RNAct
Search
Pairwise
Browse
Proteins
RNAs
Download
About
Search
Protein–RNA interactions for Protein: Q99252
ECM3, Protein ECM3, yeast
Predictions only
Length
613 aa
.
Download Table
Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
ECM3
Q99252
YPL071C
YPL071C
471 nt
7.25
□□□□□ -1.25
ECM3
Q99252
ECM10
YEL030W
1935 nt
7.25
□□□□□ -1.25
ECM3
Q99252
TDP1
YBR223C
1635 nt
7.24
□□□□□ -1.25
ECM3
Q99252
MIX17
YMR002W
471 nt
7.24
□□□□□ -1.25
ECM3
Q99252
YLR173W
YLR173W
1827 nt
7.24
□□□□□ -1.25
ECM3
Q99252
GCD11
YER025W
1584 nt
7.24
□□□□□ -1.25
ECM3
Q99252
ERR1
YOR393W
1314 nt
7.24
□□□□□ -1.25
ECM3
Q99252
ERR2
YPL281C
1314 nt
7.24
□□□□□ -1.25
ECM3
Q99252
HDA1
YNL021W
2121 nt
7.24
□□□□□ -1.25
ECM3
Q99252
SSC1
YJR045C
1965 nt
7.23
□□□□□ -1.25
ECM3
Q99252
HOC1
YJR075W
1191 nt
7.23
□□□□□ -1.25
ECM3
Q99252
ATP10
YLR393W
840 nt
7.23
□□□□□ -1.25
ECM3
Q99252
YMR253C
YMR253C
1245 nt
7.23
□□□□□ -1.25
ECM3
Q99252
NDE1
YMR145C
1683 nt
7.22
□□□□□ -1.25
ECM3
Q99252
NUP49
YGL172W
1419 nt
7.22
□□□□□ -1.25
ECM3
Q99252
GGC1
YDL198C
903 nt
7.22
□□□□□ -1.25
ECM3
Q99252
YGL102C
YGL102C
429 nt
7.22
□□□□□ -1.25
ECM3
Q99252
SNF4
YGL115W
969 nt
7.22
□□□□□ -1.25
ECM3
Q99252
LIA1
YJR070C
978 nt
7.22
□□□□□ -1.25
ECM3
Q99252
SPG5
YMR191W
1122 nt
7.22
□□□□□ -1.25
ECM3
Q99252
ASR1
YPR093C
867 nt
7.22
□□□□□ -1.25
ECM3
Q99252
PZF1
YPR186C
1290 nt
7.22
□□□□□ -1.25
ECM3
Q99252
NUP84
YDL116W
2181 nt
7.22
□□□□□ -1.25
ECM3
Q99252
ICP55
YER078C
1536 nt
7.22
□□□□□ -1.25
ECM3
Q99252
MSC3
YLR219W
2187 nt
7.21
□□□□□ -1.26
ECM3
Q99252
YCR041W
YCR041W
333 nt
7.21
□□□□□ -1.26
ECM3
Q99252
COX16
YJL003W
357 nt
7.21
□□□□□ -1.26
ECM3
Q99252
YPL277C
YPL277C
1464 nt
7.21
□□□□□ -1.26
ECM3
Q99252
CTF3
YLR381W
2202 nt
7.21
□□□□□ -1.26
ECM3
Q99252
VBA5
YKR105C
1749 nt
7.21
□□□□□ -1.26
ECM3
Q99252
FCY22
YER060W-A
1593 nt
7.2
□□□□□ -1.26
ECM3
Q99252
PTC7
YHR076W
1032 nt
7.2
□□□□□ -1.26
ECM3
Q99252
PRI1
YIR008C
1230 nt
7.2
□□□□□ -1.26
ECM3
Q99252
YIR018C-A
YIR018C-A
138 nt
7.2
□□□□□ -1.26
ECM3
Q99252
YLL056C
YLL056C
897 nt
7.2
□□□□□ -1.26
ECM3
Q99252
SMX3
YPR182W
261 nt
7.2
□□□□□ -1.26
ECM3
Q99252
FMP40
YPL222W
2067 nt
7.2
□□□□□ -1.26
ECM3
Q99252
YLR112W
YLR112W
420 nt
7.19
□□□□□ -1.26
ECM3
Q99252
RPL31B
YLR406C
342 nt
7.19
□□□□□ -1.26
ECM3
Q99252
FCP1
YMR277W
2199 nt
7.19
□□□□□ -1.26
ECM3
Q99252
CRH1
YGR189C
1524 nt
7.18
□□□□□ -1.26
ECM3
Q99252
GPD1
YDL022W
1176 nt
7.18
□□□□□ -1.26
ECM3
Q99252
MRPS28
YDR337W
861 nt
7.18
□□□□□ -1.26
ECM3
Q99252
POB3
YML069W
1659 nt
7.18
□□□□□ -1.26
ECM3
Q99252
MRPL35
YDR322W
1104 nt
7.17
□□□□□ -1.26
ECM3
Q99252
RPL2B
YIL018W
765 nt
7.17
□□□□□ -1.26
ECM3
Q99252
YOR012W
YOR012W
414 nt
7.17
□□□□□ -1.26
ECM3
Q99252
SNT309
YPR101W
528 nt
7.17
□□□□□ -1.26
ECM3
Q99252
CEM1
YER061C
1329 nt
7.17
□□□□□ -1.26
ECM3
Q99252
AST1
YBL069W
1290 nt
7.16
□□□□□ -1.26
ECM3
Q99252
MRPL19
YNL185C
477 nt
7.16
□□□□□ -1.26
ECM3
Q99252
SEC62
YPL094C
825 nt
7.15
□□□□□ -1.26
ECM3
Q99252
BNA3
YJL060W
1335 nt
7.15
□□□□□ -1.26
ECM3
Q99252
HOS2
YGL194C
1359 nt
7.14
□□□□□ -1.27
ECM3
Q99252
CBR1
YIL043C
855 nt
7.14
□□□□□ -1.27
ECM3
Q99252
AIM2
YAL049C
741 nt
7.14
□□□□□ -1.27
ECM3
Q99252
LSC1
YOR142W
990 nt
7.14
□□□□□ -1.27
ECM3
Q99252
TUF1
YOR187W
1314 nt
7.14
□□□□□ -1.27
ECM3
Q99252
AMN1
YBR158W
1650 nt
7.13
□□□□□ -1.27
ECM3
Q99252
YHR131C
YHR131C
2553 nt
7.13
□□□□□ -1.27
ECM3
Q99252
MRPL28
YDR462W
444 nt
7.13
□□□□□ -1.27
ECM3
Q99252
LCL3
YGL085W
825 nt
7.13
□□□□□ -1.27
ECM3
Q99252
MAK32
YCR019W
1092 nt
7.12
□□□□□ -1.27
ECM3
Q99252
TRS31
YDR472W
852 nt
7.12
□□□□□ -1.27
ECM3
Q99252
AFG2
YLR397C
2343 nt
7.11
□□□□□ -1.27
ECM3
Q99252
AQR1
YNL065W
1761 nt
7.11
□□□□□ -1.27
ECM3
Q99252
YBR113W
YBR113W
483 nt
7.11
□□□□□ -1.27
ECM3
Q99252
NPL6
YMR091C
1308 nt
7.1
□□□□□ -1.27
ECM3
Q99252
HED1
YDR014W-A
489 nt
7.1
□□□□□ -1.27
ECM3
Q99252
MTR3
YGR158C
753 nt
7.1
□□□□□ -1.27
ECM3
Q99252
ASF1
YJL115W
840 nt
7.1
□□□□□ -1.27
ECM3
Q99252
RFS1
YBR052C
633 nt
7.1
□□□□□ -1.27
ECM3
Q99252
PAC2
YER007W
1557 nt
7.1
□□□□□ -1.27
ECM3
Q99252
YMR034C
YMR034C
1305 nt
7.09
□□□□□ -1.27
ECM3
Q99252
YIL108W
YIL108W
2091 nt
7.09
□□□□□ -1.27
ECM3
Q99252
YKL102C
YKL102C
306 nt
7.09
□□□□□ -1.27
ECM3
Q99252
DOT1
YDR440W
1749 nt
7.09
□□□□□ -1.27
ECM3
Q99252
YSC83
YHR017W
1158 nt
7.08
□□□□□ -1.28
ECM3
Q99252
YKL018C-A
YKL018C-A
300 nt
7.08
□□□□□ -1.28
ECM3
Q99252
YKL077W
YKL077W
1179 nt
7.08
□□□□□ -1.28
ECM3
Q99252
SWD1
YAR003W
1281 nt
7.08
□□□□□ -1.28
ECM3
Q99252
ATO2
YNR002C
849 nt
7.08
□□□□□ -1.28
ECM3
Q99252
ILV6
YCL009C
930 nt
7.08
□□□□□ -1.28
ECM3
Q99252
YKR023W
YKR023W
1593 nt
7.08
□□□□□ -1.28
ECM3
Q99252
UTP6
YDR449C
1323 nt
7.07
□□□□□ -1.28
ECM3
Q99252
SAL1
YNL083W
1485 nt
7.07
□□□□□ -1.28
ECM3
Q99252
ERS1
YCR075C
783 nt
7.07
□□□□□ -1.28
ECM3
Q99252
AIM20
YIL158W
615 nt
7.07
□□□□□ -1.28
ECM3
Q99252
SRY1
YKL218C
981 nt
7.07
□□□□□ -1.28
ECM3
Q99252
YNL092W
YNL092W
1203 nt
7.07
□□□□□ -1.28
ECM3
Q99252
SCO2
YBR024W
906 nt
7.07
□□□□□ -1.28
ECM3
Q99252
EHD3
YDR036C
1503 nt
7.06
□□□□□ -1.28
ECM3
Q99252
CCR4
YAL021C
2514 nt
7.06
□□□□□ -1.28
ECM3
Q99252
YDL177C
YDL177C
513 nt
7.06
□□□□□ -1.28
ECM3
Q99252
PMP3
YDR276C
168 nt
7.06
□□□□□ -1.28
ECM3
Q99252
FMO1
YHR176W
1299 nt
7.06
□□□□□ -1.28
ECM3
Q99252
YIL029W-A
YIL029W-A
372 nt
7.06
□□□□□ -1.28
ECM3
Q99252
TAF9
YMR236W
474 nt
7.06
□□□□□ -1.28
ECM3
Q99252
PAC10
YGR078C
600 nt
7.05
□□□□□ -1.28
ECM3
Q99252
BMT5
YIL096C
1011 nt
7.05
□□□□□ -1.28
First
Previous
12
Next
Last
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 123.5 ms