Protein–RNA interactions for Protein: O13527

TY1B-A, Truncated transposon Ty1-A Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-AO13527 PHO85YPL031C 918 nt7.46□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 OSW2YLR054C 2175 nt7.46□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 CDC23YHR166C 1881 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 YKL102CYKL102C 306 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 SWD1YAR003W 1281 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 AVO2YMR068W 1281 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 NSE5YML023C 1671 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 DLD1YDL174C 1764 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 YFR006WYFR006W 1608 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 RRP9YPR137W 1722 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 MKK1YOR231W 1527 nt7.43□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 YDR387CYDR387C 1668 nt7.43□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 CAN1YEL063C 1773 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 HED1YDR014W-A 489 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 CUE4YML101C 354 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 YMR122CYMR122C 375 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 RNH201YNL072W 924 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 TMA46YOR091W 1038 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 JIP4YDR475C 2631 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 CLN1YMR199W 1641 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 SEC24YIL109C 2781 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 SHO1YER118C 1104 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 TDH2YJR009C 999 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 SPG5YMR191W 1122 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 YNL092WYNL092W 1203 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 SRF1YDL133W 1314 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 NUP57YGR119C 1626 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 SLX5YDL013W 1860 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt7.4□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 MHT1YLL062C 975 nt7.4□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 QRI5YLR204W 336 nt7.4□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 RPL31BYLR406C 342 nt7.4□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 YLR463CYLR463C 552 nt7.4□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 MIX17YMR002W 471 nt7.4□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 YBR027CYBR027C 333 nt7.4□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 SEC62YPL094C 825 nt7.4□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 YMR034CYMR034C 1305 nt7.4□□□□□ -1.22
TY1B-AO13527 HXT15YDL245C 1704 nt7.4□□□□□ -1.23
TY1B-AO13527 HXT16YJR158W 1704 nt7.4□□□□□ -1.23
TY1B-AO13527 NMT1YLR195C 1368 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1B-AO13527 FZF1YGL254W 900 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1B-AO13527 HXT2YMR011W 1626 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1B-AO13527 CDC1YDR182W 1476 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1B-AO13527 SCS7YMR272C 1155 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1B-AO13527 FSF1YOR271C 984 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1B-AO13527 IRC5YFR038W 2562 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1B-AO13527 EXG2YDR261C 1689 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1B-AO13527 YHK8YHR048W 1545 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1B-AO13527 UIP5YKR044W 1332 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1B-AO13527 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1B-AO13527 TPK1YJL164C 1194 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1B-AO13527 YAR064WYAR064W 300 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1B-AO13527 TSR2YLR435W 618 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1B-AO13527 RQC1YDR333C 2172 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1B-AO13527 YRB2YIL063C 984 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1B-AO13527 RFS1YBR052C 633 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1B-AO13527 YBR226CYBR226C 411 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1B-AO13527 MSG5YNL053W 1470 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1B-AO13527 CIT3YPR001W 1461 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1B-AO13527 TOD6YBL054W 1578 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1B-AO13527 YDR187CYDR187C 519 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1B-AO13527 YKL077WYKL077W 1179 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1B-AO13527 TAE1YBR261C 699 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1B-AO13527 FLC2YAL053W 2352 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1B-AO13527 FCY2YER056C 1602 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1B-AO13527 TKL2YBR117C 2046 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1B-AO13527 VMA3YEL027W 483 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1B-AO13527 HXK2YGL253W 1461 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1B-AO13527 TDP1YBR223C 1635 nt7.34□□□□□ -1.24
TY1B-AO13527 ZWF1YNL241C 1518 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1B-AO13527 EFT2YDR385W 2529 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1B-AO13527 EFT1YOR133W 2529 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1B-AO13527 CUP2YGL166W 678 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1B-AO13527 RIX7YLL034C 2514 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1B-AO13527 DOT1YDR440W 1749 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1B-AO13527 POP1YNL221C 2628 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1B-AO13527 NOG2YNR053C 1461 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1B-AO13527 PPM2YOL141W 2088 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1B-AO13527 ATG36YJL185C 882 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1B-AO13527 YKR045CYKR045C 552 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1B-AO13527 MRPL23YOR150W 492 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1B-AO13527 SEC23YPR181C 2307 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1B-AO13527 URH1YDR400W 1023 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1B-AO13527 YML018CYML018C 1182 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1B-AO13527 COX10YPL172C 1389 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1B-AO13527 POX1YGL205W 2247 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1B-AO13527 CDC16YKL022C 2523 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1B-AO13527 YDL177CYDL177C 513 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1B-AO13527 CBR1YIL043C 855 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1B-AO13527 YMR295CYMR295C 594 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1B-AO13527 TUF1YOR187W 1314 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1B-AO13527 AVT4YNL101W 2142 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1B-AO13527 GPD2YOL059W 1323 nt7.27□□□□□ -1.24
TY1B-AO13527 LOT6YLR011W 576 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1B-AO13527 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1B-AO13527 LAG2YOL025W 1983 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1B-AO13527 YHR020WYHR020W 2067 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1B-AO13527 PRY3YJL078C 2646 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1B-AO13527 YCR041WYCR041W 333 nt7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 145.3 ms