Protein–RNA interactions for Protein: P0C2J7

TY4B-H, Transposon Ty4-H Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY4B-HP0C2J7 VRP1YLR337C 2454 nt7.45□□□□□ -1.22
TY4B-HP0C2J7 YAP1801YHR161C 1914 nt7.44□□□□□ -1.22
TY4B-HP0C2J7 SLO1YER180C-A 258 nt7.44□□□□□ -1.22
TY4B-HP0C2J7 COA1YIL157C 594 nt7.44□□□□□ -1.22
TY4B-HP0C2J7 PPS1YBR276C 2424 nt7.44□□□□□ -1.22
TY4B-HP0C2J7 SES1YDR023W 1389 nt7.44□□□□□ -1.22
TY4B-HP0C2J7 SHE10YGL228W 1734 nt7.44□□□□□ -1.22
TY4B-HP0C2J7 SSK22YCR073C 3996 nt7.44□□□□□ -1.22
TY4B-HP0C2J7 HIS7YBR248C 1659 nt7.43□□□□□ -1.22
TY4B-HP0C2J7 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt7.43□□□□□ -1.22
TY4B-HP0C2J7 RRN10YBL025W 438 nt7.43□□□□□ -1.22
TY4B-HP0C2J7 AGP2YBR132C 1791 nt7.43□□□□□ -1.22
TY4B-HP0C2J7 YJR115WYJR115W 510 nt7.43□□□□□ -1.22
TY4B-HP0C2J7 YIL177CYIL177C 5277 nt7.42□□□□□ -1.22
TY4B-HP0C2J7 YPR204WYPR204W 3099 nt7.41□□□□□ -1.22
TY4B-HP0C2J7 GGC1YDL198C 903 nt7.41□□□□□ -1.22
TY4B-HP0C2J7 DMA1YHR115C 1251 nt7.41□□□□□ -1.22
TY4B-HP0C2J7 SAM4YPL273W 978 nt7.41□□□□□ -1.22
TY4B-HP0C2J7 FRS2YFL022C 1512 nt7.41□□□□□ -1.22
TY4B-HP0C2J7 ARG81YML099C 2643 nt7.41□□□□□ -1.22
TY4B-HP0C2J7 NOB1YOR056C 1380 nt7.41□□□□□ -1.22
TY4B-HP0C2J7 TAL1YLR354C 1008 nt7.41□□□□□ -1.22
TY4B-HP0C2J7 YNR042WYNR042W 429 nt7.41□□□□□ -1.22
TY4B-HP0C2J7 PRP46YPL151C 1356 nt7.4□□□□□ -1.22
TY4B-HP0C2J7 YML082WYML082W 1950 nt7.4□□□□□ -1.22
TY4B-HP0C2J7 SUP19tS(UGA)E 82 nt7.4□□□□□ -1.23
TY4B-HP0C2J7 SUP17tS(UGA)I 82 nt7.4□□□□□ -1.23
TY4B-HP0C2J7 SUP16tS(UGA)P 82 nt7.4□□□□□ -1.23
TY4B-HP0C2J7 BCY1YIL033C 1251 nt7.4□□□□□ -1.23
TY4B-HP0C2J7 RQC1YDR333C 2172 nt7.4□□□□□ -1.23
TY4B-HP0C2J7 GIR2YDR152W 798 nt7.39□□□□□ -1.23
TY4B-HP0C2J7 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt7.39□□□□□ -1.23
TY4B-HP0C2J7 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt7.39□□□□□ -1.23
TY4B-HP0C2J7 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt7.39□□□□□ -1.23
TY4B-HP0C2J7 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt7.39□□□□□ -1.23
TY4B-HP0C2J7 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt7.39□□□□□ -1.23
TY4B-HP0C2J7 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt7.39□□□□□ -1.23
TY4B-HP0C2J7 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt7.39□□□□□ -1.23
TY4B-HP0C2J7 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt7.39□□□□□ -1.23
TY4B-HP0C2J7 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt7.39□□□□□ -1.23
TY4B-HP0C2J7 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt7.39□□□□□ -1.23
TY4B-HP0C2J7 NPA3YJR072C 1158 nt7.39□□□□□ -1.23
TY4B-HP0C2J7 ALR1YOL130W 2580 nt7.39□□□□□ -1.23
TY4B-HP0C2J7 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt7.38□□□□□ -1.23
TY4B-HP0C2J7 PRO3YER023W 861 nt7.38□□□□□ -1.23
TY4B-HP0C2J7 TIM54YJL054W 1437 nt7.38□□□□□ -1.23
