Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FBXO38Q6PIJ6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO38Q6PIJ6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO38Q6PIJ6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms