Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM208Q9BTX3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM208Q9BTX3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM208Q9BTX3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms