKL148C 1923 nt12.07□□□□□ -0.48
CSE2P33308 SCC4YER147C 1875 nt12.06□□□□□ -0.48
CSE2P33308 TIM23YNR017W 669 nt12.01□□□□□ -0.49
CSE2P33308 DIC1YLR348C 897 nt12□□□□□ -0.49
CSE2P33308 YBR220CYBR220C 1683 nt12□□□□□ -0.49
CSE2P33308 SSA4YER103W 1929 nt11.99□□□□□ -0.49
CSE2P33308 PCM1YEL058W 1674 nt11.99□□□□□ -0.49
CSE2P33308 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.96□□□□□ -0.49
CSE2P33308 YFR018CYFR018C 1092 nt11.95□□□□□ -0.5
CSE2P33308 SNF6YHL025W 999 nt11.95□□□□□ -0.5
CSE2P33308 YLR179CYLR179C 606 nt11.92□□□□□ -0.5
CSE2P33308 PAU16YKL224C 372 nt11.91□□□□□ -0.5
CSE2P33308 RNQ1YCL028W 1218 nt11.91□□□□□ -0.5
CSE2P33308 YIH1YCR059C 777 nt11.89□□□□□ -0.51
CSE2P33308 YPR064WYPR064W 420 nt11.88□□□□□ -0.51
CSE2P33308 PRE6YOL038W 765 nt11.85□□□□□ -0.51
CSE2P33308 WSC2YNL283C 1512 nt11.85□□□□□ -0.51
CSE2P33308 RRT5YFR032C 870 nt11.84□□□□□ -0.51
CSE2P33308 TAD3YLR316C 969 nt11.84□□□□□ -0.51
CSE2P33308 AHT1YHR093W 549 nt11.83□□□□□ -0.52
CSE2P33308 YNL195CYNL195C 786 nt11.81□□□□□ -0.52
CSE2P33308 SBA1YKL117W 651 nt11.77□□□□□ -0.53
CSE2P33308 RRT12YCR045C 1476 nt11.76□□□□□ -0.53
CSE2P33308 YLL053CYLL053C 459 nt11.74□□□□□ -0.53
CSE2P33308 BIO4YNR057C 714 nt11.72□□□□□ -0.53
CSE2P33308 FTR1YER145C 1215 nt11.7□□□□□ -0.54
CSE2P33308 AQY1YPR192W 918 nt11.7□□□□□ -0.54
CSE2P33308 YSC84YHR016C 1407 nt11.69□□□□□ -0.54
CSE2P33308 YFL066CYFL066C 1179 nt11.69□□□□□ -0.54
CSE2P33308 YHL050CYHL050C 2094 nt11.69□□□□□ -0.54
CSE2P33308 PEX25YPL112C 1185 nt11.68□□□□□ -0.54
CSE2P33308 GAL1YBR020W 1587 nt11.67□□□□□ -0.54
CSE2P33308 BDH1YAL060W 1149 nt11.66□□□□□ -0.54
CSE2P33308 SIM1YIL123W 1431 nt11.66□□□□□ -0.54
CSE2P33308 YSP3YOR003W 1437 nt11.64□□□□□ -0.55
CSE2P33308 TRM5YHR070W 1500 nt11.61□□□□□ -0.55
CSE2P33308 SPC25YER018C 666 nt11.58□□□□□ -0.56
CSE2P33308 YNL115CYNL115C 1935 nt11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.8 ms