Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 SWD1YAR003W 1281 nt6.05□□□□□ -1.44
HER1Q12276 VHT1YGR065C 1782 nt6.05□□□□□ -1.44
HER1Q12276 DOT1YDR440W 1749 nt6.05□□□□□ -1.44
HER1Q12276 IES1YFL013C 2079 nt6.04□□□□□ -1.44
HER1Q12276 FYV1YDR024W 486 nt6.04□□□□□ -1.44
HER1Q12276 EFM3YJR129C 1020 nt6.04□□□□□ -1.44
HER1Q12276 YPR123CYPR123C 435 nt6.04□□□□□ -1.44
HER1Q12276 VPS5YOR069W 2028 nt6.04□□□□□ -1.44
HER1Q12276 FMP40YPL222W 2067 nt6.03□□□□□ -1.44
HER1Q12276 MRPL35YDR322W 1104 nt6.03□□□□□ -1.44
HER1Q12276 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt6.03□□□□□ -1.44
HER1Q12276 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt6.03□□□□□ -1.44
HER1Q12276 AST1YBL069W 1290 nt6.03□□□□□ -1.44
HER1Q12276 PZF1YPR186C 1290 nt6.03□□□□□ -1.44
HER1Q12276 SIT1YEL065W 1887 nt6.02□□□□□ -1.44
HER1Q12276 DDC1YPL194W 1839 nt6.02□□□□□ -1.45
HER1Q12276 DID2YKR035W-A 615 nt6.02□□□□□ -1.45
HER1Q12276 IES2YNL215W 963 nt6.02□□□□□ -1.45
HER1Q12276 YPL257WYPL257W 582 nt6.02□□□□□ -1.45
HER1Q12276 VMS1YDR049W 1899 nt6.02□□□□□ -1.45
HER1Q12276 HOS2YGL194C 1359 nt6.02□□□□□ -1.45
HER1Q12276 CLB2YPR119W 1476 nt6.02□□□□□ -1.45
HER1Q12276 ALT2YDR111C 1524 nt6.01□□□□□ -1.45
HER1Q12276 CRH1YGR189C 1524 nt6.01□□□□□ -1.45
HER1Q12276 YDR278CYDR278C 318 nt6.01□□□□□ -1.45
HER1Q12276 SEM1YDR363W-A 270 nt6.01□□□□□ -1.45
HER1Q12276 YML083CYML083C 1257 nt6.01□□□□□ -1.45
HER1Q12276 MRPS12YNR036C 462 nt6.01□□□□□ -1.45
HER1Q12276 TRP5YGL026C 2124 nt6.01□□□□□ -1.45
HER1Q12276 NPL6YMR091C 1308 nt6□□□□□ -1.45
HER1Q12276 MRS1YIR021W 1092 nt6□□□□□ -1.45
HER1Q12276 YOL036WYOL036W 2286 nt6□□□□□ -1.45
HER1Q12276 PXL1YKR090W 2121 nt5.99□□□□□ -1.45
HER1Q12276 VPS72YDR485C 2388 nt5.99□□□□□ -1.45
HER1Q12276 THI4YGR144W 981 nt5.99□□□□□ -1.45
HER1Q12276 YIR042CYIR042C 711 nt5.99□□□□□ -1.45
HER1Q12276 DRE2YKR071C 1047 nt5.99□□□□□ -1.45
HER1Q12276 VPS4YPR173C 1314 nt5.99□□□□□ -1.45
HER1Q12276 IMG1YCR046C 510 nt5.98□□□□□ -1.45
HER1Q12276 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt5.98□□□□□ -1.45
HER1Q12276 ASF1YJL115W 840 nt5.98□□□□□ -1.45
HER1Q12276 YBL112CYBL112C 318 nt5.98□□□□□ -1.45
HER1Q12276 RPL21AYBR191W 483 nt5.98□□□□□ -1.45
HER1Q12276 YMR155WYMR155W 1644 nt5.98□□□□□ -1.45
HER1Q12276 HRQ1YDR291W 3234 nt5.98□□□□□ -1.45
HER1Q12276 SEC18YBR080C 2277 nt5.97□□□□□ -1.45
HER1Q12276 HXK2YGL253W 1461 nt5.97□□□□□ -1.45
HER1Q12276 PGK1YCR012W 1251 nt5.97□□□□□ -1.45
HER1Q12276 LCL3YGL085W 825 nt5.97□□□□□ -1.45
HER1Q12276 YKL077WYKL077W 1179 nt5.97□□□□□ -1.45
