Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CBX8Q9HC52 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CBX8Q9HC52 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CBX8Q9HC52 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms