Protein–RNA interactions for Protein: Q03390

VPS60, Vacuolar protein-sorting-associated protein 60, yeastyeast

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS60Q03390 NTE1YML059C 5040 nt7.02□□□□□ -1.29
VPS60Q03390 PGM1YKL127W 1713 nt7.02□□□□□ -1.29
VPS60Q03390 RPS28AYOR167C 204 nt7.02□□□□□ -1.29
VPS60Q03390 DAL7YIR031C 1665 nt7.02□□□□□ -1.29
VPS60Q03390 DID2YKR035W-A 615 nt7.01□□□□□ -1.29
VPS60Q03390 RIB1YBL033C 1038 nt7.01□□□□□ -1.29
VPS60Q03390 YHR131CYHR131C 2553 nt7.01□□□□□ -1.29
VPS60Q03390 NUP49YGL172W 1419 nt7.01□□□□□ -1.29
VPS60Q03390 YLR162WYLR162W 357 nt7□□□□□ -1.29
VPS60Q03390 BSC4YNL269W 396 nt7□□□□□ -1.29
VPS60Q03390 YPL257WYPL257W 582 nt7□□□□□ -1.29
VPS60Q03390 FET4YMR319C 1659 nt7□□□□□ -1.29
VPS60Q03390 PRY3YJL078C 2646 nt6.99□□□□□ -1.29
VPS60Q03390 SOD2YHR008C 702 nt6.99□□□□□ -1.29
VPS60Q03390 ARA2YMR041C 1008 nt6.99□□□□□ -1.29
VPS60Q03390 FRE5YOR384W 2085 nt6.98□□□□□ -1.29
VPS60Q03390 QCR8YJL166W 285 nt6.98□□□□□ -1.29
VPS60Q03390 MRPS12YNR036C 462 nt6.97□□□□□ -1.29
VPS60Q03390 VPS5YOR069W 2028 nt6.97□□□□□ -1.29
VPS60Q03390 CST26YBR042C 1194 nt6.97□□□□□ -1.29
VPS60Q03390 DAL4YIR028W 1908 nt6.97□□□□□ -1.29
VPS60Q03390 FIT2YOR382W 462 nt6.96□□□□□ -1.3
VPS60Q03390 PRP24YMR268C 1335 nt6.96□□□□□ -1.3
VPS60Q03390 IVY1YDR229W 1362 nt6.95□□□□□ -1.3
VPS60Q03390 FAL1YDR021W 1200 nt6.95□□□□□ -1.3
VPS60Q03390 COA1YIL157C 594 nt6.95□□□□□ -1.3
VPS60Q03390 CLB2YPR119W 1476 nt6.94□□□□□ -1.3
VPS60Q03390 CYS3YAL012W 1185 nt6.94□□□□□ -1.3
VPS60Q03390 LDB16YCL005W 771 nt6.94□□□□□ -1.3
VPS60Q03390 YHK8YHR048W 1545 nt6.94□□□□□ -1.3
VPS60Q03390 EFM3YJR129C 1020 nt6.93□□□□□ -1.3
VPS60Q03390 YKL077WYKL077W 1179 nt6.93□□□□□ -1.3
VPS60Q03390 CCP1YKR066C 1086 nt6.93□□□□□ -1.3
VPS60Q03390 PXL1YKR090W 2121 nt6.93□□□□□ -1.3
VPS60Q03390 IES2YNL215W 963 nt6.93□□□□□ -1.3
VPS60Q03390 YHL017WYHL017W 1599 nt6.93□□□□□ -1.3
VPS60Q03390 BZZ1YHR114W 1902 nt6.93□□□□□ -1.3
VPS60Q03390 YDR278CYDR278C 318 nt6.92□□□□□ -1.3
VPS60Q03390 MDE1YJR024C 735 nt6.92□□□□□ -1.3
VPS60Q03390 MRPL23YOR150W 492 nt6.92□□□□□ -1.3
VPS60Q03390 YOR343CYOR343C 327 nt6.92□□□□□ -1.3
VPS60Q03390 YJL163CYJL163C 1668 nt6.92□□□□□ -1.3
VPS60Q03390 YFL042CYFL042C 2025 nt6.91□□□□□ -1.3
VPS60Q03390 UBP13YBL067C 2244 nt6.91□□□□□ -1.3
VPS60Q03390 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt6.91□□□□□ -1.3
VPS60Q03390 RUF23RUF23 254 nt6.91□□□□□ -1.3
VPS60Q03390 KTR1YOR099W 1182 nt6.91□□□□□ -1.3
VPS60Q03390 YPR123CYPR123C 435 nt6.91□□□□□ -1.3
VPS60Q03390 MFG1YDL233W 1377 nt6.9□□□□□ -1.31
VPS60Q03390 PTK2YJR059W 2457 nt6.9□□□□□ -1.31