HER1Q12276 KTR1YOR099W 1182 nt5.97□□□□□ -1.45
HER1Q12276 LSC1YOR142W 990 nt5.97□□□□□ -1.45
HER1Q12276 LDB16YCL005W 771 nt5.97□□□□□ -1.45
HER1Q12276 ILV6YCL009C 930 nt5.97□□□□□ -1.45
HER1Q12276 DUG1YFR044C 1446 nt5.97□□□□□ -1.45
HER1Q12276 ARO10YDR380W 1908 nt5.97□□□□□ -1.45
HER1Q12276 YFL042CYFL042C 2025 nt5.96□□□□□ -1.45
HER1Q12276 FAL1YDR021W 1200 nt5.96□□□□□ -1.46
HER1Q12276 FMO1YHR176W 1299 nt5.96□□□□□ -1.46
HER1Q12276 LCB3YJL134W 1230 nt5.96□□□□□ -1.46
HER1Q12276 RNH1YMR234W 1047 nt5.96□□□□□ -1.46
HER1Q12276 PAT1YCR077C 2391 nt5.96□□□□□ -1.46
HER1Q12276 MSS116YDR194C 1995 nt5.96□□□□□ -1.46
HER1Q12276 UTP9YHR196W 1728 nt5.96□□□□□ -1.46
HER1Q12276 PCS60YBR222C 1632 nt5.96□□□□□ -1.46
HER1Q12276 MDE1YJR024C 735 nt5.95□□□□□ -1.46
HER1Q12276 JJJ3YJR097W 519 nt5.95□□□□□ -1.46
HER1Q12276 CCP1YKR066C 1086 nt5.95□□□□□ -1.46
HER1Q12276 SCO2YBR024W 906 nt5.95□□□□□ -1.46
HER1Q12276 PTK2YJR059W 2457 nt5.94□□□□□ -1.46
HER1Q12276 APM1YPL259C 1428 nt5.94□□□□□ -1.46
HER1Q12276 AMA1YGR225W 1782 nt5.94□□□□□ -1.46
HER1Q12276 YMR147WYMR147W 672 nt5.94□□□□□ -1.46
HER1Q12276 TAF9YMR236W 474 nt5.94□□□□□ -1.46
HER1Q12276 YOL163WYOL163W 510 nt5.94□□□□□ -1.46
HER1Q12276 CNE1YAL058W 1509 nt5.94□□□□□ -1.46
HER1Q12276 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt5.93□□□□□ -1.46
HER1Q12276 RPL7AYGL076C 735 nt5.93□□□□□ -1.46
HER1Q12276 YKL102CYKL102C 306 nt5.93□□□□□ -1.46
HER1Q12276 MRPS18YNL306W 654 nt5.93□□□□□ -1.46
HER1Q12276 RPL7BYPL198W 735 nt5.93□□□□□ -1.46
HER1Q12276 SAL1YNL083W 1485 nt5.93□□□□□ -1.46
HER1Q12276 BZZ1YHR114W 1902 nt5.93□□□□□ -1.46
HER1Q12276 YJL107CYJL107C 1164 nt5.92□□□□□ -1.46
HER1Q12276 POP5YAL033W 522 nt5.92□□□□□ -1.46
HER1Q12276 YMR252CYMR252C 405 nt5.92□□□□□ -1.46
HER1Q12276 RUF23RUF23 254 nt5.92□□□□□ -1.46
HER1Q12276 MRPL23YOR150W 492 nt5.92□□□□□ -1.46
HER1Q12276 YHK8YHR048W 1545 nt5.92□□□□□ -1.46
HER1Q12276 YNL247WYNL247W 2304 nt5.92□□□□□ -1.46
HER1Q12276 MNN5YJL186W 1761 nt5.91□□□□□ -1.46
HER1Q12276 YGL235WYGL235W 537 nt5.91□□□□□ -1.46
HER1Q12276 YHR145CYHR145C 357 nt5.91□□□□□ -1.46
HER1Q12276 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.91□□□□□ -1.46
HER1Q12276 AIM17YHL021C 1398 nt5.91□□□□□ -1.46
HER1Q12276 ALD6YPL061W 1503 nt5.9□□□□□ -1.46
HER1Q12276 SET5YHR207C 1581 nt5.9□□□□□ -1.46
HER1Q12276 PET112YBL080C 1626 nt5.9□□□□□ -1.46
HER1Q12276 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt5.9□□□□□ -1.46
HER1Q12276 GCG1YER163C 699 nt5.9□□□□□ -1.46
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