Protein–RNA interactions for Protein: P40048

PTP3, Tyrosine-protein phosphatase 3, yeastyeast

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PTP3P40048 LTO1YNL260C 597 nt10.4□□□□□ -0.74
PTP3P40048 NPT1YOR209C 1290 nt10.4□□□□□ -0.74
PTP3P40048 ALG1YBR110W 1350 nt10.39□□□□□ -0.75
PTP3P40048 CYS3YAL012W 1185 nt10.39□□□□□ -0.75
PTP3P40048 RCN1YKL159C 636 nt10.39□□□□□ -0.75
PTP3P40048 YLR156WYLR156W 345 nt10.39□□□□□ -0.75
PTP3P40048 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt10.39□□□□□ -0.75
PTP3P40048 YLR159WYLR159W 345 nt10.39□□□□□ -0.75
PTP3P40048 YLR161WYLR161W 345 nt10.39□□□□□ -0.75
PTP3P40048 TOM40YMR203W 1164 nt10.39□□□□□ -0.75
PTP3P40048 CPT1YNL130C 1182 nt10.39□□□□□ -0.75
PTP3P40048 SUR1YPL057C 1149 nt10.39□□□□□ -0.75
PTP3P40048 MRL1YPR079W 1146 nt10.39□□□□□ -0.75
PTP3P40048 UME1YPL139C 1383 nt10.39□□□□□ -0.75
PTP3P40048 MPO1YGL010W 525 nt10.38□□□□□ -0.75
PTP3P40048 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt10.38□□□□□ -0.75
PTP3P40048 LSR1LSR1 1175 nt10.38□□□□□ -0.75
PTP3P40048 OPI10YOL032W 741 nt10.38□□□□□ -0.75
PTP3P40048 GLO4YOR040W 858 nt10.38□□□□□ -0.75
PTP3P40048 YPL261CYPL261C 309 nt10.38□□□□□ -0.75
PTP3P40048 PEX32YBR168W 1242 nt10.38□□□□□ -0.75
PTP3P40048 MAK11YKL021C 1407 nt10.38□□□□□ -0.75
PTP3P40048 RSA4YCR072C 1548 nt10.38□□□□□ -0.75
PTP3P40048 RNH202YDR279W 1053 nt10.37□□□□□ -0.75
PTP3P40048 MBR1YKL093W 1020 nt10.37□□□□□ -0.75
PTP3P40048 KTI12YKL110C 942 nt10.37□□□□□ -0.75
PTP3P40048 THI73YLR004C 1572 nt10.37□□□□□ -0.75
PTP3P40048 MRPL4YLR439W 960 nt10.37□□□□□ -0.75
PTP3P40048 SAS2YMR127C 1017 nt10.37□□□□□ -0.75
PTP3P40048 FIG1YBR040W 897 nt10.37□□□□□ -0.75
PTP3P40048 BPL1YDL141W 2073 nt10.37□□□□□ -0.75
PTP3P40048 SLS1YLR139C 1932 nt10.37□□□□□ -0.75
PTP3P40048 CLN2YPL256C 1638 nt10.36□□□□□ -0.75
PTP3P40048 FCF1YDR339C 570 nt10.36□□□□□ -0.75
PTP3P40048 HAP2YGL237C 798 nt10.36□□□□□ -0.75
PTP3P40048 PRP21YJL203W 843 nt10.36□□□□□ -0.75
PTP3P40048 NYV1YLR093C 762 nt10.36□□□□□ -0.75
PTP3P40048 MPP6YNR024W 561 nt10.36□□□□□ -0.75
PTP3P40048 PNG1YPL096W 1092 nt10.36□□□□□ -0.75
PTP3P40048 MET16YPR167C 786 nt10.36□□□□□ -0.75
PTP3P40048 RAD59YDL059C 717 nt10.35□□□□□ -0.75
PTP3P40048 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt10.35□□□□□ -0.75
PTP3P40048 RRP46YGR095C 672 nt10.35□□□□□ -0.75
PTP3P40048 AIM46YHR199C 933 nt10.35□□□□□ -0.75
PTP3P40048 YLR334CYLR334C 381 nt10.35□□□□□ -0.75
PTP3P40048 NBP1YLR457C 960 nt10.35□□□□□ -0.75
PTP3P40048 SNX3YOR357C 489 nt10.35□□□□□ -0.75
PTP3P40048 SPE3YPR069C 882 nt10.35□□□□□ -0.75
