Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.432e-11■■■■■ 54.4
PCBP2Q15366 C3-204ENST00000594936 625 ntTSL 215.68■□□□□ 0.14e-39■■■■■ 54.4
PCBP2Q15366 PCBP2-214ENST00000549272 445 ntTSL 25.6□□□□□ -1.517e-9■■■■■ 54.3
PCBP2Q15366 CPSF7-213ENST00000494016 656 ntTSL 25.88□□□□□ -1.474e-19■■■■■ 54.3
PCBP2Q15366 SH3D21-202ENST00000474766 2043 ntTSL 1 (best)20.58■□□□□ 0.893e-11■■■■■ 54.3
PCBP2Q15366 ATXN2L-210ENST00000562867 609 ntTSL 217.08■□□□□ 0.327e-8■■■■■ 54.3
PCBP2Q15366 SH3D21-203ENST00000480549 3182 ntTSL 216.45■□□□□ 0.223e-11■■■■■ 54.3
PCBP2Q15366 HNRNPUL1-213ENST00000599614 2447 ntTSL 514.92□□□□□ -0.022e-13■■■■■ 54.3
PCBP2Q15366 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.278e-7■■■■■ 54.2
PCBP2Q15366 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.338e-7■■■■■ 54.2
PCBP2Q15366 ZRANB3-203ENST00000403017 4130 ntTSL 55.69□□□□□ -1.58e-7■■■■■ 54.2
PCBP2Q15366 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.738e-7■■■■■ 54.2
PCBP2Q15366 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.132e-24■■■■■ 54.2
PCBP2Q15366 USP22-209ENST00000579645 1906 ntTSL 519.02■□□□□ 0.641e-8■■■■■ 54.2
PCBP2Q15366 USP22-211ENST00000584538 554 ntTSL 411.33□□□□□ -0.61e-8■■■■■ 54.2
PCBP2Q15366 UGP2-223ENST00000493222 864 ntTSL 319.22■□□□□ 0.677e-16■■■■■ 54.2
PCBP2Q15366 UGP2-227ENST00000497510 722 ntTSL 418.89■□□□□ 0.617e-16■■■■■ 54.2
PCBP2Q15366 UGP2-213ENST00000482668 645 ntTSL 317.6■□□□□ 0.417e-16■■■■■ 54.2
PCBP2Q15366 UGP2-205ENST00000466642 1023 ntTSL 417.13■□□□□ 0.337e-16■■■■■ 54.2
PCBP2Q15366 UGP2-219ENST00000487469 1015 ntTSL 517.05■□□□□ 0.327e-16■■■■■ 54.2
PCBP2Q15366 UGP2-215ENST00000483461 495 ntTSL 417.04■□□□□ 0.327e-16■■■■■ 54.2
PCBP2Q15366 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.297e-16■■■■■ 54.2
PCBP2Q15366 UGP2-214ENST00000483108 598 ntTSL 415.99■□□□□ 0.157e-16■■■■■ 54.2
PCBP2Q15366 UGP2-206ENST00000467400 717 ntTSL 515.2■□□□□ 0.027e-16■■■■■ 54.2
PCBP2Q15366 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.217e-16■■■■■ 54.2
PCBP2Q15366 CSK-208ENST00000567123 556 ntTSL 414.09□□□□□ -0.154e-28■■■■■ 54.1
PCBP2Q15366 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 04e-7■■■■■ 54.1
PCBP2Q15366 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.594e-7■■■■■ 54.1
PCBP2Q15366 RBPMS-218ENST00000523104 453 ntTSL 39.54□□□□□ -0.882e-27■■■■■ 54
PCBP2Q15366 RBPMS-213ENST00000521370 645 ntTSL 36.63□□□□□ -1.352e-27■■■■■ 54
PCBP2Q15366 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.244e-13■■■■■ 54
PCBP2Q15366 ABCA11P-203ENST00000507854 1503 ntTSL 1 (best)10.51□□□□□ -0.734e-13■■■■■ 54
PCBP2Q15366 ABCA11P-201ENST00000451020 1815 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.994e-13■■■■■ 54
PCBP2Q15366 ZNF721-206ENST00000515578 1679 ntTSL 1 (best)8.67□□□□□ -1.024e-13■■■■■ 54
