Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MID2Q9UJV3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MID2Q9UJV3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MID2Q9UJV3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MID2Q9UJV3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MID2Q9UJV3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MID2Q9UJV3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MID2Q9UJV3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MID2Q9UJV3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MID2Q9UJV3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MID2Q9UJV3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MID2Q9UJV3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MID2Q9UJV3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MID2Q9UJV3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MID2Q9UJV3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MID2Q9UJV3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MID2Q9UJV3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MID2Q9UJV3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MID2Q9UJV3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MID2Q9UJV3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MID2Q9UJV3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MID2Q9UJV3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MID2Q9UJV3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MID2Q9UJV3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MID2Q9UJV3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MID2Q9UJV3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MID2Q9UJV3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MID2Q9UJV3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MID2Q9UJV3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MID2Q9UJV3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MID2Q9UJV3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MID2Q9UJV3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MID2Q9UJV3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MID2Q9UJV3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MID2Q9UJV3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MID2Q9UJV3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MID2Q9UJV3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MID2Q9UJV3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MID2Q9UJV3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MID2Q9UJV3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MID2Q9UJV3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MID2Q9UJV3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MID2Q9UJV3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MID2Q9UJV3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MID2Q9UJV3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MID2Q9UJV3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MID2Q9UJV3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MID2Q9UJV3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MID2Q9UJV3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MID2Q9UJV3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MID2Q9UJV3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms