Protein–RNA interactions for Protein: Q12177

YLL056C, Uncharacterized protein YLL056C, yeastyeast

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL056CQ12177 SFC1YJR095W 969 nt5.69□□□□□ -1.5
YLL056CQ12177 MRPL22YNL177C 930 nt5.69□□□□□ -1.5
YLL056CQ12177 YDL119CYDL119C 924 nt5.68□□□□□ -1.5
YLL056CQ12177 OPT1YJL212C 2400 nt5.68□□□□□ -1.5
YLL056CQ12177 UGO1YDR470C 1509 nt5.68□□□□□ -1.5
YLL056CQ12177 ATF1YOR377W 1578 nt5.67□□□□□ -1.5
YLL056CQ12177 GAA1YLR088W 1845 nt5.67□□□□□ -1.5
YLL056CQ12177 BAP2YBR068C 1830 nt5.67□□□□□ -1.5
YLL056CQ12177 SSP120YLR250W 705 nt5.67□□□□□ -1.5
YLL056CQ12177 PGA3YML125C 939 nt5.67□□□□□ -1.5
YLL056CQ12177 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt5.67□□□□□ -1.5
YLL056CQ12177 SLD7YOR060C 774 nt5.67□□□□□ -1.5
YLL056CQ12177 ARR3YPR201W 1215 nt5.67□□□□□ -1.5
YLL056CQ12177 IME2YJL106W 1938 nt5.67□□□□□ -1.5
YLL056CQ12177 ALD6YPL061W 1503 nt5.66□□□□□ -1.5
YLL056CQ12177 MRP17YKL003C 396 nt5.66□□□□□ -1.5
YLL056CQ12177 PSH1YOL054W 1221 nt5.66□□□□□ -1.5
YLL056CQ12177 PIN2YOR104W 849 nt5.66□□□□□ -1.5
YLL056CQ12177 MPA43YNL249C 1629 nt5.66□□□□□ -1.5
YLL056CQ12177 HXT15YDL245C 1704 nt5.65□□□□□ -1.5
YLL056CQ12177 SHE10YGL228W 1734 nt5.65□□□□□ -1.5
YLL056CQ12177 HXT16YJR158W 1704 nt5.65□□□□□ -1.5
YLL056CQ12177 MRPL36YBR122C 534 nt5.65□□□□□ -1.5
YLL056CQ12177 RRT2YBR246W 1164 nt5.65□□□□□ -1.5
YLL056CQ12177 MTF2YDL044C 1323 nt5.65□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 ACS1YAL054C 2142 nt5.65□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 GEX1YCL073C 1848 nt5.64□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 GEX2YKR106W 1848 nt5.64□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 CDC19YAL038W 1503 nt5.64□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 KTR5YNL029C 1569 nt5.64□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 UTP7YER082C 1665 nt5.64□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.64□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 RHO2YNL090W 579 nt5.64□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 YFR006WYFR006W 1608 nt5.63□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 COX26YDR119W-A 201 nt5.63□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 SYF2YGR129W 648 nt5.63□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 ERP5YHR110W 639 nt5.63□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt5.63□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 YBL070CYBL070C 321 nt5.63□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 TBF1YPL128C 1689 nt5.63□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 UTP18YJL069C 1785 nt5.62□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 SNT2YGL131C 4212 nt5.62□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.62□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.62□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.62□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.62□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.62□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.62□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.62□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.62□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.62□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.62□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 YIL060WYIL060W 435 nt5.62□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 YNR048WYNR048W 1182 nt5.62□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.61□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 YDL034WYDL034W 345 nt5.61□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 MTQ2YDR140W 666 nt5.61□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 HXK2YGL253W 1461 nt5.61□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 DRS1YLL008W 2259 nt5.61□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 YLL059CYLL059C 507 nt5.61□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 DCN1YLR128W 810 nt5.61□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 YPR195CYPR195C 330 nt5.61□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 YBR284WYBR284W 2394 nt5.61□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 SEC12YNR026C 1416 nt5.6□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 ACC1YNR016C 6702 nt5.6□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 POP1YNL221C 2628 nt5.6□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 YDL172CYDL172C 480 nt5.6□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 RPR2YIR015W 435 nt5.6□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.6□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 ACF2YLR144C 2340 nt5.6□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 ALT2YDR111C 1524 nt5.59□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 RPT1YKL145W 1404 nt5.59□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 VTH1YIL173W 4650 nt5.59□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 VTH2YJL222W 4650 nt5.59□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 CAD1YDR423C 1230 nt5.59□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 YGR127WYGR127W 939 nt5.59□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 TFS1YLR178C 660 nt5.59□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 PGA2YNL149C 390 nt5.59□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 YPR098CYPR098C 486 nt5.59□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 UBC4YBR082C 447 nt5.59□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 PAP2YOL115W 1755 nt5.59□□□□□ -1.51
YLL056CQ12177 PIF1YML061C 2580 nt5.58□□□□□ -1.52
YLL056CQ12177 HEM3YDL205C 984 nt5.58□□□□□ -1.52
YLL056CQ12177 MTC2YKL098W 1074 nt5.58□□□□□ -1.52
YLL056CQ12177 HOR7YMR251W-A 180 nt5.58□□□□□ -1.52
YLL056CQ12177 MTQ1YNL063W 945 nt5.58□□□□□ -1.52
YLL056CQ12177 CSL4YNL232W 879 nt5.58□□□□□ -1.52
YLL056CQ12177 GEP3YOR205C 1671 nt5.58□□□□□ -1.52
YLL056CQ12177 LAG2YOL025W 1983 nt5.58□□□□□ -1.52
YLL056CQ12177 CYC8YBR112C 2901 nt5.58□□□□□ -1.52
YLL056CQ12177 GIR2YDR152W 798 nt5.57□□□□□ -1.52
YLL056CQ12177 YDR541CYDR541C 1035 nt5.57□□□□□ -1.52
YLL056CQ12177 YGR176WYGR176W 348 nt5.57□□□□□ -1.52
YLL056CQ12177 CDC11YJR076C 1248 nt5.57□□□□□ -1.52
YLL056CQ12177 DAL82YNL314W 768 nt5.57□□□□□ -1.52
YLL056CQ12177 GPT2YKR067W 2232 nt5.57□□□□□ -1.52
YLL056CQ12177 IES1YFL013C 2079 nt5.57□□□□□ -1.52
YLL056CQ12177 TRP3YKL211C 1455 nt5.57□□□□□ -1.52
YLL056CQ12177 SCT1YBL011W 2280 nt5.57□□□□□ -1.52
YLL056CQ12177 EFT2YDR385W 2529 nt5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.9 ms