Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRMT12Q53H54 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRMT12Q53H54 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms