Protein–RNA interactions for Protein: Q03790

NUP53, Nucleoporin NUP53, yeastyeast

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP53Q03790 YDL177CYDL177C 513 nt5.89□□□□□ -1.47
NUP53Q03790 BNA3YJL060W 1335 nt5.89□□□□□ -1.47
NUP53Q03790 GPA1YHR005C 1419 nt5.89□□□□□ -1.47
NUP53Q03790 NSE5YML023C 1671 nt5.88□□□□□ -1.47
NUP53Q03790 PRE3YJL001W 648 nt5.88□□□□□ -1.47
NUP53Q03790 OST3YOR085W 1053 nt5.88□□□□□ -1.47
NUP53Q03790 CBR1YIL043C 855 nt5.87□□□□□ -1.47
NUP53Q03790 ZRT2YLR130C 1269 nt5.87□□□□□ -1.47
NUP53Q03790 ERG12YMR208W 1332 nt5.87□□□□□ -1.47
NUP53Q03790 YMR279CYMR279C 1623 nt5.87□□□□□ -1.47
NUP53Q03790 PPM2YOL141W 2088 nt5.87□□□□□ -1.47
NUP53Q03790 YCR041WYCR041W 333 nt5.86□□□□□ -1.47
NUP53Q03790 FAL1YDR021W 1200 nt5.86□□□□□ -1.47
NUP53Q03790 YER137CYER137C 447 nt5.86□□□□□ -1.47
NUP53Q03790 MPC2YHR162W 390 nt5.86□□□□□ -1.47
NUP53Q03790 MSO1YNR049C 633 nt5.86□□□□□ -1.47
NUP53Q03790 CMR1YDL156W 1569 nt5.85□□□□□ -1.47
NUP53Q03790 DSF1YEL070W 1509 nt5.85□□□□□ -1.47
NUP53Q03790 YNR073CYNR073C 1509 nt5.85□□□□□ -1.47
NUP53Q03790 YFL052WYFL052W 1398 nt5.85□□□□□ -1.47
NUP53Q03790 LYS1YIR034C 1122 nt5.85□□□□□ -1.47
NUP53Q03790 RFC4YOL094C 972 nt5.85□□□□□ -1.47
NUP53Q03790 RPS28AYOR167C 204 nt5.85□□□□□ -1.47
NUP53Q03790 HST2YPL015C 1074 nt5.85□□□□□ -1.47
NUP53Q03790 SEC24YIL109C 2781 nt5.85□□□□□ -1.47
NUP53Q03790 SGE1YPR198W 1632 nt5.85□□□□□ -1.47
NUP53Q03790 PAC2YER007W 1557 nt5.84□□□□□ -1.47
NUP53Q03790 TUF1YOR187W 1314 nt5.84□□□□□ -1.47
NUP53Q03790 TIM22YDL217C 624 nt5.84□□□□□ -1.47
NUP53Q03790 RMD8YFR048W 1989 nt5.84□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 YPR196WYPR196W 1413 nt5.83□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 NUP84YDL116W 2181 nt5.83□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 PEX3YDR329C 1326 nt5.83□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 TFC6YDR362C 2019 nt5.83□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 SEM1YDR363W-A 270 nt5.83□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 FZF1YGL254W 900 nt5.83□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 VPS24YKL041W 675 nt5.83□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 YLR112WYLR112W 420 nt5.83□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 ECM30YLR436C 3825 nt5.83□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 RUF23RUF23 254 nt5.83□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 YPL257WYPL257W 582 nt5.83□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 ADH5YBR145W 1056 nt5.83□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 YKR018CYKR018C 2178 nt5.83□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 ERG1YGR175C 1491 nt5.83□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 AMN1YBR158W 1650 nt5.82□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 HVG1YER039C 750 nt5.82□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 SNT309YPR101W 528 nt5.82□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 ATF1YOR377W 1578 nt5.81□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 LYS21YDL131W 1323 nt5.81□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 ORM1YGR038W 669 nt5.81□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt5.81□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 ATG36YJL185C 882 nt5.81□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 SRL2YLR082C 1179 nt5.81□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 PRB1YEL060C 1908 nt5.81□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 ARE2YNR019W 1929 nt5.8□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 IRC7YFR055W 1023 nt5.8□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 YHL018WYHL018W 363 nt5.8□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 MOG1YJR074W 657 nt5.8□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 TSR3YOR006C 942 nt5.8□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 DFR1YOR236W 636 nt5.8□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 GAA1YLR088W 1845 nt5.8□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 PTC3YBL056W 1407 nt5.8□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 TIF2YJL138C 1188 nt5.79□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 YJL211CYJL211C 444 nt5.79□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 TIF1YKR059W 1188 nt5.79□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 DAL4YIR028W 1908 nt5.79□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 OPT1YJL212C 2400 nt5.78□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 CEM1YER061C 1329 nt5.78□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 MRPL28YDR462W 444 nt5.78□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 YJR146WYJR146W 354 nt5.78□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 MEU1YLR017W 1014 nt5.78□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 FPR3YML074C 1236 nt5.78□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 TOD6YBL054W 1578 nt5.78□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 IRC11YOR013W 471 nt5.78□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 YOR200WYOR200W 399 nt5.78□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 UIP4YPL186C 915 nt5.78□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 IVY1YDR229W 1362 nt5.78□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 JIP4YDR475C 2631 nt5.78□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 MPA43YNL249C 1629 nt5.77□□□□□ -1.48
NUP53Q03790 STT3YGL022W 2157 nt5.77□□□□□ -1.49
NUP53Q03790 RVB2YPL235W 1416 nt5.77□□□□□ -1.49
NUP53Q03790 YDR401WYDR401W 564 nt5.77□□□□□ -1.49
NUP53Q03790 YJR084WYJR084W 1272 nt5.77□□□□□ -1.49
NUP53Q03790 MIA40YKL195W 1212 nt5.77□□□□□ -1.49
NUP53Q03790 DID2YKR035W-A 615 nt5.77□□□□□ -1.49
NUP53Q03790 SEN34YAR008W 828 nt5.77□□□□□ -1.49
NUP53Q03790 PET20YPL159C 762 nt5.77□□□□□ -1.49
NUP53Q03790 OPI11YPR044C 354 nt5.77□□□□□ -1.49
NUP53Q03790 YGR054WYGR054W 1929 nt5.77□□□□□ -1.49
NUP53Q03790 ENP1YBR247C 1452 nt5.77□□□□□ -1.49
NUP53Q03790 AIM3YBR108W 2844 nt5.76□□□□□ -1.49
NUP53Q03790 FET4YMR319C 1659 nt5.76□□□□□ -1.49
NUP53Q03790 MKK1YOR231W 1527 nt5.76□□□□□ -1.49
NUP53Q03790 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt5.76□□□□□ -1.49
NUP53Q03790 MTR3YGR158C 753 nt5.76□□□□□ -1.49
NUP53Q03790 AAT2YLR027C 1257 nt5.76□□□□□ -1.49
NUP53Q03790 GTO3YMR251W 1101 nt5.76□□□□□ -1.49
NUP53Q03790 PTC4YBR125C 1182 nt5.76□□□□□ -1.49
NUP53Q03790 SLA2YNL243W 2907 nt5.76□□□□□ -1.49
NUP53Q03790 EMP65YER140W 1671 nt5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 71.2 ms