Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU7

SCX, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCXQ7RTU7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCXQ7RTU7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms