Protein–RNA interactions for Protein: Q07660

BRE4, Protein BRE4, yeastyeast

Predictions only

Length 1,125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRE4Q07660 RUF20RUF20 443 nt6.61□□□□□ -1.35
BRE4Q07660 YOL050CYOL050C 321 nt6.61□□□□□ -1.35
BRE4Q07660 YOL106WYOL106W 354 nt6.61□□□□□ -1.35
BRE4Q07660 YOR062CYOR062C 807 nt6.61□□□□□ -1.35
BRE4Q07660 YBR027CYBR027C 333 nt6.61□□□□□ -1.35
BRE4Q07660 ATG7YHR171W 1893 nt6.61□□□□□ -1.35
BRE4Q07660 TDP1YBR223C 1635 nt6.61□□□□□ -1.35
BRE4Q07660 RIX7YLL034C 2514 nt6.6□□□□□ -1.35
BRE4Q07660 YDR042CYDR042C 603 nt6.6□□□□□ -1.35
BRE4Q07660 YDR336WYDR336W 945 nt6.6□□□□□ -1.35
BRE4Q07660 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt6.6□□□□□ -1.35
BRE4Q07660 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt6.6□□□□□ -1.35
BRE4Q07660 DRN1YGR093W 1524 nt6.6□□□□□ -1.35
BRE4Q07660 IRC5YFR038W 2562 nt6.6□□□□□ -1.35
BRE4Q07660 PMT3YOR321W 2262 nt6.59□□□□□ -1.35
BRE4Q07660 YGL235WYGL235W 537 nt6.59□□□□□ -1.35
BRE4Q07660 KSS1YGR040W 1107 nt6.59□□□□□ -1.35
BRE4Q07660 HPM1YIL110W 1134 nt6.59□□□□□ -1.35
BRE4Q07660 IRC9YJL142C 393 nt6.59□□□□□ -1.35
BRE4Q07660 OPI8YKR035C 642 nt6.59□□□□□ -1.35
BRE4Q07660 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt6.59□□□□□ -1.35
BRE4Q07660 YNL217WYNL217W 981 nt6.59□□□□□ -1.35
BRE4Q07660 YNR014WYNR014W 639 nt6.59□□□□□ -1.35
BRE4Q07660 LOA1YPR139C 903 nt6.59□□□□□ -1.35
BRE4Q07660 YPR153WYPR153W 423 nt6.59□□□□□ -1.35
BRE4Q07660 PSP2YML017W 1782 nt6.59□□□□□ -1.35
BRE4Q07660 PGI1YBR196C 1665 nt6.58□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 SSU1YPL092W 1377 nt6.58□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt6.58□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 MRPL49YJL096W 486 nt6.58□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 HMS2YJR147W 1077 nt6.58□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 YKR051WYKR051W 1257 nt6.58□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 RRP36YOR287C 903 nt6.58□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 SCP1YOR367W 603 nt6.58□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 snR37snR37 386 nt6.58□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 SEC18YBR080C 2277 nt6.58□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 PHO3YBR092C 1404 nt6.58□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 SGE1YPR198W 1632 nt6.58□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 YPL245WYPL245W 1365 nt6.57□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 YLL058WYLL058W 1728 nt6.57□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 RHO3YIL118W 696 nt6.57□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 MPM1YJL066C 759 nt6.57□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 IFA38YBR159W 1044 nt6.57□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 SPS1YDR523C 1473 nt6.57□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 PCL2YDL127W 927 nt6.56□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 PEF1YGR058W 1008 nt6.56□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 YGR291CYGR291C 222 nt6.56□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 ADE1YAR015W 921 nt6.56□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 YML094C-AYML094C-A 402 nt6.56□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 YGP1YNL160W 1065 nt6.56□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt6.56□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 YNL247WYNL247W 2304 nt6.56□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 NUP53YMR153W 1428 nt6.56□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 FCY22YER060W-A 1593 nt6.56□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 AVO1YOL078W 3531 nt6.55□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 CLD1YGR110W 1338 nt6.55□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 YDR124WYDR124W 975 nt6.55□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 DUO1YGL061C 744 nt6.55□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 COG2YGR120C 789 nt6.55□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 SAY1YGR263C 1275 nt6.55□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 YHR112CYHR112C 1137 nt6.55□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt6.55□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 CMS1YLR003C 876 nt6.55□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt6.55□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 YLR365WYLR365W 333 nt6.55□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 BLS1YLR408C 369 nt6.55□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 RPL5YPL131W 894 nt6.55□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 YPR127WYPR127W 1038 nt6.55□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 CHL4YDR254W 1377 nt6.55□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 NOG2YNR053C 1461 nt6.54□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 APM4YOL062C 1476 nt6.54□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 SLA2YNL243W 2907 nt6.54□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 SPO77YLR341W 1434 nt6.54□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 YFT2YDR319C 825 nt6.54□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 YEA6YEL006W 1008 nt6.54□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 JNM1YMR294W 1122 nt6.54□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 CPT1YNL130C 1182 nt6.54□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 HRT1YOL133W 366 nt6.54□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 BUD21YOR078W 645 nt6.54□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 POC4YPL144W 447 nt6.54□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 MST1YKL194C 1389 nt6.54□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 PNS1YOR161C 1620 nt6.54□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 MHP1YJL042W 4197 nt6.54□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 AVT4YNL101W 2142 nt6.53□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 UBP8YMR223W 1416 nt6.53□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 HAC1YFL031W 717 nt6.53□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 TPK1YJL164C 1194 nt6.53□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 RDN5-2RDN5-2 119 nt6.53□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 RDN5-3RDN5-3 119 nt6.53□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 RDN5-4RDN5-4 119 nt6.53□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 RDN5-5RDN5-5 119 nt6.53□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 YPL136WYPL136W 369 nt6.53□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 SRP101YDR292C 1866 nt6.53□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 GUS1YGL245W 2127 nt6.53□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 HFI1YPL254W 1467 nt6.53□□□□□ -1.36
BRE4Q07660 RRP14YKL082C 1305 nt6.52□□□□□ -1.37
BRE4Q07660 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt6.52□□□□□ -1.37
BRE4Q07660 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt6.52□□□□□ -1.37
BRE4Q07660 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt6.52□□□□□ -1.37
BRE4Q07660 SUP51tL(UAA)J 84 nt6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 58 ms