Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC24CP53992 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC24CP53992 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms