Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ71

PITPNM3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM3Q9BZ71 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PITPNM3Q9BZ71 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PITPNM3Q9BZ71 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PITPNM3Q9BZ71 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PITPNM3Q9BZ71 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PITPNM3Q9BZ71 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PITPNM3Q9BZ71 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PITPNM3Q9BZ71 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PITPNM3Q9BZ71 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms