Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPARGC1BQ86YN6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms