Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NIPBLQ6KC79 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.721e-5■■■■□ 22.3
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NIPBLQ6KC79 PLD3-221ENST00000599685 544 ntTSL 210.55□□□□□ -0.721e-5■■■■□ 22.3
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NIPBLQ6KC79 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.851e-5■■■■□ 22.3
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NIPBLQ6KC79 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -11e-5■■■■□ 22.3
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NIPBLQ6KC79 WDR6-204ENST00000420783 3656 ntTSL 1 (best)8.23□□□□□ -1.091e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 SMC3-201ENST00000361804 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.091e-5■■■■□ 22.3
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NIPBLQ6KC79 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.141e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 WDR6-208ENST00000452875 3916 ntTSL 1 (best)7.82□□□□□ -1.161e-5■■■■□ 22.3
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NIPBLQ6KC79 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.171e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.191e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 AC008014.1-203ENST00000611243 1569 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.191e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 WDR6-220ENST00000608424 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.21e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 HEPH-204ENST00000425114 2459 ntTSL 57.37□□□□□ -1.231e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 ATF7IP-219ENST00000542967 564 ntTSL 57.35□□□□□ -1.231e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 GORASP2-206ENST00000471559 812 ntTSL 47.3□□□□□ -1.241e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 ELOC-202ENST00000518127 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.261e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 MDH1-215ENST00000539945 1443 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.271e-5■■■■□ 22.3
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NIPBLQ6KC79 TMEM164-204ENST00000372073 5567 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.271e-5■■■■□ 22.3
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NIPBLQ6KC79 CELSR2-201ENST00000271332 10534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.31e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 PLD3-208ENST00000464586 253 ntTSL 1 (best)6.92□□□□□ -1.31e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 ASXL1-209ENST00000555564 658 ntTSL 46.84□□□□□ -1.311e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 CHD6-201ENST00000309279 1635 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.331e-5■■■■□ 22.3
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NIPBLQ6KC79 TMEM164-202ENST00000372068 5566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.341e-5■■■■□ 22.3
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