Protein–RNA interactions for Protein: Q04930

CRF1, Transcription factor CRF1, yeastyeast

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CRF1Q04930 SUP17tS(UGA)I 82 nt6.76□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 SUP16tS(UGA)P 82 nt6.76□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 YMR010WYMR010W 1218 nt6.76□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 RPS9AYPL081W 594 nt6.76□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 PYC2YBR218C 3543 nt6.75□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 YTP1YNL237W 1380 nt6.75□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 GGC1YDL198C 903 nt6.75□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 YDR154CYDR154C 351 nt6.75□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 YRA1YDR381W 681 nt6.75□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt6.75□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 YLR118CYLR118C 684 nt6.75□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 YLR194CYLR194C 765 nt6.75□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 YNR042WYNR042W 429 nt6.75□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 GAA1YLR088W 1845 nt6.75□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 ASN2YGR124W 1719 nt6.75□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 YDL114WYDL114W 927 nt6.74□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 YGR182CYGR182C 354 nt6.74□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt6.74□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt6.74□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt6.74□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt6.74□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt6.74□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt6.74□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 DAL82YNL314W 768 nt6.74□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 BDF2YDL070W 1917 nt6.74□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 NUD1YOR373W 2556 nt6.73□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 YLR283WYLR283W 945 nt6.73□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 YCR061WYCR061W 1896 nt6.73□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 GUD1YDL238C 1470 nt6.73□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 YOS9YDR057W 1629 nt6.72□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 YHC3YJL059W 1227 nt6.72□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 TIM54YJL054W 1437 nt6.72□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 VID30YGL227W 2877 nt6.72□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 SHM1YBR263W 1473 nt6.72□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 GLE1YDL207W 1617 nt6.72□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 AMD1YML035C 2433 nt6.71□□□□□ -1.33
CRF1Q04930 GPA1YHR005C 1419 nt6.71□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 TRR1YDR353W 960 nt6.71□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 YGR176WYGR176W 348 nt6.71□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 YHR145CYHR145C 357 nt6.71□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 YKL151CYKL151C 1014 nt6.71□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 OPI8YKR035C 642 nt6.71□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 GYP8YFL027C 1494 nt6.7□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 CIT3YPR001W 1461 nt6.7□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 PDR18YNR070W 4002 nt6.69□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 CTF3YLR381W 2202 nt6.69□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 MHR1YDR296W 681 nt6.69□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 DMA1YHR115C 1251 nt6.69□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 COX5AYNL052W 462 nt6.69□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 KKQ8YKL168C 2175 nt6.69□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 VRP1YLR337C 2454 nt6.68□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt6.68□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 ORM1YGR038W 669 nt6.68□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 QNS1YHR074W 2145 nt6.68□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 SES1YDR023W 1389 nt6.68□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 YAP1801YHR161C 1914 nt6.68□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 YEA6YEL006W 1008 nt6.67□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 BSC4YNL269W 396 nt6.67□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 PGM1YKL127W 1713 nt6.67□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 YIL108WYIL108W 2091 nt6.67□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 RPT3YDR394W 1287 nt6.66□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt6.66□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 YNL019CYNL019C 855 nt6.66□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 YNL033WYNL033W 855 nt6.66□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 HMT1YBR034C 1047 nt6.66□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 YBR124WYBR124W 360 nt6.66□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 NMD5YJR132W 3147 nt6.65□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 APE3YBR286W 1614 nt6.65□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt6.65□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 PRO3YER023W 861 nt6.65□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt6.65□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 DJP1YIR004W 1299 nt6.65□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 YIR042CYIR042C 711 nt6.65□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt6.65□□□□□ -1.34
CRF1Q04930 SLO1YER180C-A 258 nt6.64□□□□□ -1.35
CRF1Q04930 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt6.64□□□□□ -1.35
CRF1Q04930 YJR115WYJR115W 510 nt6.64□□□□□ -1.35
CRF1Q04930 ATO2YNR002C 849 nt6.64□□□□□ -1.35
CRF1Q04930 PRP2YNR011C 2631 nt6.64□□□□□ -1.35
CRF1Q04930 RTT106YNL206C 1368 nt6.64□□□□□ -1.35
CRF1Q04930 HSX1tR(CCU)J 72 nt6.63□□□□□ -1.35
CRF1Q04930 ORC5YNL261W 1440 nt6.63□□□□□ -1.35
CRF1Q04930 NOB1YOR056C 1380 nt6.63□□□□□ -1.35
CRF1Q04930 YPL062WYPL062W 405 nt6.63□□□□□ -1.35
CRF1Q04930 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt6.62□□□□□ -1.35
CRF1Q04930 MCM3YEL032W 2916 nt6.61□□□□□ -1.35
CRF1Q04930 YDR109CYDR109C 2148 nt6.61□□□□□ -1.35
CRF1Q04930 XBP1YIL101C 1944 nt6.61□□□□□ -1.35
CRF1Q04930 MSB3YNL293W 1902 nt6.61□□□□□ -1.35
CRF1Q04930 SHO1YER118C 1104 nt6.61□□□□□ -1.35
CRF1Q04930 TFS1YLR178C 660 nt6.61□□□□□ -1.35
CRF1Q04930 YNL296WYNL296W 315 nt6.61□□□□□ -1.35
CRF1Q04930 PIN2YOR104W 849 nt6.61□□□□□ -1.35
CRF1Q04930 KIN1YDR122W 3195 nt6.61□□□□□ -1.35
CRF1Q04930 NDC1YML031W 1968 nt6.6□□□□□ -1.35
CRF1Q04930 RPT6YGL048C 1218 nt6.6□□□□□ -1.35
CRF1Q04930 HGH1YGR187C 1185 nt6.6□□□□□ -1.35
CRF1Q04930 CDC16YKL022C 2523 nt6.6□□□□□ -1.35
CRF1Q04930 COA1YIL157C 594 nt6.59□□□□□ -1.35
CRF1Q04930 APS3YJL024C 585 nt6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25 ms