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Protein–RNA interactions for Protein: Q12455
SPE4, Spermine synthase, yeast
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SPE4
Q12455
RSA4
YCR072C
1548 nt
6.08
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
YNL247W
YNL247W
2304 nt
6.08
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
YFL042C
YFL042C
2025 nt
6.08
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
YEL068C
YEL068C
333 nt
6.07
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
YMR252C
YMR252C
405 nt
6.07
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
GAT1
YFL021W
1533 nt
6.07
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
RMD9
YGL107C
1941 nt
6.07
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
MCM3
YEL032W
2916 nt
6.06
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
MDM31
YHR194W
1740 nt
6.06
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
YET3
YDL072C
612 nt
6.06
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
COS6
YGR295C
1146 nt
6.06
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
YHR218W-A
YHR218W-A
318 nt
6.06
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
PSR2
YLR019W
1194 nt
6.06
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
YNR040W
YNR040W
771 nt
6.06
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
YBL112C
YBL112C
318 nt
6.06
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
TFB4
YPR056W
1017 nt
6.06
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
YPR114W
YPR114W
948 nt
6.06
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
ATG7
YHR171W
1893 nt
6.06
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
HAS1
YMR290C
1518 nt
6.05
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
YIR020W-A
YIR020W-A
243 nt
6.05
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
RPL10
YLR075W
666 nt
6.05
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
MRPS16
YPL013C
366 nt
6.05
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
NHP6B
YBR089C-A
300 nt
6.05
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
SGE1
YPR198W
1632 nt
6.05
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
ACS1
YAL054C
2142 nt
6.05
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
MTC5
YDR128W
3447 nt
6.05
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
MAK31
YCR020C-A
267 nt
6.04
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
AIM20
YIL158W
615 nt
6.04
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
TAF11
YML015C
1041 nt
6.04
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
SCS7
YMR272C
1155 nt
6.04
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
PKC1
YBL105C
3456 nt
6.04
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
OSW2
YLR054C
2175 nt
6.04
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
IVY1
YDR229W
1362 nt
6.04
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
RAD3
YER171W
2337 nt
6.03
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
YJU3
YKL094W
942 nt
6.03
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
TAL1
YLR354C
1008 nt
6.03
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
GPB2
YAL056W
2643 nt
6.03
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
AIM17
YHL021C
1398 nt
6.03
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
XBP1
YIL101C
1944 nt
6.03
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
CDC1
YDR182W
1476 nt
6.02
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
ATG4
YNL223W
1485 nt
6.02
□□□□□ -1.44
SPE4
Q12455
KEX2
YNL238W
2445 nt
6.02
□□□□□ -1.45
SPE4
Q12455
YDR034W-B
YDR034W-B
156 nt
6.02
□□□□□ -1.45
SPE4
Q12455
JJJ3
YJR097W
519 nt
6.02
□□□□□ -1.45
SPE4
Q12455
YMR122C
YMR122C
375 nt
6.02
□□□□□ -1.45
SPE4
Q12455
CBT1
YKL208W
816 nt
6.01
□□□□□ -1.45
SPE4
Q12455
HAP3
YBL021C
435 nt
6.01
□□□□□ -1.45
SPE4
Q12455
YBL070C
YBL070C
321 nt
6.01
□□□□□ -1.45
SPE4
Q12455
SCS22
YBL091C-A
528 nt
6.01
□□□□□ -1.45
SPE4
Q12455
KTR5
YNL029C
1569 nt
6.01
□□□□□ -1.45
SPE4
Q12455
YDR387C
YDR387C
1668 nt
6.01
□□□□□ -1.45
SPE4
Q12455
CLB1
YGR108W
1416 nt
6
□□□□□ -1.45
SPE4
Q12455
FRE5
YOR384W
2085 nt
6
□□□□□ -1.45
SPE4
Q12455
ATG18
YFR021W
1503 nt
6
□□□□□ -1.45
SPE4
Q12455
snR82
snR82
268 nt
6
□□□□□ -1.45
SPE4
Q12455
TFG2
YGR005C
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6
□□□□□ -1.45
SPE4
Q12455
TSR3
YOR006C
942 nt
6
□□□□□ -1.45
SPE4
Q12455
RPN7
YPR108W
1290 nt
6
□□□□□ -1.45
SPE4
Q12455
PRP40
YKL012W
1752 nt
6
□□□□□ -1.45
SPE4
Q12455
YBR284W
YBR284W
2394 nt
6
□□□□□ -1.45
SPE4
Q12455
HSP78
YDR258C
2436 nt
5.99
□□□□□ -1.45
SPE4
Q12455
EFT2
YDR385W
2529 nt
5.99
□□□□□ -1.45
SPE4
Q12455
EFT1
YOR133W
2529 nt
5.99
□□□□□ -1.45
SPE4
Q12455
SEC18
YBR080C
2277 nt
5.99
□□□□□ -1.45
SPE4
Q12455
SIR2
YDL042C
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5.99
□□□□□ -1.45
SPE4
Q12455
CDS1
YBR029C
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5.99
□□□□□ -1.45
SPE4
Q12455
EAF5
YEL018W
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□□□□□ -1.45
SPE4
Q12455
HAP2
YGL237C
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□□□□□ -1.45
SPE4
Q12455
TDH2
YJR009C
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SPE4
Q12455
CAF40
YNL288W
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5.99
□□□□□ -1.45
SPE4
Q12455
YOR111W
YOR111W
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□□□□□ -1.45
SPE4
Q12455
DAL4
YIR028W
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5.99
□□□□□ -1.45
SPE4
Q12455
IRS4
YKR019C
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5.99
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SPE4
Q12455
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SPE4
Q12455
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YDR015C
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□□□□□ -1.45
SPE4
Q12455
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□□□□□ -1.45
SPE4
Q12455
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SPE4
Q12455
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Q12455
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SPE4
Q12455
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YNL313C
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□□□□□ -1.45
SPE4
Q12455
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SPE4
Q12455
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□□□□□ -1.45
SPE4
Q12455
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SPE4
Q12455
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YER148W-A
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SPE4
Q12455
MSP1
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SPE4
Q12455
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SPE4
Q12455
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SPE4
Q12455
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YBR112C
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SPE4
Q12455
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SPE4
Q12455
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□□□□□ -1.46
SPE4
Q12455
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YGR044C
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5.96
□□□□□ -1.46
SPE4
Q12455
FSF1
YOR271C
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5.96
□□□□□ -1.46
SPE4
Q12455
RAD24
YER173W
1980 nt
5.96
□□□□□ -1.46
SPE4
Q12455
HIR1
YBL008W
2523 nt
5.95
□□□□□ -1.46
SPE4
Q12455
YER186C
YER186C
921 nt
5.95
□□□□□ -1.46
SPE4
Q12455
RPS2
YGL123W
765 nt
5.95
□□□□□ -1.46
SPE4
Q12455
YHR213W-A
YHR213W-A
234 nt
5.95
□□□□□ -1.46
SPE4
Q12455
YOL131W
YOL131W
327 nt
5.95
□□□□□ -1.46
SPE4
Q12455
SSK22
YCR073C
3996 nt
5.95
□□□□□ -1.46
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