TY4B-HP0C2J7 TOM71YHR117W 1920 nt7.38□□□□□ -1.23
TY4B-HP0C2J7 NDC1YML031W 1968 nt7.37□□□□□ -1.23
TY4B-HP0C2J7 YRA1YDR381W 681 nt7.37□□□□□ -1.23
TY4B-HP0C2J7 YKL151CYKL151C 1014 nt7.37□□□□□ -1.23
TY4B-HP0C2J7 ATP14YLR295C 375 nt7.37□□□□□ -1.23
TY4B-HP0C2J7 SMK1YPR054W 1167 nt7.37□□□□□ -1.23
TY4B-HP0C2J7 ECM38YLR299W 1983 nt7.37□□□□□ -1.23
TY4B-HP0C2J7 YEA6YEL006W 1008 nt7.36□□□□□ -1.23
TY4B-HP0C2J7 GLE1YDL207W 1617 nt7.35□□□□□ -1.23
TY4B-HP0C2J7 PRM10YJL108C 1152 nt7.35□□□□□ -1.23
TY4B-HP0C2J7 MOD5YOR274W 1287 nt7.35□□□□□ -1.23
TY4B-HP0C2J7 COX26YDR119W-A 201 nt7.34□□□□□ -1.24
TY4B-HP0C2J7 TDH3YGR192C 999 nt7.34□□□□□ -1.24
TY4B-HP0C2J7 DUS4YLR405W 1104 nt7.34□□□□□ -1.24
TY4B-HP0C2J7 RPT3YDR394W 1287 nt7.33□□□□□ -1.24
TY4B-HP0C2J7 YHL017WYHL017W 1599 nt7.32□□□□□ -1.24
TY4B-HP0C2J7 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt7.31□□□□□ -1.24
TY4B-HP0C2J7 TFS1YLR178C 660 nt7.31□□□□□ -1.24
TY4B-HP0C2J7 THI21YPL258C 1656 nt7.31□□□□□ -1.24
TY4B-HP0C2J7 YOR389WYOR389W 1875 nt7.3□□□□□ -1.24
TY4B-HP0C2J7 CIS3YJL158C 684 nt7.3□□□□□ -1.24
TY4B-HP0C2J7 RER2YBR002C 861 nt7.3□□□□□ -1.24
TY4B-HP0C2J7 RPT6YGL048C 1218 nt7.29□□□□□ -1.24
TY4B-HP0C2J7 GAT3YLR013W 426 nt7.29□□□□□ -1.24
TY4B-HP0C2J7 YOR318CYOR318C 306 nt7.29□□□□□ -1.24
TY4B-HP0C2J7 CBC2YPL178W 627 nt7.29□□□□□ -1.24
TY4B-HP0C2J7 YHR131CYHR131C 2553 nt7.29□□□□□ -1.24
TY4B-HP0C2J7 CWC21YDR482C 408 nt7.28□□□□□ -1.24
TY4B-HP0C2J7 YUR1YJL139C 1287 nt7.28□□□□□ -1.24
TY4B-HP0C2J7 ARP3YJR065C 1350 nt7.28□□□□□ -1.24
TY4B-HP0C2J7 CTF8YHR191C 402 nt7.27□□□□□ -1.25
TY4B-HP0C2J7 COS9YKL219W 1224 nt7.27□□□□□ -1.25
TY4B-HP0C2J7 MNN5YJL186W 1761 nt7.27□□□□□ -1.25
TY4B-HP0C2J7 CBF1YJR060W 1056 nt7.27□□□□□ -1.25
TY4B-HP0C2J7 ECM15YBL001C 315 nt7.27□□□□□ -1.25
TY4B-HP0C2J7 GAT1YFL021W 1533 nt7.25□□□□□ -1.25
TY4B-HP0C2J7 MMP1YLL061W 1752 nt7.25□□□□□ -1.25
TY4B-HP0C2J7 DIA3YDL024C 1407 nt7.24□□□□□ -1.25
TY4B-HP0C2J7 COX9YDL067C 180 nt7.24□□□□□ -1.25
TY4B-HP0C2J7 RPS2YGL123W 765 nt7.24□□□□□ -1.25
TY4B-HP0C2J7 EFM3YJR129C 1020 nt7.24□□□□□ -1.25
TY4B-HP0C2J7 PGA3YML125C 939 nt7.24□□□□□ -1.25
TY4B-HP0C2J7 PHO8YDR481C 1701 nt7.24□□□□□ -1.25
TY4B-HP0C2J7 LYS12YIL094C 1116 nt7.24□□□□□ -1.25
TY4B-HP0C2J7 SER1YOR184W 1188 nt7.23□□□□□ -1.25
TY4B-HP0C2J7 IFA38YBR159W 1044 nt7.23□□□□□ -1.25
TY4B-HP0C2J7 YLR118CYLR118C 684 nt7.22□□□□□ -1.25
TY4B-HP0C2J7 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt7.22□□□□□ -1.25
TY4B-HP0C2J7 YOL163WYOL163W 510 nt7.22□□□□□ -1.25
TY4B-HP0C2J7 PHO3YBR092C 1404 nt7.22□□□□□ -1.25
TY4B-HP0C2J7 UTR4YEL038W 684 nt7.22□□□□□ -1.25
TY4B-HP0C2J7 AFG2YLR397C 2343 nt7.21□□□□□ -1.25
TY4B-HP0C2J7 YJU3YKL094W 942 nt7.21□□□□□ -1.26
TY4B-HP0C2J7 PIN2YOR104W 849 nt7.21□□□□□ -1.26
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