Protein–RNA interactions for Protein: P39944

UBP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, yeastyeast

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP5P39944 MRPL35YDR322W 1104 nt7.34□□□□□ -1.23
UBP5P39944 LIA1YJR070C 978 nt7.34□□□□□ -1.23
UBP5P39944 YLL056CYLL056C 897 nt7.34□□□□□ -1.23
UBP5P39944 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt7.34□□□□□ -1.23
UBP5P39944 MRI1YPR118W 1236 nt7.34□□□□□ -1.23
UBP5P39944 VBA5YKR105C 1749 nt7.34□□□□□ -1.23
UBP5P39944 YBR241CYBR241C 1467 nt7.34□□□□□ -1.23
UBP5P39944 NUF2YOL069W 1356 nt7.33□□□□□ -1.24
UBP5P39944 PMA2YPL036W 2844 nt7.33□□□□□ -1.24
UBP5P39944 DOT1YDR440W 1749 nt7.33□□□□□ -1.24
UBP5P39944 SUA5YGL169W 1281 nt7.33□□□□□ -1.24
UBP5P39944 PAC10YGR078C 600 nt7.33□□□□□ -1.24
UBP5P39944 RSA3YLR221C 663 nt7.33□□□□□ -1.24
UBP5P39944 ARC35YNR035C 1029 nt7.33□□□□□ -1.24
UBP5P39944 APM1YPL259C 1428 nt7.33□□□□□ -1.24
UBP5P39944 SSC1YJR045C 1965 nt7.33□□□□□ -1.24
UBP5P39944 SNU66YOR308C 1764 nt7.33□□□□□ -1.24
UBP5P39944 CCT3YJL014W 1605 nt7.32□□□□□ -1.24
UBP5P39944 PPH21YDL134C 1110 nt7.32□□□□□ -1.24
UBP5P39944 YDL158CYDL158C 309 nt7.32□□□□□ -1.24
UBP5P39944 RPL2BYIL018W 765 nt7.32□□□□□ -1.24
UBP5P39944 GPH1YPR160W 2709 nt7.32□□□□□ -1.24
UBP5P39944 COX15YER141W 1461 nt7.31□□□□□ -1.24
UBP5P39944 HED1YDR014W-A 489 nt7.31□□□□□ -1.24
UBP5P39944 YHR054CYHR054C 1065 nt7.31□□□□□ -1.24
UBP5P39944 AIM20YIL158W 615 nt7.31□□□□□ -1.24
UBP5P39944 YMR147WYMR147W 672 nt7.31□□□□□ -1.24
UBP5P39944 AME1YBR211C 975 nt7.31□□□□□ -1.24
UBP5P39944 CRH1YGR189C 1524 nt7.31□□□□□ -1.24
UBP5P39944 PUS9YDL036C 1389 nt7.31□□□□□ -1.24
UBP5P39944 FMP40YPL222W 2067 nt7.31□□□□□ -1.24
UBP5P39944 MCH2YKL221W 1422 nt7.3□□□□□ -1.24
UBP5P39944 GGC1YDL198C 903 nt7.3□□□□□ -1.24
UBP5P39944 YNL092WYNL092W 1203 nt7.3□□□□□ -1.24
UBP5P39944 GSH1YJL101C 2037 nt7.3□□□□□ -1.24
UBP5P39944 SRF1YDL133W 1314 nt7.29□□□□□ -1.24
UBP5P39944 OPI7YDR360W 435 nt7.29□□□□□ -1.24
UBP5P39944 LSC1YOR142W 990 nt7.29□□□□□ -1.24
UBP5P39944 SLA2YNL243W 2907 nt7.29□□□□□ -1.24
UBP5P39944 CYB2YML054C 1776 nt7.28□□□□□ -1.24
UBP5P39944 YKL102CYKL102C 306 nt7.28□□□□□ -1.24
UBP5P39944 RDN5-2RDN5-2 119 nt7.28□□□□□ -1.24
UBP5P39944 RDN5-3RDN5-3 119 nt7.28□□□□□ -1.24
UBP5P39944 RDN5-4RDN5-4 119 nt7.28□□□□□ -1.24
UBP5P39944 YLR184WYLR184W 348 nt7.28□□□□□ -1.24
UBP5P39944 RDN5-5RDN5-5 119 nt7.28□□□□□ -1.24
UBP5P39944 MRPL19YNL185C 477 nt7.28□□□□□ -1.24
UBP5P39944 SCO2YBR024W 906 nt7.28□□□□□ -1.24
UBP5P39944 ASR1YPR093C 867 nt7.28□□□□□ -1.24
UBP5P39944 HBN1YCL026C-B 582 nt7.28□□□□□ -1.24
UBP5P39944 SEC23YPR181C 2307 nt7.27□□□□□ -1.25
UBP5P39944 YDL177CYDL177C 513 nt7.27□□□□□ -1.25
UBP5P39944 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.27□□□□□ -1.25
UBP5P39944 NTG1YAL015C 1200 nt7.27□□□□□ -1.25
UBP5P39944 ECM9YKR004C 1134 nt7.27□□□□□ -1.25
UBP5P39944 PRM4YPL156C 855 nt7.27□□□□□ -1.25
UBP5P39944 EFM1YHL039W 1758 nt7.27□□□□□ -1.25
UBP5P39944 MAM3YOL060C 2121 nt7.27□□□□□ -1.25
UBP5P39944 FRT1YOR324C 1809 nt7.27□□□□□ -1.25
UBP5P39944 YKL077WYKL077W 1179 nt7.26□□□□□ -1.25
UBP5P39944 ATG17YLR423C 1254 nt7.26□□□□□ -1.25
UBP5P39944 IRC11YOR013W 471 nt7.26□□□□□ -1.25
UBP5P39944 IRC14YOR135C 342 nt7.26□□□□□ -1.25
UBP5P39944 ECM10YEL030W 1935 nt7.26□□□□□ -1.25
UBP5P39944 MIP1YOR330C 3765 nt7.25□□□□□ -1.25
UBP5P39944 HEM2YGL040C 1029 nt7.25□□□□□ -1.25
UBP5P39944 YKL153WYKL153W 510 nt7.25□□□□□ -1.25
UBP5P39944 PUS5YLR165C 765 nt7.25□□□□□ -1.25
UBP5P39944 SCS22YBL091C-A 528 nt7.25□□□□□ -1.25
UBP5P39944 OSW1YOR255W 837 nt7.25□□□□□ -1.25
UBP5P39944 YPL136WYPL136W 369 nt7.25□□□□□ -1.25
UBP5P39944 HAS1YMR290C 1518 nt7.25□□□□□ -1.25
UBP5P39944 KIN1YDR122W 3195 nt7.24□□□□□ -1.25
UBP5P39944 YSC83YHR017W 1158 nt7.24□□□□□ -1.25
UBP5P39944 TAF4YMR005W 1167 nt7.24□□□□□ -1.25
UBP5P39944 YOL107WYOL107W 1029 nt7.24□□□□□ -1.25
UBP5P39944 YHR020WYHR020W 2067 nt7.24□□□□□ -1.25
UBP5P39944 STT3YGL022W 2157 nt7.23□□□□□ -1.25
UBP5P39944 TAH11YJR046W 1815 nt7.23□□□□□ -1.25
UBP5P39944 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt7.23□□□□□ -1.25
UBP5P39944 LCL3YGL085W 825 nt7.23□□□□□ -1.25
UBP5P39944 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt7.23□□□□□ -1.25
UBP5P39944 YJR056CYJR056C 711 nt7.23□□□□□ -1.25
UBP5P39944 CSI1YMR025W 888 nt7.23□□□□□ -1.25
UBP5P39944 YNL303WYNL303W 348 nt7.23□□□□□ -1.25
UBP5P39944 YNR014WYNR014W 639 nt7.23□□□□□ -1.25
UBP5P39944 MRPL23YOR150W 492 nt7.23□□□□□ -1.25
UBP5P39944 PPS1YBR276C 2424 nt7.22□□□□□ -1.25
UBP5P39944 YLL066CYLL066C 3618 nt7.22□□□□□ -1.25
UBP5P39944 DYS1YHR068W 1164 nt7.22□□□□□ -1.25
UBP5P39944 MDH1YKL085W 1005 nt7.22□□□□□ -1.25
UBP5P39944 TIF34YMR146C 1044 nt7.22□□□□□ -1.25
UBP5P39944 MCT1YOR221C 1083 nt7.22□□□□□ -1.25
UBP5P39944 ILV6YCL009C 930 nt7.22□□□□□ -1.25
UBP5P39944 YMR034CYMR034C 1305 nt7.22□□□□□ -1.25
UBP5P39944 COQ1YBR003W 1422 nt7.21□□□□□ -1.25
UBP5P39944 DID2YKR035W-A 615 nt7.21□□□□□ -1.26
UBP5P39944 SWP1YMR149W 861 nt7.21□□□□□ -1.26
UBP5P39944 YBR113WYBR113W 483 nt7.21□□□□□ -1.26
UBP5P39944 SLX1YBR228W 915 nt7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.6 ms