Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC24CP53992 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms