Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 AVO2YMR068W 1281 nt6.11□□□□□ -1.43
SEC28P40509 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt6.11□□□□□ -1.43
SEC28P40509 YOL163WYOL163W 510 nt6.11□□□□□ -1.43
SEC28P40509 GLN1YPR035W 1113 nt6.11□□□□□ -1.43
SEC28P40509 YPR123CYPR123C 435 nt6.11□□□□□ -1.43
SEC28P40509 IFA38YBR159W 1044 nt6.11□□□□□ -1.43
SEC28P40509 PET112YBL080C 1626 nt6.1□□□□□ -1.43
SEC28P40509 GPT2YKR067W 2232 nt6.1□□□□□ -1.43
SEC28P40509 DPB2YPR175W 2070 nt6.1□□□□□ -1.43
SEC28P40509 YTP1YNL237W 1380 nt6.1□□□□□ -1.43
SEC28P40509 COX9YDL067C 180 nt6.1□□□□□ -1.43
SEC28P40509 TSA1YML028W 591 nt6.1□□□□□ -1.43
SEC28P40509 YMR295CYMR295C 594 nt6.1□□□□□ -1.43
SEC28P40509 PGK1YCR012W 1251 nt6.09□□□□□ -1.43
SEC28P40509 MAK31YCR020C-A 267 nt6.09□□□□□ -1.43
SEC28P40509 HVG1YER039C 750 nt6.09□□□□□ -1.43
SEC28P40509 MSP1YGR028W 1089 nt6.09□□□□□ -1.43
SEC28P40509 MRS1YIR021W 1092 nt6.09□□□□□ -1.43
SEC28P40509 SAC6YDR129C 1929 nt6.09□□□□□ -1.44
SEC28P40509 FAT3YKL187C 2253 nt6.09□□□□□ -1.44
SEC28P40509 WHI2YOR043W 1461 nt6.09□□□□□ -1.44
SEC28P40509 BPL1YDL141W 2073 nt6.08□□□□□ -1.44
SEC28P40509 ECM7YLR443W 1347 nt6.08□□□□□ -1.44
SEC28P40509 TEP1YNL128W 1305 nt6.08□□□□□ -1.44
SEC28P40509 YET3YDL072C 612 nt6.08□□□□□ -1.44
SEC28P40509 ICT1YLR099C 1185 nt6.08□□□□□ -1.44
SEC28P40509 CAF40YNL288W 1122 nt6.08□□□□□ -1.44
SEC28P40509 MRPS12YNR036C 462 nt6.08□□□□□ -1.44
SEC28P40509 YBR124WYBR124W 360 nt6.08□□□□□ -1.44
SEC28P40509 QNS1YHR074W 2145 nt6.08□□□□□ -1.44
SEC28P40509 YHL017WYHL017W 1599 nt6.07□□□□□ -1.44
SEC28P40509 YDR015CYDR015C 240 nt6.07□□□□□ -1.44
SEC28P40509 DOM34YNL001W 1161 nt6.07□□□□□ -1.44
SEC28P40509 RNH201YNL072W 924 nt6.07□□□□□ -1.44
SEC28P40509 MRPL10YNL284C 969 nt6.07□□□□□ -1.44
SEC28P40509 MRPS16YPL013C 366 nt6.07□□□□□ -1.44
SEC28P40509 GUD1YDL238C 1470 nt6.07□□□□□ -1.44
SEC28P40509 MNN5YJL186W 1761 nt6.06□□□□□ -1.44
SEC28P40509 PPM1YDR435C 987 nt6.06□□□□□ -1.44
SEC28P40509 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt6.06□□□□□ -1.44
SEC28P40509 HAP3YBL021C 435 nt6.06□□□□□ -1.44
SEC28P40509 YML131WYML131W 1098 nt6.06□□□□□ -1.44
SEC28P40509 YHM2YMR241W 945 nt6.06□□□□□ -1.44
SEC28P40509 AVO1YOL078W 3531 nt6.06□□□□□ -1.44
SEC28P40509 PAT1YCR077C 2391 nt6.06□□□□□ -1.44
SEC28P40509 SET5YHR207C 1581 nt6.06□□□□□ -1.44
SEC28P40509 COX17YLL009C 210 nt6.05□□□□□ -1.44
SEC28P40509 PZF1YPR186C 1290 nt6.05□□□□□ -1.44
SEC28P40509 TIM22YDL217C 624 nt6.04□□□□□ -1.44
SEC28P40509 CDC34YDR054C 888 nt6.04□□□□□ -1.44
SEC28P40509 YEL068CYEL068C 333 nt6.04□□□□□ -1.44
SEC28P40509 PDB1YBR221C 1101 nt6.04□□□□□ -1.44
SEC28P40509 KTR5YNL029C 1569 nt6.04□□□□□ -1.44
SEC28P40509 CRZ1YNL027W 2037 nt6.04□□□□□ -1.44
SEC28P40509 ICL1YER065C 1674 nt6.04□□□□□ -1.44
SEC28P40509 GEX1YCL073C 1848 nt6.04□□□□□ -1.44
SEC28P40509 GEX2YKR106W 1848 nt6.04□□□□□ -1.44
SEC28P40509 PFK2YMR205C 2880 nt6.04□□□□□ -1.44
SEC28P40509 MKC7YDR144C 1791 nt6.03□□□□□ -1.44
SEC28P40509 KKQ8YKL168C 2175 nt6.03□□□□□ -1.44
SEC28P40509 CNM67YNL225C 1746 nt6.03□□□□□ -1.44
SEC28P40509 YOL036WYOL036W 2286 nt6.03□□□□□ -1.44
SEC28P40509 YDL218WYDL218W 954 nt6.03□□□□□ -1.44
SEC28P40509 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt6.03□□□□□ -1.44
SEC28P40509 FSF1YOR271C 984 nt6.03□□□□□ -1.44
SEC28P40509 MRP51YPL118W 1035 nt6.03□□□□□ -1.44
SEC28P40509 DAP1YPL170W 459 nt6.03□□□□□ -1.44
SEC28P40509 RPN7YPR108W 1290 nt6.03□□□□□ -1.44
SEC28P40509 PYC2YBR218C 3543 nt6.03□□□□□ -1.44
SEC28P40509 DSF1YEL070W 1509 nt6.03□□□□□ -1.44
SEC28P40509 YNR073CYNR073C 1509 nt6.03□□□□□ -1.44
SEC28P40509 MDM31YHR194W 1740 nt6.02□□□□□ -1.45
SEC28P40509 UTP4YDR324C 2331 nt6.02□□□□□ -1.45
SEC28P40509 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt6.02□□□□□ -1.45
SEC28P40509 YLR184WYLR184W 348 nt6.02□□□□□ -1.45
SEC28P40509 YLR463CYLR463C 552 nt6.02□□□□□ -1.45
SEC28P40509 SWP1YMR149W 861 nt6.02□□□□□ -1.45
SEC28P40509 YPR114WYPR114W 948 nt6.02□□□□□ -1.45
SEC28P40509 GUP2YPL189W 1830 nt6.02□□□□□ -1.45
SEC28P40509 STE13YOR219C 2796 nt6.01□□□□□ -1.45
SEC28P40509 PRP24YMR268C 1335 nt6.01□□□□□ -1.45
SEC28P40509 LSG1YGL099W 1923 nt6.01□□□□□ -1.45
SEC28P40509 AFG1YEL052W 1530 nt6.01□□□□□ -1.45
SEC28P40509 YML6YML025C 861 nt6.01□□□□□ -1.45
SEC28P40509 YML083CYML083C 1257 nt6.01□□□□□ -1.45
SEC28P40509 YNL108CYNL108C 813 nt6.01□□□□□ -1.45
SEC28P40509 APM4YOL062C 1476 nt6.01□□□□□ -1.45
SEC28P40509 PDR18YNR070W 4002 nt6.01□□□□□ -1.45
SEC28P40509 EFM3YJR129C 1020 nt6□□□□□ -1.45
SEC28P40509 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.99□□□□□ -1.45
SEC28P40509 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.99□□□□□ -1.45
SEC28P40509 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.99□□□□□ -1.45
SEC28P40509 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.99□□□□□ -1.45
SEC28P40509 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.99□□□□□ -1.45
SEC28P40509 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.99□□□□□ -1.45
SEC28P40509 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.99□□□□□ -1.45
SEC28P40509 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.99□□□□□ -1.45
SEC28P40509 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.99□□□□□ -1.45
SEC28P40509 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.99□□□□□ -1.45
SEC28P40509 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.99□□□□□ -1.45
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