Protein–RNA interactions for Protein: Q12234

RUD3, GRIP domain-containing protein RUD3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RUD3Q12234 SUF16tG(GCC)C 71 nt7.06□□□□□ -1.28
RUD3Q12234 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt7.06□□□□□ -1.28
RUD3Q12234 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt7.06□□□□□ -1.28
RUD3Q12234 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt7.06□□□□□ -1.28
RUD3Q12234 SUF20tG(GCC)F1 71 nt7.06□□□□□ -1.28
RUD3Q12234 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt7.06□□□□□ -1.28
RUD3Q12234 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt7.06□□□□□ -1.28
RUD3Q12234 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt7.06□□□□□ -1.28
RUD3Q12234 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt7.06□□□□□ -1.28
RUD3Q12234 SUF23tG(GCC)J2 71 nt7.06□□□□□ -1.28
RUD3Q12234 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt7.06□□□□□ -1.28
RUD3Q12234 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt7.06□□□□□ -1.28
RUD3Q12234 SUF17tG(GCC)O2 71 nt7.06□□□□□ -1.28
RUD3Q12234 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt7.06□□□□□ -1.28
RUD3Q12234 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt7.06□□□□□ -1.28
RUD3Q12234 PTC7YHR076W 1032 nt7.06□□□□□ -1.28
RUD3Q12234 NTG2YOL043C 1143 nt7.06□□□□□ -1.28
RUD3Q12234 YBR113WYBR113W 483 nt7.06□□□□□ -1.28
RUD3Q12234 YPT1YFL038C 621 nt7.05□□□□□ -1.28
RUD3Q12234 GET4YOR164C 939 nt7.03□□□□□ -1.28
RUD3Q12234 NOG2YNR053C 1461 nt7.03□□□□□ -1.28
RUD3Q12234 TKL2YBR117C 2046 nt7.03□□□□□ -1.28
RUD3Q12234 MRPS28YDR337W 861 nt7.02□□□□□ -1.29
RUD3Q12234 YHR020WYHR020W 2067 nt7.02□□□□□ -1.29
RUD3Q12234 YBR284WYBR284W 2394 nt7.01□□□□□ -1.29
RUD3Q12234 MIA40YKL195W 1212 nt7.01□□□□□ -1.29
RUD3Q12234 YOR268CYOR268C 399 nt7.01□□□□□ -1.29
RUD3Q12234 DML1YMR211W 1428 nt7.01□□□□□ -1.29
RUD3Q12234 RAP1YNL216W 2484 nt7□□□□□ -1.29
RUD3Q12234 PIH1YHR034C 1035 nt7□□□□□ -1.29
RUD3Q12234 PEX13YLR191W 1161 nt7□□□□□ -1.29
RUD3Q12234 DFR1YOR236W 636 nt7□□□□□ -1.29
RUD3Q12234 UTR2YEL040W 1404 nt7□□□□□ -1.29
RUD3Q12234 STT3YGL022W 2157 nt6.99□□□□□ -1.29
RUD3Q12234 RIO1YOR119C 1455 nt6.99□□□□□ -1.29
RUD3Q12234 HXT2YMR011W 1626 nt6.99□□□□□ -1.29
RUD3Q12234 FBA1YKL060C 1080 nt6.99□□□□□ -1.29
RUD3Q12234 YML079WYML079W 606 nt6.98□□□□□ -1.29
RUD3Q12234 EDE1YBL047C 4146 nt6.98□□□□□ -1.29
RUD3Q12234 NTE1YML059C 5040 nt6.98□□□□□ -1.29
RUD3Q12234 PPM2YOL141W 2088 nt6.97□□□□□ -1.29
RUD3Q12234 YNR005CYNR005C 405 nt6.97□□□□□ -1.29
RUD3Q12234 HTZ1YOL012C 405 nt6.97□□□□□ -1.29
RUD3Q12234 YPR130CYPR130C 408 nt6.97□□□□□ -1.29
RUD3Q12234 HXK2YGL253W 1461 nt6.97□□□□□ -1.29
RUD3Q12234 HIS7YBR248C 1659 nt6.96□□□□□ -1.29
RUD3Q12234 THI2YBR240C 1353 nt6.96□□□□□ -1.29
RUD3Q12234 ERG10YPL028W 1197 nt6.96□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 CRP1YHR146W 1398 nt6.95□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 HDA1YNL021W 2121 nt6.95□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 FZF1YGL254W 900 nt6.95□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 RPP1YHR062C 882 nt6.95□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 ICS3YJL077C 396 nt6.95□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 ATG36YJL185C 882 nt6.95□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 TMA46YOR091W 1038 nt6.95□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 GEF1YJR040W 2340 nt6.95□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 HXT17YNR072W 1695 nt6.94□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 APE4YHR113W 1473 nt6.94□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 GFA1YKL104C 2154 nt6.94□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 CIS3YJL158C 684 nt6.94□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 PTH2YBL057C 627 nt6.94□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 PRE5YMR314W 705 nt6.94□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 YFR006WYFR006W 1608 nt6.94□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 IMA5YJL216C 1746 nt6.93□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 POP1YNL221C 2628 nt6.93□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 TRR2YHR106W 1029 nt6.93□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 SQT1YIR012W 1296 nt6.93□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 SMX3YPR182W 261 nt6.93□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 TPO3YPR156C 1869 nt6.93□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 ATF1YOR377W 1578 nt6.92□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 CIA1YDR267C 993 nt6.92□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 PRI1YIR008C 1230 nt6.92□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 YPL067CYPL067C 597 nt6.92□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 YGL102CYGL102C 429 nt6.91□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 PUP2YGR253C 783 nt6.91□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt6.91□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 YLR123CYLR123C 330 nt6.91□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 DUS4YLR405W 1104 nt6.91□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 PRS4YBL068W 981 nt6.91□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 MOD5YOR274W 1287 nt6.91□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 MSY1YPL097W 1479 nt6.91□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 PXL1YKR090W 2121 nt6.91□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 EHD3YDR036C 1503 nt6.91□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 PAB1YER165W 1734 nt6.9□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 YIL055CYIL055C 1884 nt6.9□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 PPM1YDR435C 987 nt6.9□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 HEM2YGL040C 1029 nt6.9□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 DMA1YHR115C 1251 nt6.9□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 YLR312CYLR312C 1197 nt6.9□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 YPQ1YOL092W 927 nt6.9□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt6.9□□□□□ -1.3
RUD3Q12234 UME1YPL139C 1383 nt6.9□□□□□ -1.31
RUD3Q12234 COQ1YBR003W 1422 nt6.9□□□□□ -1.31
RUD3Q12234 ALT2YDR111C 1524 nt6.9□□□□□ -1.31
RUD3Q12234 CYC8YBR112C 2901 nt6.9□□□□□ -1.31
RUD3Q12234 YGR127WYGR127W 939 nt6.89□□□□□ -1.31
RUD3Q12234 YNL120CYNL120C 486 nt6.89□□□□□ -1.31
RUD3Q12234 YML133CYML133C 4125 nt6.88□□□□□ -1.31
RUD3Q12234 KSH1YNL024C-A 219 nt6.88□□□□□ -1.31
RUD3Q12234 YCL049CYCL049C 939 nt6.88□□□□□ -1.31
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