Protein–RNA interactions for Protein: Q12491

TY2B-B, Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-BQ12491 YDR278CYDR278C 318 nt8.86□□□□□ -0.99
TY2B-BQ12491 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt8.86□□□□□ -0.99
TY2B-BQ12491 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt8.86□□□□□ -0.99
TY2B-BQ12491 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt8.86□□□□□ -0.99
TY2B-BQ12491 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt8.86□□□□□ -0.99
TY2B-BQ12491 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt8.86□□□□□ -0.99
TY2B-BQ12491 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt8.86□□□□□ -0.99
TY2B-BQ12491 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt8.86□□□□□ -0.99
TY2B-BQ12491 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt8.86□□□□□ -0.99
TY2B-BQ12491 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt8.86□□□□□ -0.99
TY2B-BQ12491 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt8.86□□□□□ -0.99
TY2B-BQ12491 COA1YIL157C 594 nt8.86□□□□□ -0.99
TY2B-BQ12491 CIS3YJL158C 684 nt8.86□□□□□ -0.99
TY2B-BQ12491 PRP46YPL151C 1356 nt8.86□□□□□ -0.99
TY2B-BQ12491 YRA1YDR381W 681 nt8.84□□□□□ -0.99
TY2B-BQ12491 YER010CYER010C 705 nt8.84□□□□□ -0.99
TY2B-BQ12491 PYC2YBR218C 3543 nt8.84□□□□□ -0.99
TY2B-BQ12491 CRP1YHR146W 1398 nt8.84□□□□□ -0.99
TY2B-BQ12491 BCY1YIL033C 1251 nt8.84□□□□□ -1
TY2B-BQ12491 YOR318CYOR318C 306 nt8.84□□□□□ -1
TY2B-BQ12491 SHE10YGL228W 1734 nt8.83□□□□□ -1
TY2B-BQ12491 UTR4YEL038W 684 nt8.83□□□□□ -1
TY2B-BQ12491 COX5AYNL052W 462 nt8.83□□□□□ -1
TY2B-BQ12491 SSK22YCR073C 3996 nt8.82□□□□□ -1
TY2B-BQ12491 SES1YDR023W 1389 nt8.81□□□□□ -1
TY2B-BQ12491 SUP19tS(UGA)E 82 nt8.81□□□□□ -1
TY2B-BQ12491 SUP17tS(UGA)I 82 nt8.81□□□□□ -1
TY2B-BQ12491 SUP16tS(UGA)P 82 nt8.81□□□□□ -1
TY2B-BQ12491 GLE1YDL207W 1617 nt8.8□□□□□ -1
TY2B-BQ12491 FRS2YFL022C 1512 nt8.8□□□□□ -1
TY2B-BQ12491 YRF1-1YDR545W 5391 nt8.79□□□□□ -1
TY2B-BQ12491 YEA6YEL006W 1008 nt8.79□□□□□ -1
TY2B-BQ12491 YRF1-5YLR467W 5391 nt8.79□□□□□ -1
TY2B-BQ12491 YRF1-8YOR396W 5391 nt8.79□□□□□ -1
TY2B-BQ12491 RDN37-1RDN37-1 5354 nt8.79□□□□□ -1
TY2B-BQ12491 RDN37-2RDN37-2 5354 nt8.79□□□□□ -1
TY2B-BQ12491 HSP12YFL014W 330 nt8.78□□□□□ -1
TY2B-BQ12491 NPA3YJR072C 1158 nt8.78□□□□□ -1
TY2B-BQ12491 YML082WYML082W 1950 nt8.78□□□□□ -1
TY2B-BQ12491 TDH3YGR192C 999 nt8.78□□□□□ -1
TY2B-BQ12491 YHC3YJL059W 1227 nt8.78□□□□□ -1
TY2B-BQ12491 YML083CYML083C 1257 nt8.78□□□□□ -1
TY2B-BQ12491 COS9YKL219W 1224 nt8.77□□□□□ -1.01
TY2B-BQ12491 SMK1YPR054W 1167 nt8.77□□□□□ -1.01
TY2B-BQ12491 KIN1YDR122W 3195 nt8.77□□□□□ -1.01
TY2B-BQ12491 COT1YOR316C 1320 nt8.76□□□□□ -1.01
TY2B-BQ12491 COX26YDR119W-A 201 nt8.76□□□□□ -1.01
