Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC24CP53992 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC24CP53992 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC24CP53992 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC24CP53992 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC24CP53992 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC24CP53992 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC24CP53992 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC24CP53992 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC24CP53992 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC24CP53992 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC24CP53992 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC24CP53992 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC24CP53992 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC24CP53992 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC24CP53992 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC24CP53992 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC24CP53992 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC24CP53992 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC24CP53992 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SEC24CP53992 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms