Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCCQ00597 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCCQ00597 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCCQ00597 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCCQ00597 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCCQ00597 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCCQ00597 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCCQ00597 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCCQ00597 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCCQ00597 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCCQ00597 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCCQ00597 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FANCCQ00597 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FANCCQ00597 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FANCCQ00597 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FANCCQ00597 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FANCCQ00597 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FANCCQ00597 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FANCCQ00597 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms