Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms