Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 ERG1YGR175C 1491 nt5.94□□□□□ -1.46
NMD4Q12129 EFT2YDR385W 2529 nt5.93□□□□□ -1.46
NMD4Q12129 EFT1YOR133W 2529 nt5.93□□□□□ -1.46
NMD4Q12129 CDC34YDR054C 888 nt5.93□□□□□ -1.46
NMD4Q12129 ECM14YHR132C 1293 nt5.93□□□□□ -1.46
NMD4Q12129 POR2YIL114C 846 nt5.93□□□□□ -1.46
NMD4Q12129 YML131WYML131W 1098 nt5.93□□□□□ -1.46
NMD4Q12129 DOM34YNL001W 1161 nt5.93□□□□□ -1.46
NMD4Q12129 MRPL10YNL284C 969 nt5.93□□□□□ -1.46
NMD4Q12129 TSR3YOR006C 942 nt5.93□□□□□ -1.46
NMD4Q12129 RPL21AYBR191W 483 nt5.93□□□□□ -1.46
NMD4Q12129 ASN1YPR145W 1719 nt5.93□□□□□ -1.46
NMD4Q12129 MCH1YDL054C 1461 nt5.92□□□□□ -1.46
NMD4Q12129 BSC5YNR069C 1470 nt5.92□□□□□ -1.46
NMD4Q12129 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt5.92□□□□□ -1.46
NMD4Q12129 HVG1YER039C 750 nt5.92□□□□□ -1.46
NMD4Q12129 KRE9YJL174W 831 nt5.92□□□□□ -1.46
NMD4Q12129 YLR463CYLR463C 552 nt5.92□□□□□ -1.46
NMD4Q12129 YMR147WYMR147W 672 nt5.92□□□□□ -1.46
NMD4Q12129 RNH201YNL072W 924 nt5.92□□□□□ -1.46
NMD4Q12129 MOD5YOR274W 1287 nt5.92□□□□□ -1.46
NMD4Q12129 RGD1YBR260C 2001 nt5.92□□□□□ -1.46
NMD4Q12129 ACS1YAL054C 2142 nt5.92□□□□□ -1.46
NMD4Q12129 TMT1YER175C 900 nt5.91□□□□□ -1.46
NMD4Q12129 YGL235WYGL235W 537 nt5.91□□□□□ -1.46
NMD4Q12129 COA1YIL157C 594 nt5.91□□□□□ -1.46
NMD4Q12129 CIS3YJL158C 684 nt5.91□□□□□ -1.46
NMD4Q12129 YKR073CYKR073C 321 nt5.91□□□□□ -1.46
NMD4Q12129 HOS2YGL194C 1359 nt5.91□□□□□ -1.46
NMD4Q12129 ERP2YAL007C 648 nt5.9□□□□□ -1.46
NMD4Q12129 ICS3YJL077C 396 nt5.9□□□□□ -1.46
NMD4Q12129 FRE5YOR384W 2085 nt5.9□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 YEF1YEL041W 1488 nt5.9□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 UTP9YHR196W 1728 nt5.89□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 IMA5YJL216C 1746 nt5.89□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 IMA2YOL157C 1770 nt5.89□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.89□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 YIR042CYIR042C 711 nt5.89□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 RSA3YLR221C 663 nt5.89□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 YML018CYML018C 1182 nt5.89□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 CWC25YNL245C 540 nt5.89□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 FSF1YOR271C 984 nt5.89□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 RRS1YOR294W 612 nt5.89□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 REG2YBR050C 1017 nt5.89□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 YIL092WYIL092W 1902 nt5.89□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 FET3YMR058W 1911 nt5.89□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 TPO3YPR156C 1869 nt5.88□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 MAK31YCR020C-A 267 nt5.88□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 FYV1YDR024W 486 nt5.88□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 MRPL1YDR116C 858 nt5.88□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 LDS1YAL018C 978 nt5.88□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 DUS4YLR405W 1104 nt5.88□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 DSF1YEL070W 1509 nt5.88□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 YNR073CYNR073C 1509 nt5.88□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 MKC7YDR144C 1791 nt5.88□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 PPM1YDR435C 987 nt5.87□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 IMD1YAR073W 1212 nt5.87□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 GIT1YCR098C 1557 nt5.87□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 HIS7YBR248C 1659 nt5.87□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 SLX5YDL013W 1860 nt5.86□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 YCK1YHR135C 1617 nt5.86□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 RPN5YDL147W 1338 nt5.86□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 YET3YDL072C 612 nt5.86□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 YDR015CYDR015C 240 nt5.86□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 SOH1YGL127C 384 nt5.86□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt5.86□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 MED4YOR174W 855 nt5.86□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 YLL067CYLL067C 3618 nt5.86□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 APM1YPL259C 1428 nt5.85□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 YEA6YEL006W 1008 nt5.85□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 YGR291CYGR291C 222 nt5.85□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 BCY1YIL033C 1251 nt5.85□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 YML6YML025C 861 nt5.85□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 CAF40YNL288W 1122 nt5.85□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 PHA2YNL316C 1005 nt5.85□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt5.85□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 POP1YNL221C 2628 nt5.84□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 YTP1YNL237W 1380 nt5.84□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 YDL218WYDL218W 954 nt5.84□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 YDR278CYDR278C 318 nt5.84□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 GPI11YDR302W 660 nt5.84□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 YHL018WYHL018W 363 nt5.84□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 TSA1YML028W 591 nt5.84□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 AST1YBL069W 1290 nt5.84□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 MRPS16YPL013C 366 nt5.84□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 PRE2YPR103W 864 nt5.84□□□□□ -1.47
NMD4Q12129 WHI2YOR043W 1461 nt5.83□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 ICL1YER065C 1674 nt5.83□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 TIM22YDL217C 624 nt5.83□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 GCV3YAL044C 513 nt5.83□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt5.83□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 HMT1YBR034C 1047 nt5.83□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 SCP1YOR367W 603 nt5.83□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 DIT1YDR403W 1611 nt5.83□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 RMD9YGL107C 1941 nt5.83□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 KTR5YNL029C 1569 nt5.82□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 HMLALPHA1YCL066W 528 nt5.82□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 MATALPHA1YCR040W 528 nt5.82□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 TRP5YGL026C 2124 nt5.82□□□□□ -1.48
NMD4Q12129 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt5.82□□□□□ -1.48
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