Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DENRO43583 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DENRO43583 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DENRO43583 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DENRO43583 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DENRO43583 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DENRO43583 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DENRO43583 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DENRO43583 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DENRO43583 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DENRO43583 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DENRO43583 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DENRO43583 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DENRO43583 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DENRO43583 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DENRO43583 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DENRO43583 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DENRO43583 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DENRO43583 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DENRO43583 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DENRO43583 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DENRO43583 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DENRO43583 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DENRO43583 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DENRO43583 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DENRO43583 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DENRO43583 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DENRO43583 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DENRO43583 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DENRO43583 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DENRO43583 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DENRO43583 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DENRO43583 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DENRO43583 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DENRO43583 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DENRO43583 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DENRO43583 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DENRO43583 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DENRO43583 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DENRO43583 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DENRO43583 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DENRO43583 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DENRO43583 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DENRO43583 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DENRO43583 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DENRO43583 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DENRO43583 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DENRO43583 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DENRO43583 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DENRO43583 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DENRO43583 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DENRO43583 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DENRO43583 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DENRO43583 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DENRO43583 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DENRO43583 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DENRO43583 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DENRO43583 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DENRO43583 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DENRO43583 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DENRO43583 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DENRO43583 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DENRO43583 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DENRO43583 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DENRO43583 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENRO43583 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENRO43583 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENRO43583 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENRO43583 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DENRO43583 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DENRO43583 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DENRO43583 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DENRO43583 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DENRO43583 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DENRO43583 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
DENRO43583 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DENRO43583 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DENRO43583 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENRO43583 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENRO43583 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENRO43583 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENRO43583 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENRO43583 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENRO43583 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DENRO43583 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DENRO43583 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DENRO43583 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DENRO43583 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DENRO43583 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DENRO43583 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DENRO43583 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DENRO43583 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DENRO43583 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DENRO43583 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DENRO43583 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DENRO43583 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DENRO43583 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DENRO43583 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DENRO43583 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DENRO43583 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms