Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 YDL129WYDL129W 876 nt6.08□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 RPT3YDR394W 1287 nt6.08□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 CNE1YAL058W 1509 nt6.08□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 MRS1YIR021W 1092 nt6.07□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 MOG1YJR074W 657 nt6.07□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 FRS2YFL022C 1512 nt6.07□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 NHA1YLR138W 2958 nt6.07□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 PYK2YOR347C 1521 nt6.06□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 THI4YGR144W 981 nt6.06□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 FAF1YIL019W 1041 nt6.06□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 PXL1YKR090W 2121 nt6.06□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 RPS28AYOR167C 204 nt6.06□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 ELP3YPL086C 1674 nt6.06□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 KEL1YHR158C 3495 nt6.06□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 AFG1YEL052W 1530 nt6.05□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 LYS21YDL131W 1323 nt6.05□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 VPS5YOR069W 2028 nt6.05□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 YDL023CYDL023C 321 nt6.05□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 BUD32YGR262C 786 nt6.05□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 LEU5YHR002W 1074 nt6.05□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 PRE3YJL001W 648 nt6.05□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 GCV3YAL044C 513 nt6.05□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt6.05□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 MRPS12YNR036C 462 nt6.05□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 RAD24YER173W 1980 nt6.05□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 SKS1YPL026C 1509 nt6.04□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 ATG4YNL223W 1485 nt6.04□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 MNN5YJL186W 1761 nt6.04□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 RMA1YKL132C 1293 nt6.04□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 YOL163WYOL163W 510 nt6.04□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 RDL2YOR286W 450 nt6.04□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 HST2YPL015C 1074 nt6.04□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt6.04□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 UTP4YDR324C 2331 nt6.04□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 IVY1YDR229W 1362 nt6.04□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 ALT2YDR111C 1524 nt6.04□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 VHT1YGR065C 1782 nt6.03□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 IMA2YOL157C 1770 nt6.03□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 ASN1YPR145W 1719 nt6.03□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 RPN11YFR004W 921 nt6.03□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 IFA38YBR159W 1044 nt6.03□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 CHL4YDR254W 1377 nt6.03□□□□□ -1.44
LDB17Q12342 CCP1YKR066C 1086 nt6.02□□□□□ -1.45
LDB17Q12342 YNR040WYNR040W 771 nt6.02□□□□□ -1.45
LDB17Q12342 GLN1YPR035W 1113 nt6.02□□□□□ -1.45
LDB17Q12342 TRP5YGL026C 2124 nt6.02□□□□□ -1.45
LDB17Q12342 HAS1YMR290C 1518 nt6.01□□□□□ -1.45
LDB17Q12342 SRP101YDR292C 1866 nt6.01□□□□□ -1.45
LDB17Q12342 SUP2tY(GUA)D 75 nt6.01□□□□□ -1.45
LDB17Q12342 SUP11tY(GUA)F1 75 nt6.01□□□□□ -1.45
LDB17Q12342 SUP6tY(GUA)F2 75 nt6.01□□□□□ -1.45
LDB17Q12342 SUP7tY(GUA)J1 75 nt6.01□□□□□ -1.45
LDB17Q12342 SUP4tY(GUA)J2 75 nt6.01□□□□□ -1.45
LDB17Q12342 SUP5tY(GUA)M1 75 nt6.01□□□□□ -1.45
LDB17Q12342 SUP8tY(GUA)M2 75 nt6.01□□□□□ -1.45
LDB17Q12342 SUP3tY(GUA)O 75 nt6.01□□□□□ -1.45
LDB17Q12342 HAP3YBL021C 435 nt6.01□□□□□ -1.45
LDB17Q12342 VPS4YPR173C 1314 nt6□□□□□ -1.45
LDB17Q12342 MRC1YCL061C 3291 nt6□□□□□ -1.45
LDB17Q12342 ADE12YNL220W 1302 nt5.99□□□□□ -1.45
LDB17Q12342 PRI2YKL045W 1587 nt5.99□□□□□ -1.45
LDB17Q12342 COX20YDR231C 618 nt5.99□□□□□ -1.45
LDB17Q12342 PHB1YGR132C 864 nt5.99□□□□□ -1.45
LDB17Q12342 MTC5YDR128W 3447 nt5.99□□□□□ -1.45
LDB17Q12342 YFL042CYFL042C 2025 nt5.98□□□□□ -1.45
LDB17Q12342 RPL7AYGL076C 735 nt5.98□□□□□ -1.45
LDB17Q12342 RPL7BYPL198W 735 nt5.98□□□□□ -1.45
LDB17Q12342 RAD3YER171W 2337 nt5.98□□□□□ -1.45
LDB17Q12342 LDB19YOR322C 2457 nt5.98□□□□□ -1.45
LDB17Q12342 PCS60YBR222C 1632 nt5.97□□□□□ -1.45
LDB17Q12342 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.97□□□□□ -1.45
LDB17Q12342 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.97□□□□□ -1.45
LDB17Q12342 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.97□□□□□ -1.45
LDB17Q12342 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt5.97□□□□□ -1.45
LDB17Q12342 RPE1YJL121C 717 nt5.97□□□□□ -1.45
LDB17Q12342 MCM3YEL032W 2916 nt5.96□□□□□ -1.45
LDB17Q12342 SPG1YGR236C 288 nt5.96□□□□□ -1.46
LDB17Q12342 MED6YHR058C 888 nt5.96□□□□□ -1.46
LDB17Q12342 CIN4YMR138W 576 nt5.96□□□□□ -1.46
LDB17Q12342 MRPS5YBR251W 924 nt5.96□□□□□ -1.46
LDB17Q12342 YMR027WYMR027W 1413 nt5.96□□□□□ -1.46
LDB17Q12342 CLB2YPR119W 1476 nt5.96□□□□□ -1.46
LDB17Q12342 DEF1YKL054C 2217 nt5.95□□□□□ -1.46
LDB17Q12342 MNS1YJR131W 1650 nt5.95□□□□□ -1.46
LDB17Q12342 VMA4YOR332W 702 nt5.95□□□□□ -1.46
LDB17Q12342 RPO26YPR187W 468 nt5.95□□□□□ -1.46
LDB17Q12342 DUG1YFR044C 1446 nt5.94□□□□□ -1.46
LDB17Q12342 YGL072CYGL072C 360 nt5.94□□□□□ -1.46
LDB17Q12342 HAP2YGL237C 798 nt5.94□□□□□ -1.46
LDB17Q12342 UBC11YOR339C 471 nt5.94□□□□□ -1.46
LDB17Q12342 PAT1YCR077C 2391 nt5.94□□□□□ -1.46
LDB17Q12342 GIT1YCR098C 1557 nt5.93□□□□□ -1.46
LDB17Q12342 GPB2YAL056W 2643 nt5.93□□□□□ -1.46
LDB17Q12342 RME1YGR044C 903 nt5.93□□□□□ -1.46
LDB17Q12342 YJU3YKL094W 942 nt5.93□□□□□ -1.46
LDB17Q12342 ECM19YLR390W 339 nt5.93□□□□□ -1.46
LDB17Q12342 RPN7YPR108W 1290 nt5.93□□□□□ -1.46
LDB17Q12342 YDR109CYDR109C 2148 nt5.92□□□□□ -1.46
LDB17Q12342 SOH1YGL127C 384 nt5.92□□□□□ -1.46
LDB17Q12342 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.92□□□□□ -1.46
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