PCBP2Q15366 ZNF721-203ENST00000506646 935 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.234e-13■■■■■ 54
PCBP2Q15366 ABCA11P-204ENST00000514396 1423 ntTSL 1 (best)7.17□□□□□ -1.264e-13■■■■■ 54
PCBP2Q15366 ZNF721-202ENST00000505900 664 ntTSL 1 (best)6.73□□□□□ -1.334e-13■■■■■ 54
PCBP2Q15366 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.474e-13■■■■■ 54
PCBP2Q15366 ZNF721-204ENST00000507078 355 ntTSL 52.87□□□□□ -1.954e-13■■■■■ 54
PCBP2Q15366 PHLPP1-203ENST00000497351 572 ntTSL 410.58□□□□□ -0.723e-7■■■■■ 54
PCBP2Q15366 PRKCZ-208ENST00000468310 690 ntTSL 519.9■□□□□ 0.785e-7■■■■■ 54
PCBP2Q15366 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.284e-30■■■■■ 54
PCBP2Q15366 ITPK1-203ENST00000553452 609 ntTSL 523.77■■□□□ 1.44e-7■■■■■ 54
PCBP2Q15366 ITPK1-206ENST00000554999 667 ntTSL 513.43□□□□□ -0.264e-7■■■■■ 54
PCBP2Q15366 ITPK1-209ENST00000556185 691 ntTSL 513.01□□□□□ -0.334e-7■■■■■ 54
PCBP2Q15366 ITPK1-212ENST00000557309 770 ntTSL 312.54□□□□□ -0.44e-7■■■■■ 54
PCBP2Q15366 ITPK1-208ENST00000555553 727 ntTSL 38.94□□□□□ -0.984e-7■■■■■ 54
PCBP2Q15366 RNF13-214ENST00000490631 583 ntTSL 34.58□□□□□ -1.685e-11■■■■■ 54
PCBP2Q15366 KIF2A-207ENST00000509663 759 ntTSL 318.32■□□□□ 0.525e-8■■■■■ 53.9
PCBP2Q15366 ATP2A2-203ENST00000377685 5702 ntTSL 521■□□□□ 0.956e-9■■■■■ 53.9
PCBP2Q15366 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.46e-9■■■■■ 53.9
PCBP2Q15366 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.046e-9■■■■■ 53.9
PCBP2Q15366 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.733e-8■■■■■ 53.9
PCBP2Q15366 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.143e-8■■■■■ 53.9
PCBP2Q15366 HNRNPA3-202ENST00000411529 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.823e-8■■■■■ 53.9
PCBP2Q15366 DEDD2-208ENST00000598415 715 ntTSL 221.41■■□□□ 1.023e-10■■■■■ 53.8
PCBP2Q15366 DEDD2-212ENST00000602075 763 ntTSL 321.41■■□□□ 1.023e-10■■■■■ 53.8
PCBP2Q15366 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.853e-10■■■■■ 53.8
PCBP2Q15366 DEDD2-210ENST00000600559 550 ntTSL 219.71■□□□□ 0.753e-10■■■■■ 53.8
PCBP2Q15366 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.693e-10■■■■■ 53.8
PCBP2Q15366 DEDD2-203ENST00000593804 1586 ntTSL 219.19■□□□□ 0.663e-10■■■■■ 53.8
PCBP2Q15366 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.593e-10■■■■■ 53.8
PCBP2Q15366 DEDD2-206ENST00000598090 463 ntTSL 318.75■□□□□ 0.593e-10■■■■■ 53.8
PCBP2Q15366 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.43e-10■■■■■ 53.8
PCBP2Q15366 DEDD2-211ENST00000601135 723 ntTSL 217.25■□□□□ 0.353e-10■■■■■ 53.8
PCBP2Q15366 DEDD2-213ENST00000602201 556 ntTSL 416.42■□□□□ 0.223e-10■■■■■ 53.8
PCBP2Q15366 DEDD2-202ENST00000593561 546 ntTSL 415.84■□□□□ 0.133e-10■■■■■ 53.8
PCBP2Q15366 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.021e-323■■■■■ 53.8