PTP3P40048 BI3Q0115 1554 nt10.35□□□□□ -0.75
PTP3P40048 HOS1YPR068C 1413 nt10.34□□□□□ -0.75
PTP3P40048 snR84snR84 550 nt10.34□□□□□ -0.75
PTP3P40048 YDR249CYDR249C 1122 nt10.34□□□□□ -0.75
PTP3P40048 IRC6YFR043C 714 nt10.34□□□□□ -0.75
PTP3P40048 SPC34YKR037C 888 nt10.34□□□□□ -0.75
PTP3P40048 NSE1YLR007W 1011 nt10.34□□□□□ -0.75
PTP3P40048 PML39YML107C 1005 nt10.34□□□□□ -0.75
PTP3P40048 ECM13YBL043W 774 nt10.34□□□□□ -0.75
PTP3P40048 CKB2YOR039W 777 nt10.34□□□□□ -0.75
PTP3P40048 SNF11YDR073W 510 nt10.33□□□□□ -0.76
PTP3P40048 YIP5YGL161C 933 nt10.33□□□□□ -0.76
PTP3P40048 CIR1YGR207C 786 nt10.33□□□□□ -0.76
PTP3P40048 BAT2YJR148W 1131 nt10.33□□□□□ -0.76
PTP3P40048 YLR042CYLR042C 486 nt10.33□□□□□ -0.76
PTP3P40048 RFC4YOL094C 972 nt10.33□□□□□ -0.76
PTP3P40048 MET2YNL277W 1461 nt10.33□□□□□ -0.76
PTP3P40048 YER186CYER186C 921 nt10.32□□□□□ -0.76
PTP3P40048 CDC123YLR215C 1083 nt10.32□□□□□ -0.76
PTP3P40048 YBL062WYBL062W 381 nt10.32□□□□□ -0.76
PTP3P40048 SER1YOR184W 1188 nt10.32□□□□□ -0.76
PTP3P40048 YBR071WYBR071W 636 nt10.32□□□□□ -0.76
PTP3P40048 RPL21AYBR191W 483 nt10.32□□□□□ -0.76
PTP3P40048 PRP19YLL036C 1512 nt10.32□□□□□ -0.76
PTP3P40048 PEX3YDR329C 1326 nt10.32□□□□□ -0.76
PTP3P40048 TFC6YDR362C 2019 nt10.31□□□□□ -0.76
PTP3P40048 ARO3YDR035W 1113 nt10.31□□□□□ -0.76
PTP3P40048 OCA6YDR067C 675 nt10.31□□□□□ -0.76
PTP3P40048 SPR28YDR218C 1272 nt10.31□□□□□ -0.76
PTP3P40048 PFK27YOL136C 1194 nt10.31□□□□□ -0.76
PTP3P40048 SHC1YER096W 1539 nt10.31□□□□□ -0.76
PTP3P40048 JHD1YER051W 1479 nt10.3□□□□□ -0.76
PTP3P40048 NRG1YDR043C 696 nt10.3□□□□□ -0.76
PTP3P40048 PMP3YDR276C 168 nt10.3□□□□□ -0.76
PTP3P40048 IRC7YFR055W 1023 nt10.3□□□□□ -0.76
PTP3P40048 YGL132WYGL132W 336 nt10.3□□□□□ -0.76
PTP3P40048 TAD1YGL243W 1203 nt10.3□□□□□ -0.76
PTP3P40048 YKL115CYKL115C 393 nt10.3□□□□□ -0.76
PTP3P40048 RPL10YLR075W 666 nt10.3□□□□□ -0.76
PTP3P40048 SMD3YLR147C 306 nt10.3□□□□□ -0.76
PTP3P40048 YLR184WYLR184W 348 nt10.3□□□□□ -0.76
PTP3P40048 EAF7YNL136W 1278 nt10.3□□□□□ -0.76
PTP3P40048 PDR16YNL231C 1056 nt10.3□□□□□ -0.76
PTP3P40048 YOL035CYOL035C 303 nt10.3□□□□□ -0.76
PTP3P40048 DXO1YDR370C 1329 nt10.3□□□□□ -0.76
PTP3P40048 GID8YMR135C 1368 nt10.29□□□□□ -0.76
PTP3P40048 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt10.29□□□□□ -0.76
PTP3P40048 GLC7YER133W 939 nt10.29□□□□□ -0.76
PTP3P40048 SYF2YGR129W 648 nt10.29□□□□□ -0.76
PTP3P40048 AIM18YHR198C 966 nt10.29□□□□□ -0.76
PTP3P40048 PRE3YJL001W 648 nt10.29□□□□□ -0.76
PTP3P40048 ZIM17YNL310C 525 nt10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 212.7 ms