Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 RPL3-212ENST00000467105 1396 ntTSL 1 (best)13.1□□□□□ -0.315e-8■■■■■ 55.2
EFTUD2Q15029 ITGA5-205ENST00000549601 505 ntTSL 28.61□□□□□ -1.034e-10■■■■■ 55.1
EFTUD2Q15029 MIEF1-214ENST00000494219 592 ntTSL 219.37■□□□□ 0.696e-9■■■■■ 55.1
EFTUD2Q15029 MIEF1-213ENST00000489792 590 ntTSL 418.14■□□□□ 0.496e-9■■■■■ 55.1
EFTUD2Q15029 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.276e-9■■■■■ 55.1
EFTUD2Q15029 MIEF1-209ENST00000467866 573 ntTSL 416.41■□□□□ 0.226e-9■■■■■ 55.1
EFTUD2Q15029 RPS27-204ENST00000493224 573 ntTSL 215.92■□□□□ 0.145e-10■■■■■ 55.1
EFTUD2Q15029 MIEF1-206ENST00000434364 744 ntTSL 515.86■□□□□ 0.136e-9■■■■■ 55.1
EFTUD2Q15029 PDIA3-205ENST00000469684 374 ntTSL 315.66■□□□□ 0.16e-9■■■■■ 55.1
EFTUD2Q15029 MIEF1-212ENST00000481746 559 ntTSL 415.55■□□□□ 0.086e-9■■■■■ 55.1
EFTUD2Q15029 MIEF1-210ENST00000478342 700 ntTSL 215.55■□□□□ 0.086e-9■■■■■ 55.1
EFTUD2Q15029 PDIA3-202ENST00000434494 2107 ntTSL 215.06■□□□□ 06e-9■■■■■ 55.1
EFTUD2Q15029 MIEF1-204ENST00000428069 1379 ntTSL 214.32□□□□□ -0.126e-9■■■■■ 55.1
EFTUD2Q15029 PDIA3-203ENST00000446523 596 ntTSL 213.86□□□□□ -0.196e-9■■■■■ 55.1
EFTUD2Q15029 MIEF1-205ENST00000433117 3838 ntTSL 1 (best)13.28□□□□□ -0.286e-9■■■■■ 55.1
EFTUD2Q15029 MIEF1-207ENST00000464629 573 ntTSL 413.19□□□□□ -0.36e-9■■■■■ 55.1
EFTUD2Q15029 MIEF1-201ENST00000325301 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.356e-9■■■■■ 55.1
EFTUD2Q15029 MIEF1-203ENST00000404569 3797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.446e-9■■■■■ 55.1
EFTUD2Q15029 PDIA3-201ENST00000300289 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.556e-9■■■■■ 55.1
EFTUD2Q15029 RPS27-203ENST00000477151 467 ntTSL 210.86□□□□□ -0.675e-10■■■■■ 55.1
EFTUD2Q15029 PDIA3-204ENST00000455250 725 ntTSL 58.22□□□□□ -1.096e-9■■■■■ 55.1
EFTUD2Q15029 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.35e-10■■■■■ 55.1
EFTUD2Q15029 COL9A2-210ENST00000495948 423 ntTSL 219.29■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 55.1
EFTUD2Q15029 FDXR-211ENST00000579893 558 ntTSL 417.01■□□□□ 0.312e-7■■■■■ 55
EFTUD2Q15029 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.134e-7■■■■■ 55
EFTUD2Q15029 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.284e-7■■■■■ 55
EFTUD2Q15029 NDUFB1-205ENST00000556555 568 ntTSL 321.13■□□□□ 0.974e-15■■■■■ 54.9
EFTUD2Q15029 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.684e-15■■■■■ 54.9
EFTUD2Q15029 ARMC6-208ENST00000535795 1052 ntTSL 518.83■□□□□ 0.64e-15■■■■■ 54.9
EFTUD2Q15029 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.484e-8■■■■■ 54.9
EFTUD2Q15029 BRF1-212ENST00000547562 2405 ntTSL 216.21■□□□□ 0.197e-8■■■■■ 54.9
EFTUD2Q15029 ARMC6-213ENST00000540634 1320 ntTSL 515.23■□□□□ 0.034e-15■■■■■ 54.9
EFTUD2Q15029 ARMC6-205ENST00000535478 762 ntTSL 314.62□□□□□ -0.074e-15■■■■■ 54.9
EFTUD2Q15029 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.084e-15■■■■■ 54.9
EFTUD2Q15029 NDUFB1-202ENST00000553514 454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.564e-15■■■■■ 54.9
EFTUD2Q15029 ATP13A1-206ENST00000471063 373 ntTSL 210.11□□□□□ -0.793e-10■■■■■ 54.9
EFTUD2Q15029 NDUFB1-206ENST00000605997 336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.94e-15■■■■■ 54.9
EFTUD2Q15029 CPSF1-204ENST00000529288 588 ntTSL 212.08□□□□□ -0.481e-9■■■■■ 54.9
EFTUD2Q15029 CPSF7-226ENST00000626926 306 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.12e-11■■■■■ 54.9
EFTUD2Q15029 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.022e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.32e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.292e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.182e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.132e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.872e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.872e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.562e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.52e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 MATK-205ENST00000587180 741 ntTSL 517.89■□□□□ 0.452e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.32e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.252e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 CACUL1-206ENST00000493518 3217 ntTSL 1 (best)16.56■□□□□ 0.242e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.142e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.12e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 DGKD-204ENST00000430834 5379 ntTSL 1 (best)15.63■□□□□ 0.092e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.12e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 SUPT20H-222ENST00000495071 3669 ntTSL 514.13□□□□□ -0.152e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.212e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 WIPF3-201ENST00000242140 4184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.212e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 DGKD-213ENST00000490764 2902 ntTSL 1 (best)13.71□□□□□ -0.212e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 BDP1-204ENST00000508917 7194 ntTSL 1 (best)13.47□□□□□ -0.252e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.32e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 MATK-206ENST00000588983 711 ntTSL 312.97□□□□□ -0.332e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 MATK-208ENST00000590493 801 ntTSL 312.94□□□□□ -0.342e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 ARRB1-205ENST00000529280 684 ntTSL 211.66□□□□□ -0.542e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 ZDHHC5-207ENST00000529480 3546 ntTSL 1 (best)9.53□□□□□ -0.882e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 ARL8A-203ENST00000491358 355 ntTSL 29.3□□□□□ -0.922e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 ZDHHC5-208ENST00000532842 440 ntTSL 59.2□□□□□ -0.942e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 CACUL1-207ENST00000544392 1060 ntTSL 29.05□□□□□ -0.962e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 ZDHHC5-206ENST00000529447 901 ntTSL 59.03□□□□□ -0.962e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 SUPT20H-220ENST00000490716 3811 ntTSL 58.81□□□□□ -12e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 WIPF3-203ENST00000409290 4002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.032e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 NDRG2-221ENST00000553793 725 ntTSL 28.56□□□□□ -1.042e-7■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 NDRG2-272ENST00000557416 556 ntTSL 48.56□□□□□ -1.042e-7■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 SUPT20H-205ENST00000464744 2625 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.112e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.192e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 SUPT20H-207ENST00000469488 1313 ntTSL 56.04□□□□□ -1.442e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 SUPT20H-221ENST00000493537 2149 ntTSL 54.82□□□□□ -1.642e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 ZDHHC5-205ENST00000528177 577 ntTSL 44.5□□□□□ -1.692e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 SUPT20H-214ENST00000476539 528 ntTSL 33.64□□□□□ -1.832e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 SUPT20H-206ENST00000466563 619 ntTSL 33.49□□□□□ -1.852e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 SUPT20H-219ENST00000490602 609 ntTSL 53.41□□□□□ -1.862e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 SUPT20H-215ENST00000478911 591 ntTSL 32.91□□□□□ -1.942e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 CACUL1-203ENST00000481360 435 ntTSL 52.84□□□□□ -1.952e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 XPO1-223ENST00000494468 562 ntTSL 32.81□□□□□ -1.962e-10■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 RANGAP1-205ENST00000446258 759 ntTSL 312.92□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 USP31-202ENST00000563525 1560 ntTSL 511.96□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 54.8
EFTUD2Q15029 PER1-203ENST00000577253 589 ntTSL 418.64■□□□□ 0.575e-9■■■■■ 54.7
EFTUD2Q15029 SUN2-211ENST00000455125 872 ntTSL 212.45□□□□□ -0.425e-9■■■■■ 54.7
EFTUD2Q15029 PER1-213ENST00000581703 528 ntTSL 412.23□□□□□ -0.455e-9■■■■■ 54.7
EFTUD2Q15029 SUN2-215ENST00000470642 571 ntTSL 38.69□□□□□ -1.025e-9■■■■■ 54.7
EFTUD2Q15029 IMP4-209ENST00000462357 533 ntTSL 519.69■□□□□ 0.743e-7■■■■■ 54.7
EFTUD2Q15029 IMP4-207ENST00000460100 721 ntTSL 313.93□□□□□ -0.183e-7■■■■■ 54.7
EFTUD2Q15029 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC2.16□□□□□ -2.061e-323■■■■■ 54.7
EFTUD2Q15029 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.211e-6■■■■■ 54.6
EFTUD2Q15029 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 54.6
EFTUD2Q15029 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.381e-6■■■■■ 54.6
EFTUD2Q15029 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 54.6
EFTUD2Q15029 ADD1-210ENST00000503455 3206 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.541e-6■■■■■ 54.6
EFTUD2Q15029 ADD1-217ENST00000513328 3107 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 54.6
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