Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 TEL2YGR099W 2067 nt5.78□□□□□ -1.48
LDB17Q12342 LSG1YGL099W 1923 nt5.78□□□□□ -1.48
LDB17Q12342 KDX1YKL161C 1302 nt5.77□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 DRS1YLL008W 2259 nt5.77□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 YDL114WYDL114W 927 nt5.77□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 YRA1YDR381W 681 nt5.77□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 QDR3YBR043C 2070 nt5.77□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 GUP2YPL189W 1830 nt5.76□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 VPS72YDR485C 2388 nt5.76□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 COX17YLL009C 210 nt5.76□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 CWC27YPL064C 906 nt5.76□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 YTH1YPR107C 627 nt5.76□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 ENP1YBR247C 1452 nt5.76□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 GEX2YKR106W 1848 nt5.76□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 MCM6YGL201C 3054 nt5.76□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 ACC1YNR016C 6702 nt5.75□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 FAT3YKL187C 2253 nt5.75□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 YER010CYER010C 705 nt5.75□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 CHO1YER026C 831 nt5.75□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 VPS70YJR126C 2436 nt5.75□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 VNX1YNL321W 2727 nt5.75□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 SFB3YHR098C 2790 nt5.74□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 SNN1YNL086W 309 nt5.74□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 YBR124WYBR124W 360 nt5.74□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 PRP46YPL151C 1356 nt5.74□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 SMF2YHR050W 1650 nt5.74□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 TNA1YGR260W 1605 nt5.74□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 MKK2YPL140C 1521 nt5.74□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 HOS1YPR068C 1413 nt5.74□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 IES1YFL013C 2079 nt5.73□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 MDH3YDL078C 1032 nt5.73□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 SNZ3YFL059W 897 nt5.73□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 SNZ2YNL333W 897 nt5.73□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 PDB1YBR221C 1101 nt5.73□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 MID1YNL291C 1647 nt5.73□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 ORC5YNL261W 1440 nt5.73□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 YME1YPR024W 2244 nt5.72□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.72□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 PAN6YIL145C 930 nt5.72□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 GFD1YMR255W 567 nt5.72□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 YNL108CYNL108C 813 nt5.72□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 CSG2YBR036C 1233 nt5.72□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 ARO10YDR380W 1908 nt5.72□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 SSK22YCR073C 3996 nt5.72□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 FOB1YDR110W 1701 nt5.71□□□□□ -1.49
LDB17Q12342 EPS1YIL005W 2106 nt5.71□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 IDP1YDL066W 1287 nt5.71□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 YJL171CYJL171C 1191 nt5.71□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 BUL1YMR275C 2931 nt5.71□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 NOP2YNL061W 1857 nt5.71□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 YDL144CYDL144C 1071 nt5.7□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 YDR154CYDR154C 351 nt5.7□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 RBD2YPL246C 789 nt5.7□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 STE13YOR219C 2796 nt5.7□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 STL1YDR536W 1710 nt5.69□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 YKR073CYKR073C 321 nt5.69□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 MRP51YPL118W 1035 nt5.69□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 HSP104YLL026W 2727 nt5.69□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 EIS1YMR031C 2532 nt5.69□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 AAP1YHR047C 2571 nt5.68□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 MPM1YJL066C 759 nt5.68□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 JJJ3YJR097W 519 nt5.68□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 SEC17YBL050W 879 nt5.68□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 PFA3YNL326C 1011 nt5.68□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt5.68□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 SHM1YBR263W 1473 nt5.68□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 CCZ1YBR131W 2115 nt5.68□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 CRZ1YNL027W 2037 nt5.67□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 ENT2YLR206W 1842 nt5.67□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 TAH18YPR048W 1872 nt5.67□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 YDR396WYDR396W 501 nt5.67□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 ARP1YHR129C 1155 nt5.67□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 EGD2YHR193C 525 nt5.67□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 PUS5YLR165C 765 nt5.67□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 RET1YOR207C 3450 nt5.67□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 RBA50YDR527W 1320 nt5.67□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 GSY2YLR258W 2118 nt5.66□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 TBF1YPL128C 1689 nt5.66□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 CBP4YGR174C 513 nt5.66□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 LST8YNL006W 912 nt5.66□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 YNL165WYNL165W 1221 nt5.66□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 ERG7YHR072W 2196 nt5.66□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 YDL119CYDL119C 924 nt5.65□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 ORM1YGR038W 669 nt5.65□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 YKL223WYKL223W 333 nt5.65□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 SSP120YLR250W 705 nt5.65□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 YLR317WYLR317W 435 nt5.65□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 YOR200WYOR200W 399 nt5.65□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 ARR3YPR201W 1215 nt5.65□□□□□ -1.5
LDB17Q12342 GYP1YOR070C 1914 nt5.65□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 HSF1YGL073W 2502 nt5.64□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 FHN1YGR131W 525 nt5.64□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 YKL031WYKL031W 414 nt5.64□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 GEP5YLR091W 882 nt5.64□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 MRPL22YNL177C 930 nt5.64□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 MKC7YDR144C 1791 nt5.64□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 AIM17YHL021C 1398 nt5.64□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.63□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 ASH1YKL185W 1767 nt5.63□□□□□ -1.51
LDB17Q12342 SIP2YGL208W 1248 nt5.63□□□□□ -1.51
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