VPS60Q03390 YOL036WYOL036W 2286 nt6.89□□□□□ -1.31
VPS60Q03390 YRB2YIL063C 984 nt6.89□□□□□ -1.31
VPS60Q03390 LYS1YIR034C 1122 nt6.89□□□□□ -1.31
VPS60Q03390 LCB3YJL134W 1230 nt6.89□□□□□ -1.31
VPS60Q03390 YPR076WYPR076W 375 nt6.89□□□□□ -1.31
VPS60Q03390 SLX5YDL013W 1860 nt6.88□□□□□ -1.31
VPS60Q03390 AMA1YGR225W 1782 nt6.88□□□□□ -1.31
VPS60Q03390 YML083CYML083C 1257 nt6.88□□□□□ -1.31
VPS60Q03390 RNH1YMR234W 1047 nt6.88□□□□□ -1.31
VPS60Q03390 MRS1YIR021W 1092 nt6.87□□□□□ -1.31
VPS60Q03390 YIR042CYIR042C 711 nt6.87□□□□□ -1.31
VPS60Q03390 YML079WYML079W 606 nt6.87□□□□□ -1.31
VPS60Q03390 RPL21AYBR191W 483 nt6.87□□□□□ -1.31
VPS60Q03390 VPS4YPR173C 1314 nt6.86□□□□□ -1.31
VPS60Q03390 PAT1YCR077C 2391 nt6.86□□□□□ -1.31
VPS60Q03390 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt6.86□□□□□ -1.31
VPS60Q03390 HSP150YJL159W 1242 nt6.86□□□□□ -1.31
VPS60Q03390 YAR064WYAR064W 300 nt6.86□□□□□ -1.31
VPS60Q03390 ALT2YDR111C 1524 nt6.86□□□□□ -1.31
VPS60Q03390 HRQ1YDR291W 3234 nt6.86□□□□□ -1.31
VPS60Q03390 YGR054WYGR054W 1929 nt6.86□□□□□ -1.31
VPS60Q03390 FMP40YPL222W 2067 nt6.85□□□□□ -1.31
VPS60Q03390 AGX1YFL030W 1158 nt6.85□□□□□ -1.31
VPS60Q03390 MEH1YKR007W 555 nt6.85□□□□□ -1.31
VPS60Q03390 ECM31YBR176W 939 nt6.85□□□□□ -1.31
VPS60Q03390 PGK1YCR012W 1251 nt6.84□□□□□ -1.31
VPS60Q03390 POP5YAL033W 522 nt6.84□□□□□ -1.31
VPS60Q03390 KAE1YKR038C 1161 nt6.84□□□□□ -1.31
VPS60Q03390 PSR2YLR019W 1194 nt6.84□□□□□ -1.31
VPS60Q03390 YOL046CYOL046C 675 nt6.84□□□□□ -1.31
VPS60Q03390 PDR18YNR070W 4002 nt6.84□□□□□ -1.32
VPS60Q03390 ALD6YPL061W 1503 nt6.83□□□□□ -1.32
VPS60Q03390 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt6.83□□□□□ -1.32
VPS60Q03390 SML1YML058W 315 nt6.83□□□□□ -1.32
VPS60Q03390 ASR1YPR093C 867 nt6.83□□□□□ -1.32
VPS60Q03390 ARE2YNR019W 1929 nt6.82□□□□□ -1.32
VPS60Q03390 PPH21YDL134C 1110 nt6.82□□□□□ -1.32
VPS60Q03390 RPL7AYGL076C 735 nt6.82□□□□□ -1.32
VPS60Q03390 RPL7BYPL198W 735 nt6.82□□□□□ -1.32
VPS60Q03390 LAT1YNL071W 1449 nt6.82□□□□□ -1.32
VPS60Q03390 LSG1YGL099W 1923 nt6.82□□□□□ -1.32
VPS60Q03390 MCM6YGL201C 3054 nt6.81□□□□□ -1.32
VPS60Q03390 VMA3YEL027W 483 nt6.81□□□□□ -1.32
VPS60Q03390 Q0010Q0010 387 nt6.81□□□□□ -1.32
VPS60Q03390 SAC6YDR129C 1929 nt6.81□□□□□ -1.32
VPS60Q03390 KEX2YNL238W 2445 nt6.81□□□□□ -1.32
VPS60Q03390 YKL102CYKL102C 306 nt6.8□□□□□ -1.32
VPS60Q03390 CTF19YPL018W 1110 nt6.8□□□□□ -1.32
VPS60Q03390 NHP6BYBR089C-A 300 nt6.8□□□□□ -1.32
VPS60Q03390 QNS1YHR074W 2145 nt6.8□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 143.3 ms