Protein–RNA interactions for Protein: P40550

PDR11, ATP-dependent permease PDR11, yeastyeast

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR11P40550 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt8.48□□□□□ -1.05
PDR11P40550 YCK1YHR135C 1617 nt8.48□□□□□ -1.05
PDR11P40550 RKI1YOR095C 777 nt8.47□□□□□ -1.05
PDR11P40550 AIM33YML087C 939 nt8.46□□□□□ -1.05
PDR11P40550 GEF1YJR040W 2340 nt8.46□□□□□ -1.05
PDR11P40550 YLL067CYLL067C 3618 nt8.46□□□□□ -1.06
PDR11P40550 TKL2YBR117C 2046 nt8.46□□□□□ -1.06
PDR11P40550 RPE1YJL121C 717 nt8.46□□□□□ -1.06
PDR11P40550 IES2YNL215W 963 nt8.46□□□□□ -1.06
PDR11P40550 CDC19YAL038W 1503 nt8.45□□□□□ -1.06
PDR11P40550 YKR032WYKR032W 315 nt8.45□□□□□ -1.06
PDR11P40550 EXG1YLR300W 1347 nt8.45□□□□□ -1.06
PDR11P40550 POP5YAL033W 522 nt8.44□□□□□ -1.06
PDR11P40550 KTR1YOR099W 1182 nt8.44□□□□□ -1.06
PDR11P40550 PKC1YBL105C 3456 nt8.44□□□□□ -1.06
PDR11P40550 PXL1YKR090W 2121 nt8.43□□□□□ -1.06
PDR11P40550 RHB1YCR027C 630 nt8.43□□□□□ -1.06
PDR11P40550 ASK1YKL052C 879 nt8.43□□□□□ -1.06
PDR11P40550 EFM1YHL039W 1758 nt8.43□□□□□ -1.06
PDR11P40550 KTR3YBR205W 1215 nt8.42□□□□□ -1.06
PDR11P40550 PMT3YOR321W 2262 nt8.42□□□□□ -1.06
PDR11P40550 ATG12YBR217W 561 nt8.41□□□□□ -1.06
PDR11P40550 LDS1YAL018C 978 nt8.39□□□□□ -1.07
PDR11P40550 QCR8YJL166W 285 nt8.39□□□□□ -1.07
PDR11P40550 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt8.39□□□□□ -1.07
PDR11P40550 ADY2YCR010C 852 nt8.38□□□□□ -1.07
PDR11P40550 PNP1YLR209C 936 nt8.38□□□□□ -1.07
PDR11P40550 AFG1YEL052W 1530 nt8.38□□□□□ -1.07
PDR11P40550 YLR173WYLR173W 1827 nt8.38□□□□□ -1.07
PDR11P40550 YDL129WYDL129W 876 nt8.37□□□□□ -1.07
PDR11P40550 RPR2YIR015W 435 nt8.37□□□□□ -1.07
PDR11P40550 MRP17YKL003C 396 nt8.37□□□□□ -1.07
PDR11P40550 SEC23YPR181C 2307 nt8.37□□□□□ -1.07
PDR11P40550 SRF1YDL133W 1314 nt8.37□□□□□ -1.07
PDR11P40550 YPR114WYPR114W 948 nt8.37□□□□□ -1.07
PDR11P40550 KIN1YDR122W 3195 nt8.36□□□□□ -1.07
PDR11P40550 ECM27YJR106W 2178 nt8.36□□□□□ -1.07
PDR11P40550 YEL068CYEL068C 333 nt8.36□□□□□ -1.07
PDR11P40550 TSA1YML028W 591 nt8.36□□□□□ -1.07
PDR11P40550 YMC1YPR058W 924 nt8.36□□□□□ -1.07
PDR11P40550 MRPS5YBR251W 924 nt8.36□□□□□ -1.07
PDR11P40550 MRK1YDL079C 1506 nt8.36□□□□□ -1.07
PDR11P40550 OPI8YKR035C 642 nt8.35□□□□□ -1.07
PDR11P40550 RAD24YER173W 1980 nt8.34□□□□□ -1.07
PDR11P40550 GGC1YDL198C 903 nt8.34□□□□□ -1.07
PDR11P40550 TRR1YDR353W 960 nt8.34□□□□□ -1.07
PDR11P40550 HAP3YBL021C 435 nt8.34□□□□□ -1.07
PDR11P40550 AAD15YOL165C 432 nt8.34□□□□□ -1.07
PDR11P40550 RPL21AYBR191W 483 nt8.34□□□□□ -1.07
PDR11P40550 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt8.33□□□□□ -1.08
PDR11P40550 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt8.33□□□□□ -1.08
PDR11P40550 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt8.33□□□□□ -1.08
PDR11P40550 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt8.33□□□□□ -1.08
PDR11P40550 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt8.33□□□□□ -1.08
PDR11P40550 WHI2YOR043W 1461 nt8.33□□□□□ -1.08
PDR11P40550 GUD1YDL238C 1470 nt8.32□□□□□ -1.08
PDR11P40550 YJL045WYJL045W 1905 nt8.32□□□□□ -1.08
PDR11P40550 RGT2YDL138W 2292 nt8.32□□□□□ -1.08
PDR11P40550 YEL023CYEL023C 2049 nt8.32□□□□□ -1.08
PDR11P40550 YDL119CYDL119C 924 nt8.31□□□□□ -1.08
PDR11P40550 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt8.31□□□□□ -1.08
PDR11P40550 PEX13YLR191W 1161 nt8.31□□□□□ -1.08
PDR11P40550 MRPS16YPL013C 366 nt8.31□□□□□ -1.08
PDR11P40550 GID7YCL039W 2238 nt8.31□□□□□ -1.08
PDR11P40550 GPB2YAL056W 2643 nt8.31□□□□□ -1.08
PDR11P40550 SNO4YMR322C 714 nt8.3□□□□□ -1.08
PDR11P40550 ATO2YNR002C 849 nt8.3□□□□□ -1.08
PDR11P40550 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt8.3□□□□□ -1.08
PDR11P40550 UBC11YOR339C 471 nt8.3□□□□□ -1.08
PDR11P40550 HSP33YOR391C 714 nt8.3□□□□□ -1.08
PDR11P40550 HSP32YPL280W 714 nt8.3□□□□□ -1.08
PDR11P40550 PGM1YKL127W 1713 nt8.3□□□□□ -1.08
PDR11P40550 HDA1YNL021W 2121 nt8.3□□□□□ -1.08
PDR11P40550 PUF3YLL013C 2640 nt8.3□□□□□ -1.08
PDR11P40550 MCM3YEL032W 2916 nt8.3□□□□□ -1.08
PDR11P40550 EFM4YIL064W 774 nt8.29□□□□□ -1.08
PDR11P40550 COA1YIL157C 594 nt8.29□□□□□ -1.08
PDR11P40550 LDB18YLL049W 540 nt8.29□□□□□ -1.08
PDR11P40550 COX5AYNL052W 462 nt8.29□□□□□ -1.08
PDR11P40550 BSC4YNL269W 396 nt8.29□□□□□ -1.08
PDR11P40550 ARG1YOL058W 1263 nt8.29□□□□□ -1.08
PDR11P40550 RFC1YOR217W 2586 nt8.29□□□□□ -1.08
PDR11P40550 PRI2YKL045W 1587 nt8.29□□□□□ -1.08
PDR11P40550 BRL1YHR036W 1416 nt8.29□□□□□ -1.08
PDR11P40550 SUF5tG(CCC)O 72 nt8.29□□□□□ -1.08
PDR11P40550 DAL3YIR032C 588 nt8.29□□□□□ -1.08
PDR11P40550 SEC13YLR208W 894 nt8.29□□□□□ -1.08
PDR11P40550 LST8YNL006W 912 nt8.29□□□□□ -1.08
PDR11P40550 MRPL22YNL177C 930 nt8.28□□□□□ -1.08
PDR11P40550 DAP1YPL170W 459 nt8.28□□□□□ -1.08
PDR11P40550 ATG4YNL223W 1485 nt8.28□□□□□ -1.08
PDR11P40550 SES1YDR023W 1389 nt8.27□□□□□ -1.09
PDR11P40550 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt8.27□□□□□ -1.09
PDR11P40550 DCN1YLR128W 810 nt8.27□□□□□ -1.09
PDR11P40550 YGL235WYGL235W 537 nt8.26□□□□□ -1.09
PDR11P40550 RRP4YHR069C 1080 nt8.26□□□□□ -1.09
PDR11P40550 PYC2YBR218C 3543 nt8.25□□□□□ -1.09
PDR11P40550 YGR022CYGR022C 330 nt8.24□□□□□ -1.09
PDR11P40550 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt8.23□□□□□ -1.09
PDR11P40550 VPS61YDR136C 573 nt8.23□□□□□ -1.09
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