Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC2

LARP4, La-related protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP4Q71RC2 GMDS-AS1-213ENST00000534441 738 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.981e-6■■■■■ 31.2
LARP4Q71RC2 MIR548XHG-201ENST00000355189 673 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.155e-7■■■■■ 31.2
LARP4Q71RC2 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.665e-7■■■■■ 31.2
LARP4Q71RC2 LINC00662-204ENST00000588027 562 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.585e-7■■■■■ 31.2
LARP4Q71RC2 LINC00662-202ENST00000586248 669 ntTSL 311.03□□□□□ -0.645e-7■■■■■ 31.2
LARP4Q71RC2 LINC00662-207ENST00000590677 883 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.115e-7■■■■■ 31.2
LARP4Q71RC2 RPS21-205ENST00000492356 429 ntTSL 1 (best)11.13□□□□□ -0.631e-34■■■■■ 31.2
LARP4Q71RC2 RPS21-201ENST00000343986 344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.011e-34■■■■■ 31.2
LARP4Q71RC2 LCORL-206ENST00000512376 500 ntTSL 516.43■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 31.2
LARP4Q71RC2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.622e-7■■■■■ 31.1
LARP4Q71RC2 CTSH-213ENST00000533777 2101 ntTSL 1 (best)17.57■□□□□ 0.42e-7■■■■■ 31.1
LARP4Q71RC2 CTSH-202ENST00000525807 1122 ntTSL 517.28■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 31.1
LARP4Q71RC2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.089e-11■■■■■ 31.1
LARP4Q71RC2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.44e-13■■■■■ 31.1
LARP4Q71RC2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.14e-13■■■■■ 31.1
LARP4Q71RC2 UBB-207ENST00000578649 477 ntTSL 511.68□□□□□ -0.544e-13■■■■■ 31.1
LARP4Q71RC2 UBB-209ENST00000614404 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.754e-13■■■■■ 31.1
LARP4Q71RC2 UBB-202ENST00000395837 1014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.994e-13■■■■■ 31.1
LARP4Q71RC2 UBB-204ENST00000535788 704 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.074e-13■■■■■ 31.1
LARP4Q71RC2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.62e-8■■■■■ 31.1
LARP4Q71RC2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.422e-8■■■■■ 31.1
LARP4Q71RC2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.382e-8■■■■■ 31.1
LARP4Q71RC2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.142e-8■■■■■ 31.1
LARP4Q71RC2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.032e-8■■■■■ 31.1
LARP4Q71RC2 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.022e-8■■■■■ 31.1
LARP4Q71RC2 RPH3AL-205ENST00000570893 594 ntTSL 315.12■□□□□ 0.012e-8■■■■■ 31.1
LARP4Q71RC2 RAB17-202ENST00000392001 1792 ntTSL 1 (best)15□□□□□ -0.012e-8■■■■■ 31.1
LARP4Q71RC2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.032e-8■■■■■ 31.1
LARP4Q71RC2 RAB17-206ENST00000414278 1511 ntTSL 214.54□□□□□ -0.082e-8■■■■■ 31.1
LARP4Q71RC2 RPH3AL-219ENST00000576001 647 ntTSL 314.24□□□□□ -0.132e-8■■■■■ 31.1
LARP4Q71RC2 RAB17-205ENST00000411462 663 ntTSL 213.76□□□□□ -0.212e-8■■■■■ 31.1
LARP4Q71RC2 RAB17-210ENST00000477149 3211 ntTSL 1 (best)13.24□□□□□ -0.292e-8■■■■■ 31.1
LARP4Q71RC2 RAB17-208ENST00000430445 421 ntTSL 512.39□□□□□ -0.432e-8■■■■■ 31.1
LARP4Q71RC2 RPH3AL-206ENST00000570954 568 ntTSL 411.58□□□□□ -0.562e-8■■■■■ 31.1
LARP4Q71RC2 MBNL2-206ENST00000469707 2574 ntTSL 1 (best)7.94□□□□□ -1.142e-8■■■■■ 31.1
LARP4Q71RC2 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.42e-8■■■■■ 31.1
LARP4Q71RC2 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.452e-8■■■■■ 31.1
LARP4Q71RC2 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.52e-8■■■■■ 31.1
LARP4Q71RC2 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.512e-8■■■■■ 31.1
LARP4Q71RC2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.726e-6■■■■■ 31
LARP4Q71RC2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.656e-6■■■■■ 31
LARP4Q71RC2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.596e-6■■■■■ 31
LARP4Q71RC2 EIF4A1-222ENST00000582050 576 ntTSL 517.06■□□□□ 0.322e-17■■■■■ 31
LARP4Q71RC2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.236e-6■■■■■ 31
LARP4Q71RC2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.212e-17■■■■■ 31
LARP4Q71RC2 EIF4A1-207ENST00000578324 1577 ntTSL 515.89■□□□□ 0.132e-17■■■■■ 31
LARP4Q71RC2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.064e-11■■■■■ 31
LARP4Q71RC2 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.26e-6■■■■■ 31
LARP4Q71RC2 EIF4A1-228ENST00000583389 951 ntTSL 313.66□□□□□ -0.222e-17■■■■■ 31