PCBP2Q15366 AC002094.3-201ENST00000555059 851 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.831e-323■■■■■ 53.8
PCBP2Q15366 PRKCZ-210ENST00000470596 788 ntTSL 219.81■□□□□ 0.764e-7■■■■■ 53.8
PCBP2Q15366 PRKCZ-205ENST00000461465 480 ntTSL 416.35■□□□□ 0.214e-7■■■■■ 53.8
PCBP2Q15366 PRKCZ-222ENST00000496325 563 ntTSL 414.97□□□□□ -0.014e-7■■■■■ 53.8
PCBP2Q15366 PRKCZ-221ENST00000495347 698 ntTSL 414.16□□□□□ -0.144e-7■■■■■ 53.8
PCBP2Q15366 PRKCZ-217ENST00000481140 713 ntTSL 47.24□□□□□ -1.254e-7■■■■■ 53.8
PCBP2Q15366 PTK2-217ENST00000519899 762 ntTSL 26.48□□□□□ -1.376e-7■■■■■ 53.7
PCBP2Q15366 PTK2-211ENST00000519361 553 ntTSL 56.48□□□□□ -1.376e-7■■■■■ 53.7
PCBP2Q15366 PTK2-247ENST00000523670 542 ntTSL 45.65□□□□□ -1.56e-7■■■■■ 53.7
PCBP2Q15366 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.516e-7■■■■■ 53.7
PCBP2Q15366 PTK2-210ENST00000519024 576 ntTSL 44.46□□□□□ -1.76e-7■■■■■ 53.7
PCBP2Q15366 PTK2-245ENST00000523474 567 ntTSL 52.34□□□□□ -2.036e-7■■■■■ 53.7
PCBP2Q15366 EIF3H-203ENST00000518034 1047 ntTSL 210.01□□□□□ -0.817e-14■■■■■ 53.6
PCBP2Q15366 EIF3H-205ENST00000518995 731 ntTSL 38.95□□□□□ -0.987e-14■■■■■ 53.6
PCBP2Q15366 EIF3H-204ENST00000518949 843 ntTSL 38.95□□□□□ -0.987e-14■■■■■ 53.6
PCBP2Q15366 EIF3H-212ENST00000611080 1265 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.017e-14■■■■■ 53.6
PCBP2Q15366 EIF3H-201ENST00000276682 2041 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.087e-14■■■■■ 53.6
PCBP2Q15366 EIF3H-211ENST00000522800 635 ntTSL 38.18□□□□□ -1.17e-14■■■■■ 53.6
PCBP2Q15366 EIF3H-206ENST00000519046 488 ntTSL 37.68□□□□□ -1.187e-14■■■■■ 53.6
PCBP2Q15366 EIF3H-210ENST00000522453 518 ntTSL 37.24□□□□□ -1.257e-14■■■■■ 53.6
PCBP2Q15366 EIF3H-202ENST00000517974 594 ntTSL 26.72□□□□□ -1.337e-14■■■■■ 53.6
PCBP2Q15366 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.567e-14■■■■■ 53.6
PCBP2Q15366 ASAP1-215ENST00000524299 550 ntTSL 49.98□□□□□ -0.811e-6■■■■■ 53.6
PCBP2Q15366 YIPF3-214ENST00000510102 1639 ntTSL 516.43■□□□□ 0.221e-14■■■■■ 53.5
PCBP2Q15366 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.071e-14■■■■■ 53.5
PCBP2Q15366 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.222e-15■■■■■ 53.4
PCBP2Q15366 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.042e-15■■■■■ 53.4
PCBP2Q15366 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.282e-15■■■■■ 53.4
PCBP2Q15366 SH3RF2-201ENST00000359120 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.415e-14■■■■■ 53.4
PCBP2Q15366 SH3RF2-206ENST00000511217 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.495e-14■■■■■ 53.4
PCBP2Q15366 UBAP2L-216ENST00000484819 1056 ntTSL 29.08□□□□□ -0.962e-7■■■■■ 53.4
PCBP2Q15366 XYLB-204ENST00000472721 546 ntTSL 412.56□□□□□ -0.44e-12■■■■■ 53.4
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