Protein–RNA interactions for Protein: P40969

CEP3, Centromere DNA-binding protein complex CBF3 subunit B, yeastyeast

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CEP3P40969 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt7.34□□□□□ -1.23
CEP3P40969 SUF16tG(GCC)C 71 nt7.34□□□□□ -1.23
CEP3P40969 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt7.34□□□□□ -1.23
CEP3P40969 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt7.34□□□□□ -1.23
CEP3P40969 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt7.34□□□□□ -1.23
CEP3P40969 SUF20tG(GCC)F1 71 nt7.34□□□□□ -1.23
CEP3P40969 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt7.34□□□□□ -1.23
CEP3P40969 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt7.34□□□□□ -1.23
CEP3P40969 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt7.34□□□□□ -1.23
CEP3P40969 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt7.34□□□□□ -1.23
CEP3P40969 SUF23tG(GCC)J2 71 nt7.34□□□□□ -1.23
CEP3P40969 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt7.34□□□□□ -1.23
CEP3P40969 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt7.34□□□□□ -1.23
CEP3P40969 SUF17tG(GCC)O2 71 nt7.34□□□□□ -1.23
CEP3P40969 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt7.34□□□□□ -1.23
CEP3P40969 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt7.34□□□□□ -1.23
CEP3P40969 PEX13YLR191W 1161 nt7.34□□□□□ -1.23
CEP3P40969 NFS1YCL017C 1494 nt7.34□□□□□ -1.23
CEP3P40969 TKL2YBR117C 2046 nt7.34□□□□□ -1.24
CEP3P40969 CEF1YMR213W 1773 nt7.33□□□□□ -1.24
CEP3P40969 PMT3YOR321W 2262 nt7.33□□□□□ -1.24
CEP3P40969 MMS21YEL019C 804 nt7.33□□□□□ -1.24
CEP3P40969 YBL081WYBL081W 1107 nt7.33□□□□□ -1.24
CEP3P40969 AIM41YOR215C 558 nt7.33□□□□□ -1.24
CEP3P40969 YOR343CYOR343C 327 nt7.33□□□□□ -1.24
CEP3P40969 MPE1YKL059C 1326 nt7.32□□□□□ -1.24
CEP3P40969 ORM1YGR038W 669 nt7.31□□□□□ -1.24
CEP3P40969 YSC83YHR017W 1158 nt7.31□□□□□ -1.24
CEP3P40969 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.31□□□□□ -1.24
CEP3P40969 CIS3YJL158C 684 nt7.31□□□□□ -1.24
CEP3P40969 SPG5YMR191W 1122 nt7.31□□□□□ -1.24
CEP3P40969 MOD5YOR274W 1287 nt7.31□□□□□ -1.24
CEP3P40969 BRN1YBL097W 2265 nt7.31□□□□□ -1.24
CEP3P40969 GDH1YOR375C 1365 nt7.31□□□□□ -1.24
CEP3P40969 PLB2YMR006C 2121 nt7.3□□□□□ -1.24
CEP3P40969 snR78snR78 87 nt7.3□□□□□ -1.24
CEP3P40969 FBA1YKL060C 1080 nt7.3□□□□□ -1.24
CEP3P40969 SNU71YGR013W 1863 nt7.3□□□□□ -1.24
CEP3P40969 UTR2YEL040W 1404 nt7.29□□□□□ -1.24
CEP3P40969 YDR476CYDR476C 675 nt7.29□□□□□ -1.24
CEP3P40969 ADE1YAR015W 921 nt7.29□□□□□ -1.24
CEP3P40969 RAP1YNL216W 2484 nt7.29□□□□□ -1.24
CEP3P40969 VBA5YKR105C 1749 nt7.29□□□□□ -1.24
CEP3P40969 YMR034CYMR034C 1305 nt7.28□□□□□ -1.24
CEP3P40969 IMA5YJL216C 1746 nt7.28□□□□□ -1.24
CEP3P40969 RRP1YDR087C 837 nt7.28□□□□□ -1.24
CEP3P40969 BIM1YER016W 1035 nt7.28□□□□□ -1.24
CEP3P40969 DOC1YGL240W 753 nt7.28□□□□□ -1.24
CEP3P40969 PTC7YHR076W 1032 nt7.28□□□□□ -1.24
CEP3P40969 YOR268CYOR268C 399 nt7.28□□□□□ -1.24
CEP3P40969 YPQ2YDR352W 954 nt7.27□□□□□ -1.25
CEP3P40969 PRE2YPR103W 864 nt7.27□□□□□ -1.25
CEP3P40969 RIO1YOR119C 1455 nt7.27□□□□□ -1.25
CEP3P40969 STT3YGL022W 2157 nt7.27□□□□□ -1.25
CEP3P40969 CCC2YDR270W 3015 nt7.27□□□□□ -1.25
CEP3P40969 TUB1YML085C 1344 nt7.27□□□□□ -1.25
CEP3P40969 YHR020WYHR020W 2067 nt7.26□□□□□ -1.25
CEP3P40969 HEL1YKR017C 1656 nt7.26□□□□□ -1.25
CEP3P40969 THI2YBR240C 1353 nt7.26□□□□□ -1.25
CEP3P40969 EDE1YBL047C 4146 nt7.26□□□□□ -1.25
CEP3P40969 NTG2YOL043C 1143 nt7.26□□□□□ -1.25
CEP3P40969 TPO3YPR156C 1869 nt7.26□□□□□ -1.25
CEP3P40969 CRP1YHR146W 1398 nt7.25□□□□□ -1.25
CEP3P40969 MRPS28YDR337W 861 nt7.25□□□□□ -1.25
CEP3P40969 YEL074WYEL074W 339 nt7.25□□□□□ -1.25
CEP3P40969 HEM2YGL040C 1029 nt7.25□□□□□ -1.25
CEP3P40969 YBR113WYBR113W 483 nt7.25□□□□□ -1.25
CEP3P40969 GEF1YJR040W 2340 nt7.24□□□□□ -1.25
CEP3P40969 YER147C-AYER147C-A 411 nt7.24□□□□□ -1.25
CEP3P40969 YIP4YGL198W 708 nt7.24□□□□□ -1.25
CEP3P40969 URE2YNL229C 1065 nt7.24□□□□□ -1.25
CEP3P40969 GET4YOR164C 939 nt7.24□□□□□ -1.25
CEP3P40969 YPR130CYPR130C 408 nt7.24□□□□□ -1.25
CEP3P40969 PPM2YOL141W 2088 nt7.24□□□□□ -1.25
CEP3P40969 TOS1YBR162C 1368 nt7.23□□□□□ -1.25
CEP3P40969 GPI11YDR302W 660 nt7.23□□□□□ -1.25
CEP3P40969 RPP1YHR062C 882 nt7.23□□□□□ -1.25
CEP3P40969 ATG36YJL185C 882 nt7.23□□□□□ -1.25
CEP3P40969 DUS4YLR405W 1104 nt7.23□□□□□ -1.25
CEP3P40969 SLD7YOR060C 774 nt7.23□□□□□ -1.25
CEP3P40969 HXT2YMR011W 1626 nt7.23□□□□□ -1.25
CEP3P40969 YHP1YDR451C 1062 nt7.22□□□□□ -1.25
CEP3P40969 SQT1YIR012W 1296 nt7.22□□□□□ -1.25
CEP3P40969 PET20YPL159C 762 nt7.22□□□□□ -1.25
CEP3P40969 ATG23YLR431C 1362 nt7.21□□□□□ -1.25
CEP3P40969 PPM1YDR435C 987 nt7.21□□□□□ -1.26
CEP3P40969 MIA40YKL195W 1212 nt7.21□□□□□ -1.26
CEP3P40969 TAF4YMR005W 1167 nt7.21□□□□□ -1.26
CEP3P40969 GAT1YFL021W 1533 nt7.21□□□□□ -1.26
CEP3P40969 MSY1YPL097W 1479 nt7.2□□□□□ -1.26
CEP3P40969 MRPL24YMR193W 777 nt7.2□□□□□ -1.26
CEP3P40969 YNR005CYNR005C 405 nt7.2□□□□□ -1.26
CEP3P40969 PCL10YGL134W 1302 nt7.2□□□□□ -1.26
CEP3P40969 MFG1YDL233W 1377 nt7.2□□□□□ -1.26
CEP3P40969 KEL1YHR158C 3495 nt7.2□□□□□ -1.26
CEP3P40969 YHR140WYHR140W 720 nt7.19□□□□□ -1.26
CEP3P40969 YLR123CYLR123C 330 nt7.19□□□□□ -1.26
CEP3P40969 DSE3YOR264W 1293 nt7.19□□□□□ -1.26
CEP3P40969 SGE1YPR198W 1632 nt7.19□□□□□ -1.26
CEP3P40969 SGV1YPR161C 1974 nt7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 41.4 ms