Protein–RNA interactions for Protein: Q04228

UBX2, UBX domain-containing protein 2, yeastyeast

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Length 584 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX2Q04228 MIP1YOR330C 3765 nt7.14□□□□□ -1.27
UBX2Q04228 ECM27YJR106W 2178 nt7.13□□□□□ -1.27
UBX2Q04228 CEF1YMR213W 1773 nt7.13□□□□□ -1.27
UBX2Q04228 SSP120YLR250W 705 nt7.13□□□□□ -1.27
UBX2Q04228 HRQ1YDR291W 3234 nt7.13□□□□□ -1.27
UBX2Q04228 MRK1YDL079C 1506 nt7.12□□□□□ -1.27
UBX2Q04228 PYK2YOR347C 1521 nt7.12□□□□□ -1.27
UBX2Q04228 PUF3YLL013C 2640 nt7.12□□□□□ -1.27
UBX2Q04228 CDC34YDR054C 888 nt7.12□□□□□ -1.27
UBX2Q04228 COX20YDR231C 618 nt7.12□□□□□ -1.27
UBX2Q04228 YLR123CYLR123C 330 nt7.12□□□□□ -1.27
UBX2Q04228 TSA1YML028W 591 nt7.12□□□□□ -1.27
UBX2Q04228 SNO4YMR322C 714 nt7.12□□□□□ -1.27
UBX2Q04228 AAD15YOL165C 432 nt7.12□□□□□ -1.27
UBX2Q04228 HSP33YOR391C 714 nt7.12□□□□□ -1.27
UBX2Q04228 HSP32YPL280W 714 nt7.12□□□□□ -1.27
UBX2Q04228 KNS1YLL019C 2214 nt7.11□□□□□ -1.27
UBX2Q04228 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt7.11□□□□□ -1.27
UBX2Q04228 QCR8YJL166W 285 nt7.11□□□□□ -1.27
UBX2Q04228 ATG12YBR217W 561 nt7.11□□□□□ -1.27
UBX2Q04228 SUF5tG(CCC)O 72 nt7.1□□□□□ -1.27
UBX2Q04228 YEL068CYEL068C 333 nt7.1□□□□□ -1.27
UBX2Q04228 IES2YNL215W 963 nt7.1□□□□□ -1.27
UBX2Q04228 MDM31YHR194W 1740 nt7.1□□□□□ -1.27
UBX2Q04228 MRPL22YNL177C 930 nt7.08□□□□□ -1.28
UBX2Q04228 HDA1YNL021W 2121 nt7.07□□□□□ -1.28
UBX2Q04228 PMT3YOR321W 2262 nt7.07□□□□□ -1.28
UBX2Q04228 YML133CYML133C 4125 nt7.07□□□□□ -1.28
UBX2Q04228 YLR312CYLR312C 1197 nt7.07□□□□□ -1.28
UBX2Q04228 ISC1YER019W 1434 nt7.07□□□□□ -1.28
UBX2Q04228 ASN2YGR124W 1719 nt7.07□□□□□ -1.28
UBX2Q04228 AFG1YEL052W 1530 nt7.06□□□□□ -1.28
UBX2Q04228 MDH3YDL078C 1032 nt7.06□□□□□ -1.28
UBX2Q04228 CCP1YKR066C 1086 nt7.06□□□□□ -1.28
UBX2Q04228 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt7.06□□□□□ -1.28
UBX2Q04228 CYC8YBR112C 2901 nt7.05□□□□□ -1.28
UBX2Q04228 UTR2YEL040W 1404 nt7.05□□□□□ -1.28
UBX2Q04228 RAP1YNL216W 2484 nt7.05□□□□□ -1.28
UBX2Q04228 YPR204WYPR204W 3099 nt7.04□□□□□ -1.28
UBX2Q04228 RAD24YER173W 1980 nt7.04□□□□□ -1.28
UBX2Q04228 IME2YJL106W 1938 nt7.04□□□□□ -1.28
UBX2Q04228 BCY1YIL033C 1251 nt7.04□□□□□ -1.28
UBX2Q04228 DAL3YIR032C 588 nt7.04□□□□□ -1.28
UBX2Q04228 YPR114WYPR114W 948 nt7.04□□□□□ -1.28
UBX2Q04228 YOS9YDR057W 1629 nt7.04□□□□□ -1.28
UBX2Q04228 WHI2YOR043W 1461 nt7.04□□□□□ -1.28
UBX2Q04228 YCK1YHR135C 1617 nt7.03□□□□□ -1.28
UBX2Q04228 QCR6YFR033C 444 nt7.03□□□□□ -1.28
