Protein–RNA interactions for Protein: P53063

RAI1, Decapping nuclease RAI1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RAI1P53063 AMN1YBR158W 1650 nt6.66□□□□□ -1.34
RAI1P53063 GRH1YDR517W 1119 nt6.66□□□□□ -1.34
RAI1P53063 SUN4YNL066W 1263 nt6.66□□□□□ -1.34
RAI1P53063 HST2YPL015C 1074 nt6.66□□□□□ -1.34
RAI1P53063 IPL1YPL209C 1104 nt6.66□□□□□ -1.34
RAI1P53063 RAM1YDL090C 1296 nt6.65□□□□□ -1.34
RAI1P53063 YDL129WYDL129W 876 nt6.65□□□□□ -1.34
RAI1P53063 TDH1YJL052W 999 nt6.65□□□□□ -1.34
RAI1P53063 MHO1YJR008W 1017 nt6.65□□□□□ -1.34
RAI1P53063 VAM3YOR106W 852 nt6.65□□□□□ -1.34
RAI1P53063 PHO85YPL031C 918 nt6.65□□□□□ -1.34
RAI1P53063 CDC7YDL017W 1524 nt6.65□□□□□ -1.35
RAI1P53063 VBA5YKR105C 1749 nt6.64□□□□□ -1.35
RAI1P53063 DAL4YIR028W 1908 nt6.64□□□□□ -1.35
RAI1P53063 RMD5YDR255C 1266 nt6.64□□□□□ -1.35
RAI1P53063 ELC1YPL046C 300 nt6.64□□□□□ -1.35
RAI1P53063 CLD1YGR110W 1338 nt6.64□□□□□ -1.35
RAI1P53063 BSC5YNR069C 1470 nt6.64□□□□□ -1.35
RAI1P53063 YLL058WYLL058W 1728 nt6.64□□□□□ -1.35
RAI1P53063 BDF2YDL070W 1917 nt6.64□□□□□ -1.35
RAI1P53063 POX1YGL205W 2247 nt6.64□□□□□ -1.35
RAI1P53063 CEM1YER061C 1329 nt6.63□□□□□ -1.35
RAI1P53063 YAL045CYAL045C 309 nt6.63□□□□□ -1.35
RAI1P53063 DRS1YLL008W 2259 nt6.63□□□□□ -1.35
RAI1P53063 SPO77YLR341W 1434 nt6.63□□□□□ -1.35
RAI1P53063 RNH1YMR234W 1047 nt6.63□□□□□ -1.35
RAI1P53063 RFA2YNL312W 822 nt6.63□□□□□ -1.35
RAI1P53063 OPI11YPR044C 354 nt6.63□□□□□ -1.35
RAI1P53063 YBR241CYBR241C 1467 nt6.63□□□□□ -1.35
RAI1P53063 STD1YOR047C 1335 nt6.62□□□□□ -1.35
RAI1P53063 PCL9YDL179W 915 nt6.62□□□□□ -1.35
RAI1P53063 YEA6YEL006W 1008 nt6.62□□□□□ -1.35
RAI1P53063 BIM1YER016W 1035 nt6.62□□□□□ -1.35
RAI1P53063 YGR210CYGR210C 1236 nt6.62□□□□□ -1.35
RAI1P53063 SPC42YKL042W 1092 nt6.62□□□□□ -1.35
RAI1P53063 PPA2YMR267W 933 nt6.62□□□□□ -1.35
RAI1P53063 YOL024WYOL024W 519 nt6.62□□□□□ -1.35
RAI1P53063 VPS28YPL065W 729 nt6.62□□□□□ -1.35
RAI1P53063 RPS6AYPL090C 711 nt6.62□□□□□ -1.35
RAI1P53063 RPS6BYBR181C 711 nt6.62□□□□□ -1.35
RAI1P53063 GLN3YER040W 2193 nt6.62□□□□□ -1.35
RAI1P53063 GFA1YKL104C 2154 nt6.62□□□□□ -1.35
RAI1P53063 PAP1YKR002W 1707 nt6.62□□□□□ -1.35
RAI1P53063 PET112YBL080C 1626 nt6.61□□□□□ -1.35
RAI1P53063 ARH1YDR376W 1482 nt6.61□□□□□ -1.35
RAI1P53063 CLB5YPR120C 1308 nt6.61□□□□□ -1.35
RAI1P53063 HSP12YFL014W 330 nt6.61□□□□□ -1.35
RAI1P53063 GTO1YGR154C 1071 nt6.61□□□□□ -1.35
RAI1P53063 YHR022CYHR022C 771 nt6.61□□□□□ -1.35
RAI1P53063 CTF8YHR191C 402 nt6.61□□□□□ -1.35
RAI1P53063 GCV3YAL044C 513 nt6.61□□□□□ -1.35
RAI1P53063 NEJ1YLR265C 1029 nt6.61□□□□□ -1.35
RAI1P53063 DSC2YOL073C 969 nt6.61□□□□□ -1.35
RAI1P53063 YPL108WYPL108W 507 nt6.61□□□□□ -1.35
RAI1P53063 ISA2YPR067W 558 nt6.61□□□□□ -1.35
RAI1P53063 MHP1YJL042W 4197 nt6.61□□□□□ -1.35
RAI1P53063 PGI1YBR196C 1665 nt6.61□□□□□ -1.35
RAI1P53063 CTF18YMR078C 2226 nt6.61□□□□□ -1.35
RAI1P53063 TDP1YBR223C 1635 nt6.61□□□□□ -1.35
RAI1P53063 SAL1YNL083W 1485 nt6.6□□□□□ -1.35
RAI1P53063 YDL241WYDL241W 372 nt6.6□□□□□ -1.35
RAI1P53063 MPS2YGL075C 1164 nt6.6□□□□□ -1.35
RAI1P53063 HBN1YCL026C-B 582 nt6.6□□□□□ -1.35
RAI1P53063 IES1YFL013C 2079 nt6.6□□□□□ -1.35
RAI1P53063 PAF1YBR279W 1338 nt6.59□□□□□ -1.35
RAI1P53063 SLA2YNL243W 2907 nt6.59□□□□□ -1.35
RAI1P53063 RRP43YCR035C 1185 nt6.59□□□□□ -1.35
RAI1P53063 FPR2YDR519W 408 nt6.59□□□□□ -1.35
RAI1P53063 CPD1YGR247W 720 nt6.59□□□□□ -1.35
RAI1P53063 ARP3YJR065C 1350 nt6.58□□□□□ -1.36
RAI1P53063 YNR014WYNR014W 639 nt6.58□□□□□ -1.36
RAI1P53063 HAL1YPR005C 885 nt6.58□□□□□ -1.36
RAI1P53063 ATP2YJR121W 1536 nt6.58□□□□□ -1.36
RAI1P53063 YDR132CYDR132C 1488 nt6.58□□□□□ -1.36
RAI1P53063 RBS1YDL189W 1374 nt6.57□□□□□ -1.36
RAI1P53063 IRC5YFR038W 2562 nt6.57□□□□□ -1.36
RAI1P53063 MCM21YDR318W 1107 nt6.57□□□□□ -1.36
RAI1P53063 MRPL28YDR462W 444 nt6.57□□□□□ -1.36
RAI1P53063 PCL6YER059W 1263 nt6.57□□□□□ -1.36
RAI1P53063 PAU5YFL020C 369 nt6.57□□□□□ -1.36
RAI1P53063 QCR6YFR033C 444 nt6.57□□□□□ -1.36
RAI1P53063 SER2YGR208W 930 nt6.57□□□□□ -1.36
RAI1P53063 RUF21RUF21 707 nt6.57□□□□□ -1.36
RAI1P53063 NTG2YOL043C 1143 nt6.57□□□□□ -1.36
RAI1P53063 TFC6YDR362C 2019 nt6.57□□□□□ -1.36
RAI1P53063 PPT1YGR123C 1542 nt6.56□□□□□ -1.36
RAI1P53063 IMG2YCR071C 441 nt6.56□□□□□ -1.36
RAI1P53063 TGA1tA(UGC)A 73 nt6.56□□□□□ -1.36
RAI1P53063 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt6.56□□□□□ -1.36
RAI1P53063 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt6.56□□□□□ -1.36
RAI1P53063 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt6.56□□□□□ -1.36
RAI1P53063 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt6.56□□□□□ -1.36
RAI1P53063 SUR7YML052W 909 nt6.56□□□□□ -1.36
RAI1P53063 YGP1YNL160W 1065 nt6.56□□□□□ -1.36
RAI1P53063 MSS116YDR194C 1995 nt6.56□□□□□ -1.36
RAI1P53063 MST1YKL194C 1389 nt6.56□□□□□ -1.36
RAI1P53063 NEM1YHR004C 1341 nt6.55□□□□□ -1.36
RAI1P53063 SRG1SRG1 551 nt6.55□□□□□ -1.36
RAI1P53063 LSM6YDR378C 261 nt6.55□□□□□ -1.36
RAI1P53063 YER156CYER156C 1017 nt6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 65.2 ms