LARP4Q71RC2 RAB28-205ENST00000508274 1551 ntTSL 1 (best)13□□□□□ -0.336e-6■■■■■ 31
LARP4Q71RC2 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.486e-6■■■■■ 31
LARP4Q71RC2 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.496e-12■■■■■ 31
LARP4Q71RC2 FHIT-204ENST00000468189 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.616e-6■■■■■ 31
LARP4Q71RC2 AC016876.2-201ENST00000581621 4554 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.644e-11■■■■■ 31
LARP4Q71RC2 SENP3-EIF4A1-201ENST00000614237 3519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.684e-11■■■■■ 31
LARP4Q71RC2 EIF4A1-225ENST00000582746 1645 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.714e-11■■■■■ 31
LARP4Q71RC2 FHIT-206ENST00000488467 601 ntTSL 310.18□□□□□ -0.786e-6■■■■■ 31
LARP4Q71RC2 SUCLG2P4-201ENST00000514739 1027 ntBASIC9.33□□□□□ -0.924e-11■■■■■ 31
LARP4Q71RC2 RAB28-207ENST00000511649 715 ntTSL 55.89□□□□□ -1.476e-6■■■■■ 31
LARP4Q71RC2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 31
LARP4Q71RC2 NDUFA2-203ENST00000510680 576 ntTSL 212.33□□□□□ -0.443e-8■■■■■ 31
LARP4Q71RC2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.412e-18■■■■■ 31
LARP4Q71RC2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.282e-18■■■■■ 31
LARP4Q71RC2 UBL5-206ENST00000589960 307 ntTSL 316.68■□□□□ 0.262e-18■■■■■ 31
LARP4Q71RC2 UBL5-205ENST00000589372 1450 ntTSL 216.55■□□□□ 0.242e-18■■■■■ 31
LARP4Q71RC2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.022e-18■■■■■ 31
LARP4Q71RC2 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.62e-18■■■■■ 31
LARP4Q71RC2 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.375e-7■■■■■ 30.9
LARP4Q71RC2 AC005208.1-202ENST00000587325 725 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.385e-7■■■■■ 30.9
LARP4Q71RC2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.541e-11■■■■■ 30.9
LARP4Q71RC2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.331e-11■■■■■ 30.9
LARP4Q71RC2 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.161e-11■■■■■ 30.9
LARP4Q71RC2 SERPINA5-204ENST00000554220 586 ntTSL 49.37□□□□□ -0.911e-11■■■■■ 30.9
LARP4Q71RC2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.011e-6■■■■■ 30.9
LARP4Q71RC2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.011e-6■■■■■ 30.9
LARP4Q71RC2 FAM19A5-205ENST00000473898 897 ntTSL 217.9■□□□□ 0.461e-6■■■■■ 30.9
LARP4Q71RC2 FAM19A5-201ENST00000336769 546 ntTSL 411.09□□□□□ -0.631e-6■■■■■ 30.9
LARP4Q71RC2 SCHLAP1-201ENST00000629145 1436 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.222e-6■■■■■ 30.8
LARP4Q71RC2 SLC5A9-205ENST00000471020 1989 ntTSL 1 (best)14.84□□□□□ -0.033e-8■■■■■ 30.8
LARP4Q71RC2 SLC5A9-203ENST00000438567 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.423e-8■■■■■ 30.8
LARP4Q71RC2 SLC5A9-206ENST00000493837 3769 ntTSL 210□□□□□ -0.813e-8■■■■■ 30.8
LARP4Q71RC2 SLC5A9-201ENST00000236495 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.843e-8■■■■■ 30.8
LARP4Q71RC2 ARHGAP11B-209ENST00000602616 5637 ntTSL 311.7□□□□□ -0.543e-6■■■■■ 30.8
LARP4Q71RC2 ARHGAP11B-202ENST00000562954 652 ntTSL 37.52□□□□□ -1.213e-6■■■■■ 30.8
LARP4Q71RC2 FBL-210ENST00000599159 1400 ntTSL 1 (best)20.32■□□□□ 0.848e-8■■■■■ 30.7
LARP4Q71RC2 FBL-203ENST00000594309 603 ntTSL 219.8■□□□□ 0.768e-8■■■■■ 30.7
LARP4Q71RC2 FBL-211ENST00000601274 877 ntTSL 519.8■□□□□ 0.762e-7■■■■■ 30.7
LARP4Q71RC2 FBL-209ENST00000599134 500 ntTSL 518.68■□□□□ 0.588e-8■■■■■ 30.7
LARP4Q71RC2 FBL-208ENST00000598417 581 ntTSL 517.03■□□□□ 0.328e-8■■■■■ 30.7
LARP4Q71RC2 FBL-207ENST00000597634 726 ntTSL 513.81□□□□□ -0.28e-8■■■■■ 30.7
LARP4Q71RC2 FBL-206ENST00000597224 732 ntTSL 37.89□□□□□ -1.152e-7■■■■■ 30.7
LARP4Q71RC2 TMX2-206ENST00000528110 829 ntTSL 28.19□□□□□ -1.18e-8■■■■■ 30.7
LARP4Q71RC2 TMX2-208ENST00000530114 663 ntTSL 37.49□□□□□ -1.218e-8■■■■■ 30.7
LARP4Q71RC2 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 30.7
LARP4Q71RC2 DMAC1-202ENST00000469050 458 ntTSL 310.23□□□□□ -0.771e-6■■■■■ 30.7
LARP4Q71RC2 DMAC1-203ENST00000484082 547 ntTSL 55.12□□□□□ -1.591e-6■■■■■ 30.7
LARP4Q71RC2 MZT2B-206ENST00000480182 480 ntTSL 1 (best)17.61■□□□□ 0.411e-9■■■■■ 30.7
LARP4Q71RC2 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.065e-7■■■■■ 30.7
LARP4Q71RC2 FKBP8-204ENST00000596015 612 ntTSL 315.58■□□□□ 0.081e-8■■■■■ 30.6
LARP4Q71RC2 FKBP8-212ENST00000606531 460 ntTSL 213.36□□□□□ -0.271e-8■■■■■ 30.6
Retrieved 100 of 15,922 protein–RNA pairs in 102.5 ms