Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf8Q99PV0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf8Q99PV0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prpf8Q99PV0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf8Q99PV0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf8Q99PV0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf8Q99PV0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prpf8Q99PV0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf8Q99PV0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf8Q99PV0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf8Q99PV0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf8Q99PV0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf8Q99PV0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf8Q99PV0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prpf8Q99PV0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf8Q99PV0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf8Q99PV0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf8Q99PV0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prpf8Q99PV0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf8Q99PV0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf8Q99PV0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf8Q99PV0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf8Q99PV0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf8Q99PV0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf8Q99PV0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prpf8Q99PV0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf8Q99PV0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf8Q99PV0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf8Q99PV0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf8Q99PV0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf8Q99PV0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf8Q99PV0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf8Q99PV0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf8Q99PV0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf8Q99PV0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf8Q99PV0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf8Q99PV0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf8Q99PV0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prpf8Q99PV0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prpf8Q99PV0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf8Q99PV0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf8Q99PV0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.8 ms