Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 PKD2-204ENST00000506727 550 ntTSL 48.21□□□□□ -1.12e-8■■■■■ 29
ILF3Q12906 EPB41L2-228ENST00000531410 2926 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.142e-8■■■■■ 29
ILF3Q12906 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.362e-8■■■■■ 29
ILF3Q12906 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.412e-8■■■■■ 29
ILF3Q12906 EPB41L2-231ENST00000534166 572 ntTSL 36.15□□□□□ -1.422e-8■■■■■ 29
ILF3Q12906 LUC7L-212ENST00000443357 833 ntTSL 25.96□□□□□ -1.462e-8■■■■■ 29
ILF3Q12906 ANAPC10-206ENST00000504721 477 ntTSL 55.85□□□□□ -1.472e-8■■■■■ 29
ILF3Q12906 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.52e-8■■■■■ 29
ILF3Q12906 ANAPC10-210ENST00000508087 749 ntTSL 34.42□□□□□ -1.72e-8■■■■■ 29
ILF3Q12906 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.712e-8■■■■■ 29
ILF3Q12906 ASPSCR1-213ENST00000582355 1246 ntTSL 523.49■■□□□ 1.352e-8■■■■■ 28.9
ILF3Q12906 ASPSCR1-219ENST00000584454 1919 ntTSL 1 (best)21.82■■□□□ 1.082e-8■■■■■ 28.9
ILF3Q12906 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.052e-8■■■■■ 28.9
ILF3Q12906 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.972e-8■■■■■ 28.9
ILF3Q12906 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.952e-8■■■■■ 28.9
ILF3Q12906 ASPSCR1-216ENST00000583503 641 ntTSL 317.8■□□□□ 0.442e-8■■■■■ 28.9
ILF3Q12906 PLCB1-220ENST00000630757 857 ntTSL 35.57□□□□□ -1.521e-6■■■■■ 28.9
ILF3Q12906 PLCB1-229ENST00000637204 100 ntTSL 52.58□□□□□ -21e-6■■■■■ 28.9
ILF3Q12906 ADAM17-202ENST00000478059 1073 ntTSL 1 (best)13.4□□□□□ -0.265e-8■■■■■ 28.9
ILF3Q12906 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.325e-8■■■■■ 28.9
ILF3Q12906 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.345e-8■■■■■ 28.9
ILF3Q12906 ADAM17-201ENST00000310823 4349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.745e-8■■■■■ 28.9
ILF3Q12906 PRPSAP1-210ENST00000586137 473 ntTSL 310.02□□□□□ -0.812e-6■■■■■ 28.8
ILF3Q12906 ORC2-205ENST00000467605 568 ntTSL 38.93□□□□□ -0.983e-19■■■■■ 28.8
ILF3Q12906 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.075e-16■■■■■ 28.8
ILF3Q12906 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.445e-16■■■■■ 28.8
ILF3Q12906 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.215e-16■■■■■ 28.8
ILF3Q12906 COPA-202ENST00000368069 4664 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.612e-8■■■■■ 28.7
ILF3Q12906 COPA-201ENST00000241704 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.682e-8■■■■■ 28.7
ILF3Q12906 ZCCHC7-203ENST00000461038 2793 ntTSL 1 (best)14.19□□□□□ -0.144e-7■■■■■ 28.7
ILF3Q12906 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.284e-7■■■■■ 28.7
ILF3Q12906 ZCCHC7-206ENST00000488607 884 ntTSL 25.89□□□□□ -1.474e-7■■■■■ 28.7
ILF3Q12906 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.734e-7■■■■■ 28.7
ILF3Q12906 ATP11A-213ENST00000489577 383 ntTSL 510.92□□□□□ -0.661e-6■■■■■ 28.6
ILF3Q12906 ATP11A-207ENST00000459011 353 ntTSL 35.59□□□□□ -1.511e-6■■■■■ 28.6
ILF3Q12906 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.721e-8■■■■■ 28.6
ILF3Q12906 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.831e-8■■■■■ 28.6
ILF3Q12906 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.811e-8■■■■■ 28.6
ILF3Q12906 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.731e-8■■■■■ 28.6
ILF3Q12906 PPP3CC-206ENST00000522000 460 ntTSL 218.52■□□□□ 0.561e-8■■■■■ 28.6
ILF3Q12906 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.119e-8■■■■■ 28.6
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ILF3Q12906 SLC7A5-203ENST00000565644 3983 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.699e-8■■■■■ 28.6
ILF3Q12906 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.312e-21■■■■■ 28.6
ILF3Q12906 CALM3-205ENST00000486500 2536 ntTSL 211.63□□□□□ -0.552e-21■■■■■ 28.6
ILF3Q12906 ARHGAP19-SLIT1-202ENST00000479633 1876 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.766e-7■■■■■ 28.5
ILF3Q12906 ARHGAP19-201ENST00000358308 5390 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.826e-7■■■■■ 28.5
ILF3Q12906 ARHGAP19-203ENST00000371027 2301 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.926e-7■■■■■ 28.5
ILF3Q12906 ARHGAP19-202ENST00000358531 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.966e-7■■■■■ 28.5
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ILF3Q12906 ARHGAP19-205ENST00000487035 4553 ntTSL 26.8□□□□□ -1.326e-7■■■■■ 28.5
ILF3Q12906 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.784e-7■■■■■ 28.5
ILF3Q12906 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.544e-7■■■■■ 28.5
ILF3Q12906 RAC1-204ENST00000488373 845 ntTSL 1 (best)17.75■□□□□ 0.434e-7■■■■■ 28.5
ILF3Q12906 CENPC-201ENST00000273853 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.84e-7■■■■■ 28.5
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ILF3Q12906 CENPC-206ENST00000513216 2799 ntTSL 52.53□□□□□ -24e-7■■■■■ 28.5
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ILF3Q12906 VEZT-224ENST00000550106 3349 ntTSL 1 (best)11.02□□□□□ -0.651e-7■■■■■ 28.5
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ILF3Q12906 VEZT-229ENST00000551472 608 ntTSL 49.74□□□□□ -0.851e-7■■■■■ 28.5
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ILF3Q12906 VEZT-223ENST00000549624 542 ntTSL 49.07□□□□□ -0.961e-7■■■■■ 28.5
ILF3Q12906 VEZT-214ENST00000547997 3002 ntTSL 1 (best)8.84□□□□□ -0.991e-7■■■■■ 28.5
ILF3Q12906 VEZT-206ENST00000546398 2075 ntTSL 1 (best)8.38□□□□□ -1.071e-7■■■■■ 28.5
ILF3Q12906 VEZT-227ENST00000551311 565 ntTSL 47.78□□□□□ -1.161e-7■■■■■ 28.5
ILF3Q12906 VEZT-217ENST00000548455 1024 ntTSL 37.24□□□□□ -1.251e-7■■■■■ 28.5
ILF3Q12906 VEZT-207ENST00000546409 821 ntTSL 47.22□□□□□ -1.251e-7■■■■■ 28.5
ILF3Q12906 VEZT-233ENST00000551902 573 ntTSL 46.97□□□□□ -1.291e-7■■■■■ 28.5
ILF3Q12906 VEZT-219ENST00000548838 2338 ntTSL 26.96□□□□□ -1.291e-7■■■■■ 28.5
ILF3Q12906 VEZT-226ENST00000551039 564 ntTSL 46.65□□□□□ -1.341e-7■■■■■ 28.5
ILF3Q12906 VEZT-234ENST00000551994 2362 ntTSL 26.55□□□□□ -1.361e-7■■■■■ 28.5
ILF3Q12906 VEZT-203ENST00000397792 2484 ntTSL 1 (best)6.23□□□□□ -1.411e-7■■■■■ 28.5
ILF3Q12906 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.491e-7■■■■■ 28.5
ILF3Q12906 VEZT-239ENST00000552821 482 ntTSL 55.59□□□□□ -1.511e-7■■■■■ 28.5
ILF3Q12906 VEZT-241ENST00000553063 591 ntTSL 45.49□□□□□ -1.531e-7■■■■■ 28.5
ILF3Q12906 VEZT-208ENST00000546445 562 ntTSL 45.48□□□□□ -1.531e-7■■■■■ 28.5
ILF3Q12906 VEZT-228ENST00000551356 576 ntTSL 45.41□□□□□ -1.541e-7■■■■■ 28.5
ILF3Q12906 VEZT-205ENST00000546365 558 ntTSL 45.41□□□□□ -1.541e-7■■■■■ 28.5
ILF3Q12906 VEZT-238ENST00000552660 2712 ntTSL 1 (best)5.29□□□□□ -1.561e-7■■■■■ 28.5
ILF3Q12906 VEZT-202ENST00000356859 3942 ntTSL 24.92□□□□□ -1.621e-7■■■■■ 28.5
ILF3Q12906 VEZT-216ENST00000548371 999 ntTSL 34.92□□□□□ -1.621e-7■■■■■ 28.5
ILF3Q12906 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.11e-6■■■■■ 28.3
ILF3Q12906 PECR-202ENST00000442122 1100 ntTSL 213.69□□□□□ -0.228e-8■■■■■ 28.3
ILF3Q12906 STAG2-213ENST00000458700 296 ntTSL 515.18■□□□□ 0.021e-8■■■■■ 28.3
ILF3Q12906 CNOT10-204ENST00000430408 687 ntTSL 37.42□□□□□ -1.221e-8■■■■■ 28.3
ILF3Q12906 STAG2-209ENST00000435103 742 ntTSL 57.23□□□□□ -1.251e-8■■■■■ 28.3
ILF3Q12906 STAG2-206ENST00000394477 385 ntTSL 54.35□□□□□ -1.711e-8■■■■■ 28.3
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