Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG1

APPL1, DCC-interacting protein 13-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL1Q9UKG1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APPL1Q9UKG1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APPL1Q9UKG1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms