Protein–RNA interactions for Protein: Q04437

YKU80, ATP-dependent DNA helicase II subunit 2, yeastyeast

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKU80Q04437 THI2YBR240C 1353 nt6.47□□□□□ -1.37
YKU80Q04437 STT3YGL022W 2157 nt6.47□□□□□ -1.37
YKU80Q04437 RPP1YHR062C 882 nt6.47□□□□□ -1.37
YKU80Q04437 YNL092WYNL092W 1203 nt6.47□□□□□ -1.37
YKU80Q04437 SEC18YBR080C 2277 nt6.47□□□□□ -1.37
YKU80Q04437 MRC1YCL061C 3291 nt6.47□□□□□ -1.37
YKU80Q04437 BNA5YLR231C 1362 nt6.46□□□□□ -1.37
YKU80Q04437 HIS7YBR248C 1659 nt6.46□□□□□ -1.37
YKU80Q04437 VPS61YDR136C 573 nt6.46□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 CYS3YAL012W 1185 nt6.46□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 LAT1YNL071W 1449 nt6.46□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 snR30snR30 606 nt6.46□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 BZZ1YHR114W 1902 nt6.46□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 CHL4YDR254W 1377 nt6.45□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 PDA1YER178W 1263 nt6.45□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 YGL102CYGL102C 429 nt6.45□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 SQT1YIR012W 1296 nt6.45□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 YLR123CYLR123C 330 nt6.45□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 RPS28AYOR167C 204 nt6.45□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 SMX3YPR182W 261 nt6.45□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 MRPS28YDR337W 861 nt6.44□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 DMA1YHR115C 1251 nt6.44□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 ATG36YJL185C 882 nt6.44□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 ARA2YMR041C 1008 nt6.44□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 RDL2YOR286W 450 nt6.44□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 APM4YOL062C 1476 nt6.44□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 SIT1YEL065W 1887 nt6.44□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 VPS5YOR069W 2028 nt6.43□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 MIA40YKL195W 1212 nt6.43□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 YOX1YML027W 1158 nt6.43□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 MRPS12YNR036C 462 nt6.43□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 ERG10YPL028W 1197 nt6.43□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 YCL049CYCL049C 939 nt6.43□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 EDE1YBL047C 4146 nt6.43□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 ARO10YDR380W 1908 nt6.42□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 MSY1YPL097W 1479 nt6.42□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 PPM2YOL141W 2088 nt6.42□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 MRPL1YDR116C 858 nt6.42□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 CCP1YKR066C 1086 nt6.42□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 PXL1YKR090W 2121 nt6.42□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 MRPL19YNL185C 477 nt6.42□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 PRP24YMR268C 1335 nt6.42□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 IVY1YDR229W 1362 nt6.42□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 YFL042CYFL042C 2025 nt6.42□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 APE4YHR113W 1473 nt6.41□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 PET112YBL080C 1626 nt6.41□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 YLR162WYLR162W 357 nt6.41□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 AVO1YOL078W 3531 nt6.41□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 YHR020WYHR020W 2067 nt6.41□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 LDB19YOR322C 2457 nt6.41□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 GUS1YGL245W 2127 nt6.41□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 HED1YDR014W-A 489 nt6.4□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 YJU2YKL095W 837 nt6.4□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 YLL056CYLL056C 897 nt6.4□□□□□ -1.38
YKU80Q04437 CCC2YDR270W 3015 nt6.4□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 CLB2YPR119W 1476 nt6.4□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 TRP5YGL026C 2124 nt6.4□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 PGM1YKL127W 1713 nt6.39□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 ERP5YHR110W 639 nt6.39□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 YHR140WYHR140W 720 nt6.39□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 PRI1YIR008C 1230 nt6.39□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 TMA46YOR091W 1038 nt6.39□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 CNM67YNL225C 1746 nt6.39□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 YOL036WYOL036W 2286 nt6.38□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 YGL072CYGL072C 360 nt6.38□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 EFM3YJR129C 1020 nt6.38□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 ICP55YER078C 1536 nt6.38□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 FMP40YPL222W 2067 nt6.38□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 PAT1YCR077C 2391 nt6.38□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 PTK2YJR059W 2457 nt6.38□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 LSG1YGL099W 1923 nt6.37□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 DDC1YPL194W 1839 nt6.37□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 AMA1YGR225W 1782 nt6.37□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 ASN1YPR145W 1719 nt6.37□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 YHL017WYHL017W 1599 nt6.37□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 AIM46YHR199C 933 nt6.37□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 ECM7YLR443W 1347 nt6.36□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 HSP150YJL159W 1242 nt6.36□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 YNL120CYNL120C 486 nt6.36□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 COQ3YOL096C 939 nt6.36□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 SEC62YPL094C 825 nt6.36□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 VMS1YDR049W 1899 nt6.35□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 NOP7YGR103W 1818 nt6.35□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 COA1YIL157C 594 nt6.35□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 SML1YML058W 315 nt6.35□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 YML083CYML083C 1257 nt6.35□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 BSC4YNL269W 396 nt6.35□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 RKI1YOR095C 777 nt6.35□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 QNS1YHR074W 2145 nt6.35□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 PRY3YJL078C 2646 nt6.34□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 MSC3YLR219W 2187 nt6.34□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 YDR278CYDR278C 318 nt6.34□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 YMR155WYMR155W 1644 nt6.34□□□□□ -1.39
YKU80Q04437 AIM24YJR080C 1185 nt6.33□□□□□ -1.4
YKU80Q04437 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt6.33□□□□□ -1.4
YKU80Q04437 KSH1YNL024C-A 219 nt6.33□□□□□ -1.4
YKU80Q04437 ZIM17YNL310C 525 nt6.33□□□□□ -1.4
YKU80Q04437 ECM2YBR065C 1095 nt6.33□□□□□ -1.4
YKU80Q04437 ALT2YDR111C 1524 nt6.33□□□□□ -1.4
YKU80Q04437 YJL163CYJL163C 1668 nt6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 44.1 ms