UBX2Q04228 YGL036WYGL036W 2730 nt7.03□□□□□ -1.28
UBX2Q04228 TMT1YER175C 900 nt7.02□□□□□ -1.29
UBX2Q04228 YGR022CYGR022C 330 nt7.02□□□□□ -1.29
UBX2Q04228 YUR1YJL139C 1287 nt7.02□□□□□ -1.29
UBX2Q04228 GLN1YPR035W 1113 nt7.02□□□□□ -1.29
UBX2Q04228 EFT2YDR385W 2529 nt7.02□□□□□ -1.29
UBX2Q04228 EFT1YOR133W 2529 nt7.02□□□□□ -1.29
UBX2Q04228 YGL235WYGL235W 537 nt7.01□□□□□ -1.29
UBX2Q04228 RGT2YDL138W 2292 nt7.01□□□□□ -1.29
UBX2Q04228 LAG2YOL025W 1983 nt7□□□□□ -1.29
UBX2Q04228 ADY2YCR010C 852 nt7□□□□□ -1.29
UBX2Q04228 ERP2YAL007C 648 nt7□□□□□ -1.29
UBX2Q04228 YHM2YMR241W 945 nt7□□□□□ -1.29
UBX2Q04228 RPL21AYBR191W 483 nt7□□□□□ -1.29
UBX2Q04228 YIL055CYIL055C 1884 nt7□□□□□ -1.29
UBX2Q04228 RIO1YOR119C 1455 nt6.99□□□□□ -1.29
UBX2Q04228 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt6.99□□□□□ -1.29
UBX2Q04228 MRP17YKL003C 396 nt6.99□□□□□ -1.29
UBX2Q04228 UBC11YOR339C 471 nt6.99□□□□□ -1.29
UBX2Q04228 POP1YNL221C 2628 nt6.98□□□□□ -1.29
UBX2Q04228 CNE1YAL058W 1509 nt6.98□□□□□ -1.29
UBX2Q04228 GAT4YIR013C 366 nt6.98□□□□□ -1.29
UBX2Q04228 ACS1YAL054C 2142 nt6.98□□□□□ -1.29
UBX2Q04228 ARG81YML099C 2643 nt6.97□□□□□ -1.29
UBX2Q04228 EFM4YIL064W 774 nt6.97□□□□□ -1.29
UBX2Q04228 PNP1YLR209C 936 nt6.97□□□□□ -1.29
UBX2Q04228 COX5AYNL052W 462 nt6.97□□□□□ -1.29
UBX2Q04228 CIR2YOR356W 1896 nt6.97□□□□□ -1.29
UBX2Q04228 ARP2YDL029W 1176 nt6.96□□□□□ -1.3
UBX2Q04228 BIM1YER016W 1035 nt6.96□□□□□ -1.3
UBX2Q04228 PAN6YIL145C 930 nt6.96□□□□□ -1.3
UBX2Q04228 ARG1YOL058W 1263 nt6.96□□□□□ -1.3
UBX2Q04228 SES1YDR023W 1389 nt6.95□□□□□ -1.3
UBX2Q04228 AIM33YML087C 939 nt6.95□□□□□ -1.3
UBX2Q04228 YTP1YNL237W 1380 nt6.95□□□□□ -1.3
UBX2Q04228 CSC1YLR241W 2349 nt6.94□□□□□ -1.3
UBX2Q04228 ATG4YNL223W 1485 nt6.94□□□□□ -1.3
UBX2Q04228 YBR144CYBR144C 315 nt6.94□□□□□ -1.3
UBX2Q04228 YFL064CYFL064C 525 nt6.93□□□□□ -1.3
UBX2Q04228 PHB1YGR132C 864 nt6.93□□□□□ -1.3
UBX2Q04228 DPH5YLR172C 903 nt6.93□□□□□ -1.3
UBX2Q04228 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt6.93□□□□□ -1.3
UBX2Q04228 HSP26YBR072W 645 nt6.93□□□□□ -1.3
UBX2Q04228 YPR202WYPR202W 717 nt6.93□□□□□ -1.3
UBX2Q04228 DAL4YIR028W 1908 nt6.93□□□□□ -1.3
UBX2Q04228 VID30YGL227W 2877 nt6.93□□□□□ -1.3
UBX2Q04228 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt6.92□□□□□ -1.3
UBX2Q04228 SYN8YAL014C 768 nt6.92□□□□□ -1.3
UBX2Q04228 YDL057WYDL057W 987 nt6.91□□□□□ -1.3
UBX2Q04228 VMA16YHR026W 642 nt6.91□□□□□ -1.3
UBX2Q04228 BSC4YNL269W 396 nt6.91□□□□□ -1.3
UBX2Q04228 CAR1YPL111W 1002 nt6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 1691.5 ms