Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 AFG1YEL052W 1530 nt5.7□□□□□ -1.5
AVT5P38176 YPR204WYPR204W 3099 nt5.7□□□□□ -1.5
AVT5P38176 FHN1YGR131W 525 nt5.7□□□□□ -1.5
AVT5P38176 OAC1YKL120W 975 nt5.7□□□□□ -1.5
AVT5P38176 DUS4YLR405W 1104 nt5.7□□□□□ -1.5
AVT5P38176 HAS1YMR290C 1518 nt5.69□□□□□ -1.5
AVT5P38176 RBS1YDL189W 1374 nt5.69□□□□□ -1.5
AVT5P38176 SNU71YGR013W 1863 nt5.69□□□□□ -1.5
AVT5P38176 SHO1YER118C 1104 nt5.69□□□□□ -1.5
AVT5P38176 DPH5YLR172C 903 nt5.69□□□□□ -1.5
AVT5P38176 YOR343CYOR343C 327 nt5.69□□□□□ -1.5
AVT5P38176 NMT1YLR195C 1368 nt5.68□□□□□ -1.5
AVT5P38176 MRC1YCL061C 3291 nt5.68□□□□□ -1.5
AVT5P38176 MTC5YDR128W 3447 nt5.68□□□□□ -1.5
AVT5P38176 COX9YDL067C 180 nt5.68□□□□□ -1.5
AVT5P38176 GPI11YDR302W 660 nt5.68□□□□□ -1.5
AVT5P38176 YIL077CYIL077C 963 nt5.68□□□□□ -1.5
AVT5P38176 TOM20YGR082W 552 nt5.67□□□□□ -1.5
AVT5P38176 YML122CYML122C 381 nt5.67□□□□□ -1.5
AVT5P38176 COX5AYNL052W 462 nt5.67□□□□□ -1.5
AVT5P38176 DPM1YPR183W 804 nt5.67□□□□□ -1.5
AVT5P38176 PAC2YER007W 1557 nt5.67□□□□□ -1.5
AVT5P38176 YPL247CYPL247C 1572 nt5.67□□□□□ -1.5
AVT5P38176 YPQ2YDR352W 954 nt5.66□□□□□ -1.5
AVT5P38176 THR1YHR025W 1074 nt5.66□□□□□ -1.5
AVT5P38176 GCN3YKR026C 918 nt5.66□□□□□ -1.5
AVT5P38176 ERG27YLR100W 1044 nt5.66□□□□□ -1.5
AVT5P38176 YNL165WYNL165W 1221 nt5.66□□□□□ -1.5
AVT5P38176 YBR226CYBR226C 411 nt5.66□□□□□ -1.5
AVT5P38176 GFA1YKL104C 2154 nt5.66□□□□□ -1.5
AVT5P38176 EHD3YDR036C 1503 nt5.65□□□□□ -1.5
AVT5P38176 DOC1YGL240W 753 nt5.65□□□□□ -1.5
AVT5P38176 YDR514CYDR514C 1452 nt5.64□□□□□ -1.51
AVT5P38176 MSG5YNL053W 1470 nt5.64□□□□□ -1.51
AVT5P38176 CTA1YDR256C 1548 nt5.64□□□□□ -1.51
AVT5P38176 CDC16YKL022C 2523 nt5.64□□□□□ -1.51
AVT5P38176 RTC4YNL254C 1206 nt5.64□□□□□ -1.51
AVT5P38176 STB5YHR178W 2232 nt5.64□□□□□ -1.51
AVT5P38176 GPA1YHR005C 1419 nt5.64□□□□□ -1.51
AVT5P38176 DMC1YER179W 1005 nt5.63□□□□□ -1.51
AVT5P38176 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt5.63□□□□□ -1.51
AVT5P38176 RRP46YGR095C 672 nt5.63□□□□□ -1.51
AVT5P38176 HSP150YJL159W 1242 nt5.63□□□□□ -1.51
AVT5P38176 YLR358CYLR358C 564 nt5.63□□□□□ -1.51
AVT5P38176 SAC6YDR129C 1929 nt5.63□□□□□ -1.51
AVT5P38176 TUB1YML085C 1344 nt5.63□□□□□ -1.51
AVT5P38176 AIM3YBR108W 2844 nt5.63□□□□□ -1.51
AVT5P38176 BZZ1YHR114W 1902 nt5.62□□□□□ -1.51
AVT5P38176 SUF5tG(CCC)O 72 nt5.62□□□□□ -1.51
AVT5P38176 HIS1YER055C 894 nt5.62□□□□□ -1.51
AVT5P38176 YNL017CYNL017C 339 nt5.62□□□□□ -1.51
AVT5P38176 TOS6YNL300W 309 nt5.62□□□□□ -1.51
AVT5P38176 NFS1YCL017C 1494 nt5.62□□□□□ -1.51
AVT5P38176 YEL020CYEL020C 1683 nt5.62□□□□□ -1.51
AVT5P38176 QNS1YHR074W 2145 nt5.62□□□□□ -1.51
AVT5P38176 LSG1YGL099W 1923 nt5.61□□□□□ -1.51
AVT5P38176 MPE1YKL059C 1326 nt5.61□□□□□ -1.51
AVT5P38176 YKR032WYKR032W 315 nt5.61□□□□□ -1.51
AVT5P38176 PYK2YOR347C 1521 nt5.6□□□□□ -1.51
AVT5P38176 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt5.6□□□□□ -1.51
AVT5P38176 PSR2YLR019W 1194 nt5.6□□□□□ -1.51
AVT5P38176 BUD20YLR074C 501 nt5.6□□□□□ -1.51
AVT5P38176 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt5.6□□□□□ -1.51
AVT5P38176 ATP23YNR020C 813 nt5.6□□□□□ -1.51
AVT5P38176 YDR415CYDR415C 1125 nt5.59□□□□□ -1.51
AVT5P38176 MRPS12YNR036C 462 nt5.59□□□□□ -1.51
AVT5P38176 RPS28AYOR167C 204 nt5.59□□□□□ -1.51
AVT5P38176 SKN1YGR143W 2316 nt5.59□□□□□ -1.51
AVT5P38176 MCM6YGL201C 3054 nt5.59□□□□□ -1.52
AVT5P38176 DML1YMR211W 1428 nt5.58□□□□□ -1.52
AVT5P38176 LAT1YNL071W 1449 nt5.58□□□□□ -1.52
AVT5P38176 HPT1YDR399W 666 nt5.58□□□□□ -1.52
AVT5P38176 PRY3YJL078C 2646 nt5.58□□□□□ -1.52
AVT5P38176 POX1YGL205W 2247 nt5.58□□□□□ -1.52
AVT5P38176 IVY1YDR229W 1362 nt5.57□□□□□ -1.52
AVT5P38176 PAT1YCR077C 2391 nt5.57□□□□□ -1.52
AVT5P38176 BUD9YGR041W 1644 nt5.57□□□□□ -1.52
AVT5P38176 YCR049CYCR049C 447 nt5.57□□□□□ -1.52
AVT5P38176 PIH1YHR034C 1035 nt5.57□□□□□ -1.52
AVT5P38176 ICT1YLR099C 1185 nt5.57□□□□□ -1.52
AVT5P38176 MKK1YOR231W 1527 nt5.57□□□□□ -1.52
AVT5P38176 CRP1YHR146W 1398 nt5.56□□□□□ -1.52
AVT5P38176 MOD5YOR274W 1287 nt5.56□□□□□ -1.52
AVT5P38176 GYP8YFL027C 1494 nt5.56□□□□□ -1.52
AVT5P38176 PMT3YOR321W 2262 nt5.55□□□□□ -1.52
AVT5P38176 GDA1YEL042W 1557 nt5.55□□□□□ -1.52
AVT5P38176 REC114YMR133W 1287 nt5.55□□□□□ -1.52
AVT5P38176 PTH2YBL057C 627 nt5.55□□□□□ -1.52
AVT5P38176 GET4YOR164C 939 nt5.55□□□□□ -1.52
AVT5P38176 BNS1YGR230W 414 nt5.54□□□□□ -1.52
AVT5P38176 UTR2YEL040W 1404 nt5.54□□□□□ -1.52
AVT5P38176 PLB2YMR006C 2121 nt5.54□□□□□ -1.52
AVT5P38176 EDC2YER035W 438 nt5.53□□□□□ -1.52
AVT5P38176 YPT1YFL038C 621 nt5.53□□□□□ -1.52
AVT5P38176 YML133CYML133C 4125 nt5.53□□□□□ -1.52
AVT5P38176 ELP3YPL086C 1674 nt5.53□□□□□ -1.52
AVT5P38176 RGT2YDL138W 2292 nt5.53□□□□□ -1.52
AVT5P38176 HEM1YDR232W 1647 nt5.52□□□□□ -1.53
AVT5P38176 CLB2YPR119W 1476 nt5.52□□□□□ -1.53
AVT5P38176 PTK2YJR059W 2457 nt5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27 ms