TY2B-BQ12491 YLR118CYLR118C 684 nt8.76□□□□□ -1.01
TY2B-BQ12491 SRF1YDL133W 1314 nt8.76□□□□□ -1.01
TY2B-BQ12491 YNL296WYNL296W 315 nt8.76□□□□□ -1.01
TY2B-BQ12491 RPT3YDR394W 1287 nt8.73□□□□□ -1.01
TY2B-BQ12491 MIM2YLR099W-A 264 nt8.73□□□□□ -1.01
TY2B-BQ12491 SER1YOR184W 1188 nt8.73□□□□□ -1.01
TY2B-BQ12491 THI21YPL258C 1656 nt8.73□□□□□ -1.01
TY2B-BQ12491 YPL277CYPL277C 1464 nt8.72□□□□□ -1.01
TY2B-BQ12491 RER2YBR002C 861 nt8.72□□□□□ -1.01
TY2B-BQ12491 YHR131CYHR131C 2553 nt8.71□□□□□ -1.01
TY2B-BQ12491 TFS1YLR178C 660 nt8.71□□□□□ -1.01
TY2B-BQ12491 SEC23YPR181C 2307 nt8.7□□□□□ -1.02
TY2B-BQ12491 MMP1YLL061W 1752 nt8.7□□□□□ -1.02
TY2B-BQ12491 YMR010WYMR010W 1218 nt8.7□□□□□ -1.02
TY2B-BQ12491 ARG81YML099C 2643 nt8.7□□□□□ -1.02
TY2B-BQ12491 LAS17YOR181W 1902 nt8.7□□□□□ -1.02
TY2B-BQ12491 MHR1YDR296W 681 nt8.69□□□□□ -1.02
TY2B-BQ12491 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt8.69□□□□□ -1.02
TY2B-BQ12491 DMA1YHR115C 1251 nt8.69□□□□□ -1.02
TY2B-BQ12491 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt8.69□□□□□ -1.02
TY2B-BQ12491 PHO8YDR481C 1701 nt8.69□□□□□ -1.02
TY2B-BQ12491 YUR1YJL139C 1287 nt8.68□□□□□ -1.02
TY2B-BQ12491 MRPL4YLR439W 960 nt8.68□□□□□ -1.02
TY2B-BQ12491 CBC2YPL178W 627 nt8.68□□□□□ -1.02
TY2B-BQ12491 EEB1YPL095C 1371 nt8.67□□□□□ -1.02
TY2B-BQ12491 CBF1YJR060W 1056 nt8.66□□□□□ -1.02
TY2B-BQ12491 HCR1YLR192C 798 nt8.66□□□□□ -1.02
TY2B-BQ12491 TAL1YLR354C 1008 nt8.66□□□□□ -1.02
TY2B-BQ12491 YPR204WYPR204W 3099 nt8.65□□□□□ -1.02
TY2B-BQ12491 GAL2YLR081W 1725 nt8.63□□□□□ -1.03
TY2B-BQ12491 BUD28YLR062C 378 nt8.63□□□□□ -1.03
TY2B-BQ12491 PGA3YML125C 939 nt8.63□□□□□ -1.03
TY2B-BQ12491 YNL190WYNL190W 615 nt8.63□□□□□ -1.03
TY2B-BQ12491 PIN2YOR104W 849 nt8.63□□□□□ -1.03
TY2B-BQ12491 MOD5YOR274W 1287 nt8.62□□□□□ -1.03
TY2B-BQ12491 DIA3YDL024C 1407 nt8.62□□□□□ -1.03
TY2B-BQ12491 YME1YPR024W 2244 nt8.62□□□□□ -1.03
TY2B-BQ12491 LAS21YJL062W 2493 nt8.61□□□□□ -1.03
TY2B-BQ12491 LYS12YIL094C 1116 nt8.61□□□□□ -1.03
TY2B-BQ12491 YJU3YKL094W 942 nt8.61□□□□□ -1.03
TY2B-BQ12491 YHL017WYHL017W 1599 nt8.6□□□□□ -1.03
TY2B-BQ12491 RPS15YOL040C 429 nt8.6□□□□□ -1.03
TY2B-BQ12491 GUT1YHL032C 2130 nt8.59□□□□□ -1.03
TY2B-BQ12491 YRF1-3YGR296W 5580 nt8.59□□□□□ -1.03
TY2B-BQ12491 YRF1-6YNL339C 5580 nt8.59□□□□□ -1.03
TY2B-BQ12491 YRF1-7YPL283C 5580 nt8.59□□□□□ -1.03
TY2B-BQ12491 EFM3YJR129C 1020 nt8.59□□□□□ -1.03
TY2B-BQ12491 DUS4YLR405W 1104 nt8.59□□□□□ -1.03
TY2B-BQ12491 ECM38YLR299W 1983 nt8.59□□□□□ -1.03
TY2B-BQ12491 GET3YDL100C 1065 nt8.58□□□□□ -1.04
TY2B-BQ12491 YBR016WYBR016W 387 nt8.58□□□□□ -1.04
TY2B-BQ12491 RPN12YFR052W 825 nt8.58□□□□□ -1.04
TY2B-BQ12491 ETR1YBR026C 1143 nt8.58□□□□□ -1.04
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